[1]王红梅,武恩斯,朱玉风.固有无序蛋白质无序区和有序区氨基酸组成偏好性分析[J].江苏农业科学,2014,42(04):38-39.
　Wang Hongmei,et al.Preference analysis of amino acid composition between disorder region and order region of intrinsically disordered protein[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(04):38-39.
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固有无序蛋白质无序区和有序区氨基酸组成偏好性分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第42卷
期数:
2014年04期
页码:
38-39
栏目:
生物技术
出版日期:
2014-04-25

文章信息/Info

Title:
Preference analysis of amino acid composition between disorder region and order region of intrinsically disordered protein
作者:
王红梅1;  武恩斯2;  朱玉风2
1. 德州学院物理与电子信息学院/山东省功能大分子生物物理重点实验室，山东德州 253023；2.山东师范大学，山东济南 250358
Author(s):
Wang Hongmei; et al
关键词:
固有无序蛋白质; 功能位点; 无序区; 序列分析
Keywords:
-
分类号:
Q516
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
以固有无序蛋白质为研究对象，通过CD-HIT对数据进行去冗余处理，然后利用编程软件对数据进行统计而得到新的数据。对所有无序区及有序区的氨基酸含量进行对比，认为氨基酸Val、Ile、Leu、Phe、Trp、Asn、Tyr、His具有形成有序结构的偏好性；氨基酸Pro、Ser、Gln、Asp、Lys具有形成无序结构的偏好性。研究结论有助于进一步挖掘固有无序蛋白质的序列特征，并为固有无序蛋白质的预测提供一些借鉴。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］Uversky V N. Natively unfolded proteins：A point where biology waits for physics［J］. Protein Science，2002，11(4)：739-756.
［2］Dunker A K，Obradovic Z，Romero P，et al. Intrinsic protein disorder in complete genomes［J］. Genome Informatics，2000，11：161-171.
［3］Dunker A K，Oldfield C J，Meng J，et al. The unfoldomics decade：an update on intrinsically disordered proteins［J］. BMC Genomics，2008，9(S2)：12-18
［4］Sickmeier M，Hamilton J A，LeGall T，et al. DisProt：the database of disordered proteins［J］. Nucleic Acids Research，2007，35(S1)：786-793.
［5］Li W，Godzik A.Cd-hit：a fast program for clustering and comparing large sets of protein or nucleotide sequences［J］. Bioinformatics，2006，22(13)：1658-1659.
［6］Li W，Jaroszewski L，Godzik A. Clustering of highly homologous sequences to reduce the size of large protein databases［J］. Bioinformatics，2001，17(3)：282-283.
［7］黄永棋，刘志荣. 天然无序蛋白质：序列-结构-功能的新关系［J］. 物理化学学报2010，26(8)：2061-2072.

相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2013-08-23
基金项目：山东省自然科学基金(编号：ZR2010CQ041)。
作者简介：王红梅(1974—)，女，山东德州人，硕士，副教授，主要从事生物信息学的研究。E-mail：whm_2327@126.com。
更新日期/Last Update: 2014-04-25