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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第48卷

期数:

2020年第20期

页码:

67-74

栏目:

生物技术

出版日期:

2020-10-20

文章信息/Info

Title:

Analysis of whole genome sequence of Pseudomonas syringae pv. actinidiae biovar 3 strain GX05

作者:

邓博涵¹; 刘丹蕾¹; 陈秋菊¹; 倪培恩¹; 张子蕾¹; 王大鹏¹; 纠松涛¹; 王磊¹; 马超¹; 张才喜¹; 王世平¹

1.上海交通大学农业与生物学院，上海 200240； 2.上海浦蔬农业科技有限公司，上海 200240；
3.浙江省遂昌县农业农村局，浙江遂昌 323300

Author(s):

Deng Bohan; et al

关键词:

丁香假单胞菌猕猴桃致病变种; 猕猴桃细菌性溃疡病; 全基因组测序; 毒力基因; 耐药基因; 致病基因

Keywords:

-

分类号:

S436.634.1⁺9

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv. actinidiae，简称Psa)是引起猕猴桃细菌性溃疡病的病原菌。对从感染溃疡病的东红猕猴桃枝条中分离得到的1株Psa野生株(命名为GX05)进行全基因组测序，获得基因组草图，分析其中毒力基因、耐药基因和致病基因的情况。研究发现，多位点序列分型结果显示GX05为biovar 3，与毒力因子数据库比对，GX05携带99种毒力因子及692个相关毒力基因，同源性和匹配度最高的毒力因子是PvdL和Irp[STBX]1[STBZ]；与综合抗生素抗性基因数据库比对，GX05携带336种耐药基因，与29种抗生素有关；与病原宿主互作数据库比对，不表达导致病原菌致病力减弱的基因数量最多，其中同源性和匹配度最高的是PvdL，此外与增强致病力相关的同源性和匹配度最高的基因是hrcC。通过全基因组测序信息初步分析了1株三型Psa菌株中存在的毒力、耐药及致病基因情况，对深入研究其致病机制和合理用药有重要意义。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2020-01-02
基金项目：猕猴桃根域限制栽培技术研究及示范(编号：MH235)；猕猴桃溃疡病综合防治技术研究与示范(编号：2018-J15)。
作者简介：邓博涵(1995—)，女，湖北荆州人，硕士研究生，研究方向为果树病害的研究。E-mail：bohandeng@163.com。
通信作者：许文平，博士，副研究员，从事果实品质生物学、果实采后生物学等研究。E-mail：wp-xu@sjtu.edu.cn。

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更新日期/Last Update: 2020-11-09