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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第46卷

期数:

2018年08期

页码:

22-27

栏目:

生物技术

出版日期:

2018-04-20

文章信息/Info

Title:

Visualized analysis of collinearity between poplar and willow genomes

作者:

徐逸卿;  杜思源;  蒋安纳;  王启昂;  薛倚鹭

南京林业大学信息科学技术学院，江苏南京 210037

Author(s):

Xu Yiqing; et al

关键词:

共线性分析; 共线性可视化; 物种进化; 杨属; 柳属

Keywords:

-

分类号:

Q941⁺.2；S188

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

基因的共线性分析是比较基因组学中的重要研究内容。为了研究杨柳科植物的进化机制，对杨属中的毛果杨和柳属中的簸箕柳进行基因组内和基因组间的共线性分析。在对共线性分析及其作图软件的对比分析后，采用MCScanX对杨树、柳树进行基因组内、基因组间的共线性分析，再利用VGSC针对不同的基因组内和组间共线性关系进行可视化分析，从而推测杨树向柳树进化的过程，为杨柳科植物的进化与起源提供重要的依据。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2017-07-26
基金项目：国家重点研发计划(编号：2016YFD0600101)；国家重点基础研究发展计划(编号：2012CB114505)；南京林业大学大学生创新训练计划(编号：2017NFUSPITP226)。
作者简介：徐逸卿(1981—)，男，江苏南京人，硕士，讲师，主要研究方向为计算机应用、生物信息学。E-mail：yiqingxu@njfu.edu.cn。

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更新日期/Last Update: 2018-04-20