[1]高杨,田灿,姜京京,等.不同地理种群克氏原螯虾形态差异及相关分子标记研究[J].江苏农业科学,2024,52(16):203-213.
 Gao Yang,et al.Morphological differences and related molecular markers of Procambarus clarkii from different geographical populations[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2024,52(16):203-213.
点击复制

不同地理种群克氏原螯虾形态差异及相关分子标记研究()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第52卷
期数:
2024年第16期
页码:
203-213
栏目:
畜牧兽医与水产蚕桑
出版日期:
2024-08-20

文章信息/Info

Title:
Morphological differences and related molecular markers of Procambarus clarkii from different geographical populations
作者:
高杨1田灿3姜京京1杨楠1唐永凯12张成锋2陈焕根4李冰2陈铭2卢泽宇2苏胜彦12朱健12
1.南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡 214081; 2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心/农业农村部稻鱼综合种养生态重点实验室,江苏无锡 214081; 3.上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心,上海 201306; 4.江苏省渔业技术推广中心,江苏南京 210036
Author(s):
Gao Yanget al
关键词:
克氏原螯虾形态差异微卫星标记关联分析
Keywords:
-
分类号:
S968.22+9.12
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为了解我国克氏原螯虾不同地理群体的种属差异,加快克氏原螯虾的育种进程,筛选与目标性状紧密相关位点的基因型进行分子辅助选育,选取安徽巢湖、江西鄱阳湖、山东微山湖、湖南洞庭湖、湖北洪湖、江苏洪泽湖6个地区的克氏原螯虾样品,对全长、体长、体重、头胸甲长、头胸甲宽、腹部长、腹部宽、尾扇长8个形态学指标进行测量,以2个形态参数比进行多元分析;并根据标记位点鉴定出的个体基因型,与测量到的形态指标的差异进行生长性状的关联分析,分析出克氏原螯虾重要的经济性状肌肉重、腹部宽、头胸甲宽等和与之相关的标记位点。聚类分析表明,6个地区的克氏原螯虾分为2个分支,第1分支为巢湖群体和洪湖群体;鄱阳湖群体、微山湖群体、洞庭湖群体和洪泽湖群体构成第2分支。主成分分析结果显示,雌虾的4个主成分累计贡献率达85.10%,其中,第1和第2主成分分别是腹长因子和腹宽因子;雄虾的4个主成分累计贡献率达86.31%,第1和第2主成分分别为头胸甲和腹部因子。判别分析中,雌性综合判别率为82.16%,雄虾为83.28%,判别率较高。关联分析表明,14对分子标记的连锁不平衡共有105对SSR位点组合,满足P<0.01的条件,14对SSR引物在168份克氏原螯虾材料中存在连锁不平衡,可与生长性状进行关联分析。采用一般线性模型对克氏原螯虾种质的6个表型性状和2个质量性状同SSR位点进行关联分析,在P<0.01的阈值条件下,存在1组引物关联多个性状的情况,共检测到30组引物对6个表型性状和2个质量性状呈极显著关联状态。由此可以丰富克氏原螯虾群体关联位点的筛选,并在一定程度上为克氏原螯虾种质资源的保护和亲本选育工作提供支持。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]Senol R,Kilic S,Tasdelen K. Pulse timing control for LED plant growth unit and effects on carnation[J]. Computers and Electronics in Agriculture,2016,123:125-134.
[2]李飞,李喜莲,贾永义,等. 克氏原螯虾家系建立及幼虾生长比较的初步研究[J]. 安徽农业大学学报,2014,41(1):38-43.
[3]Matsuzaki S I S,Usio N,Takamura N,et al. Contrasting impacts of invasive engineers on freshwater ecosystems:an experiment and meta-analysis[J]. Oecologia,2009,158(4):673-686.
[4]李锐,邹茜,孙玉林,等. 紫外诱导克氏原螯虾虾头自溶制备蛋白酶解液及其鲜味物质研究[J]. 食品与发酵工业,2019,45(3):153-160.
[5]Fakhri S,Abbaszadeh F,Dargahi L,et al. Astaxanthin:a mechanistic review on its biological activities and health benefits[J]. Pharmacological Research,2018,136:1-20.
[6]Ambati R R,Phang S M,Ravi S,et al. Astaxanthin:sources,extraction,stability,biological activities and its commercial applications:a review[J]. Marine Drugs,2014,12(1):128-152.
[7]Hemming S,de Zwart F,Elings A,et al. Remote control of greenhouse vegetable production with artificial intelligence-greenhouse climate,irrigation,and crop production[J]. Sensors,2019,19(8):1807.
[8]Oficialdegui F J,Sánchez M I,Clavero M. One century away from home:how the red swamp crayfish took over the world[J]. Reviews in Fish Biology and Fisheries,2020,30(1):121-135.
[9]李青彬,李艳和,王卫民,等. 湖北省不同克氏原螯虾群体携带白斑综合征病毒情况调查[J]. 中国农学通报,2019,35(12):157-164.
[10]宋亮,张建平,韩晓磊,等. 克氏原螯虾养殖现状及对策[J]. 常熟理工学院学报,2011,25(2):85-87,91.
[11]郑友. 不同地区野生克氏原螯虾形态差异及氨基酸的分析[D]. 南昌:南昌大学,2013.
[12]张龙,石林林,李艳和. 克氏原螯虾形态与体重的通径分析[J]. 中国农学通报,2019,35(18):148-153.
[13]田灿,李飞,苏胜彦,等. 基于图像识别的5个不同产地克氏原螯虾(Procambarus clarkii)形态差异分析[J]. 海洋与湖沼,2020,51(6):1483-1492.
[14]徐滨,李忠,魏开金,等. 6个克氏原螯虾群体形态学分析[J]. 淡水渔业,2019,49(6):27-32.
[15]刘伟,苏胜彦,董在杰,等. 3个鲤群体的微卫星标记与生长性状相关性分析[J]. 南方水产科学,2012,8(3):17-24.
[16]张义凤,张研,鲁翠云,等. 鲤鱼微卫星标记与体重、体长和体高性状的相关分析[J]. 遗传,2008,30(5):613-619.
[17]张研,梁利群,常玉梅,等. 鲤鱼体长性状的QTL定位及其遗传效应分析[J]. 遗传,2007,29(10):1243-1248.
[18]吴滟,付春鹏,蒋速飞,等. 中华绒螯蟹微卫星标记与生长性状相关性的初步分析[J]. 水生生物学报,2011,35(2):197-202.
[19]Miyao A,Zhong H S,Monna L,et al. Characterization and genetic mapping of simple sequence repeats in the rice genome[J]. DNA Research,1996,3(4):233-238.
[20]Norris A T,Bradley D G,Cunningham E P. Microsatellite genetic variation between and within farmed and wild Atlantic salmon (Salmo salar) populations[J]. Aquaculture,1999,180(3/4):247-264.
[21]Kim H S,Lee B L,Woo D K,et al. Assessment of markers for the identification of microsatellite instability phenotype in gastric neoplasms[J]. Cancer Letters,2001,164(1):61-68.
[22]Bessert M L,Ortí G. Microsatellite loci for paternity analysis in the fathead minnow,Pimephales promelas(Teleostei:Cyprinidae)[J]. Molecular Ecology Notes,2003,3(4):532-534
[23]王洪哲,张研,殷倩茜,等. 两个镜鲤半同胞家系的遗传多样性及经济性状分析[J]. 水生生物学报,2009,33(3):522-531.
[24]孙新,魏振邦,孙效文,等. 镜鲤繁殖群体的遗传结构及微卫星标记与经济性状的相关性分析[J]. 遗传,2008,30(3):359-366.
[25]李建林,唐永凯,陈文华,等. 吉富罗非鱼微卫星标记与体质量、体形性状相关性分析[J]. 中国水产科学,2009,16(6):824-832.
[26]周鑫. 淡水小龙虾高效养殖模式攻略[M]. 北京:中国农业出版社,2015.
[27]高杨,田灿,姜京京,等. 基于微卫星标记的克氏原螯虾种群遗传多样性和遗传结构分析[J]. 江苏农业科学,2023,51(5):191-199.
[28]彭刚,刘伟杰,李佳佳,等. 长江流域3个克氏原螯虾野生群体遗传结构的微卫星分析[J]. 江苏农业学报,2010,26(5):1115-1117.
[29]费腾,李佳佳,黄越峰,等. 封闭小水体养殖对克氏原螯虾基因多样性的影响[J]. 江苏农业科学,2010,38(5):67-69.
[30]Zhang Y C,Hu Y,Guan Z R,et al. Combined linkage mapping and association analysis reveals genetic control of maize kernel moisture content[J]. Physiologia Plantarum,2020,170(4):508-518.
[31]李碧瀚,于洋,刘桂嘉,等. 基于三代测序技术的凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)高通量候选基因关联分析方法的建立[J]. 海洋与湖沼,2021,52(5):1255-1264.
[32]孙雪,李胜杰,杜金星,等. 草鱼GHRH基因SNPs的筛选及其与生长性状的关联分析[J]. 农业生物技术学报,2021,29(5):963-972.
[33]Houston R D,Bean T P,MacQueen D J,et al. Harnessing genomics to fast-track genetic improvement in aquaculture[J]. Nature Reviews Genetics,2020,21:389-409.
[34]姜洪真,马伯军,钱前,等. 全基因组关联分析(GWAS)在作物农艺性状研究中的应用[J]. 农业生物技术学报,2018,26(7):1244-1257.
[35]Liao G L,Li Z Y,Huang C H,et al. Genetic diversity of inner quality and SSR association analysis of wild kiwifruit (Actinidia eriantha)[J]. Scientia Horticulturae,2019,248:241-247.
[36]张尧庭,方开泰. 多元统计分析引论[M]. 北京:科学出版社,1982.
[37]Brzeski V J,Doyle R W. A morphometric criterion for sex discrimination in Tilapia[C]//ICLARM Conference Proceedings 15. Department of Fisheries,Bangkok,Thailand,and International Center of Living Aquatic Resources Management,Manila,Philippines,1988:439-444.
[38]李思发,李晨虹,李家乐. 尼罗罗非鱼品系间形态差异分析[J]. 动物学报,1998,44(4):454-457.
[39]Samb Rook J,Fritsch E F,Maniatis T. Molecular cloning[M]. New York:Cold Spring Harbor Laboratory Press,1989.
[40]王复标,石军,郑卓,等. 水稻遗传多样性及其农艺性状与SSR标记的关联分析[J]. 四川大学学报(自然科学版),2019,56(5):976-982.
[41]赵晓勤,倪娟,陈立侨,等. 日本沼虾4种群的形态差异分析[J]. 中国水产科学,2006,13(2):224-229.
[42]孙成波,陈国良,童汉荣,等. 美国4个凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)种群形态差异与判别分析[J]. 海洋与湖沼,2009,40(1):27-32.
[43]慕峰. 水体盐度及Ca2+浓度对克氏原螯虾代谢、生长及蜕壳的影响研究[D]. 上海:上海水产大学,2007.
[44]陈杰,郭慧,陈立侨,等. 中国秀丽白虾不同地理群体的形态变异[J]. 华东师范大学学报(自然科学版),2007(2):72-80.
[45]孙悦娜. 我国五大湖青虾的形态差异、DNA分子标记及沼虾属系统进化的研究[D]. 上海:上海水产大学,2007.
[46]何杰,徐跑,朱健. 南北水系中华绒螯蟹形态差异分析[J]. 海洋湖沼通报,2009(3):79-86.
[47]丁文超,李明云,管丹冬,等. 大黄鱼4个家系的形态差异分析[J]. 宁波大学学报(理工版),2009,22(2):185-190.
[48]韩晓磊,马强,李小蕊,等. 不同地区克氏原螯虾群体的形态差异分析[J]. 水生态学杂志,2011,32(3):82-87.
[49]傅德印. 主成分分析中的统计检验问题[J]. 统计教育,2007(9):4-7.
[50]韩晓磊,马强,李小蕊,等. 中国螯虾科虾类(克氏原螯虾和东北螯虾)形态差异及判别分析[J]. 中国农学通报,2011,27(11):61-65.
[51]罗福广,李斌,罗平秀,等. 中国沿海管角螺4个自然群体形态差异的比较[J]. 中国海洋大学学报(自然科学版),2010,40(3):65-70.
[52]王静,夏结来,叶冬青. 判别分析方法在医学应用中的进展[J]. 数理统计与管理,2008,27(2):369-376.
[53]郑友,胡火根,唐建清,等. 不同水域克氏原螯虾群体的形态差异分析[J]. 南昌大学学报(理科版),2014,38(1):96-102.
[54]徐扬. 关联分析和基因组预测相关方法的探讨与应用[D]. 扬州:扬州大学,2016.
[55]苏相文,高方远,曹墨菊,等. 利用重组自交系剖析大穗型香稻保持系川香29B产量相关性状的遗传基础[J]. 分子植物育种,2015,13(1):39-50.

相似文献/References:

[1]白青云,王南庆,吴仕传,等.烘烤克氏原螯虾虾仁的研制及HACCP体系的建立[J].江苏农业科学,2014,42(11):288.
 Bai Qingyun,et al(88).Preparation of roast lobster meat and establishment of HACCP system[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(16):288.
[2]陈树桥,陈勇,唐春萍,等.饲料来源对克氏原螯虾生长的影响[J].江苏农业科学,2013,41(09):214.
 Chen Shuqiao,et al.Effect of feed sources on growth of Procambarus clarkii[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(16):214.
[3]刘炜,陈树桥,茆健强,等.17α-羟孕酮对克氏原螯虾卵巢同步发育的影响[J].江苏农业科学,2013,41(12):241.
 Liu Wei,et al.Effect of 17α-hydroxyprogesterone on synchronous ovarian development of Procambarus clarkii[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(16):241.
[4]曹昆,李杰雄,韩晓磊,等.克氏原螯虾选育后代生长特性的初步研究[J].江苏农业科学,2016,44(02):279.
 Cao Kun,et al.Preliminary study on offspring performance of red swamp crayfish Procambarus clarkii[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(16):279.
[5]彭刚,陈大鹏,黄鸿兵,等.日本沼虾对克氏原螯虾幼虾胁迫试验[J].江苏农业科学,2017,45(21):190.
 Peng Gang,et al.Experimental study on stress of Procambarus clarkia juveniles by Macrobrachium nipponense[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(16):190.
[6]张宏叶,陈树桥,王涛,等.河川沙塘鳢的形态指标体系及雌雄差异分析[J].江苏农业科学,2018,46(06):138.
 Zhang Hongye,et al.Analysis of morphological index system and sexual differences of Odontobutis potamophila[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(16):138.
[7]张生元,郑瑞珠,艾桃山,等.克氏原螯虾源布氏柠檬酸杆菌的分离鉴定及药敏试验[J].江苏农业科学,2018,46(12):129.
 Zhang Shengyuan,et al.Isolation,identification and drug sensitivity test of Citrobacter braakii from Procambarus clarkii[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(16):129.
[8]敬永杰,管卫兵.养殖克氏原螯虾不同季节稳定同位素特征[J].江苏农业科学,2019,47(04):149.
 Jing Yongjie,et al.Stable isotope characteristics of crayfish(Procambarus clarkia) in different seasons[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(16):149.
[9]徐宇,许志强,孟祥龙,等.克氏原螯虾雌雄分养状态下的性腺发育观察[J].江苏农业科学,2019,47(15):192.
 Xu Yu,et al.Morphology and histological observation of gonad development of red swamp crayfish Procambarus clarkia with male and female cultured separately[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(16):192.
[10]吕敬才,张海波,代亮亮,等.克氏原螯虾摄食对沉水植物生长和群落结构的影响[J].江苏农业科学,2019,47(21):298.
 Lü Jingcai,et al.Effects of Procambarus clarkii feeding on growth and community structure of submerged macrophyte[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(16):298.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2023-07-28
资助项目:中国水产科学研究院基本科研业务费资助项目(编号:2022XT01);江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目(编号:JBGS〔2021〕123);中央级基本科研业务费(编号:2021JBFM21)。
作者简介:高杨(1997—),男,安徽铜陵人,硕士研究生,研究方向为水产动物遗传育种。E-mail:1463455739@qq.com。
通信作者:苏胜彦,博士,研究员,主要从事虾蟹遗传育种研究,E-mail:ouhaicourse@hotmail.com;朱健,硕士,研究员,主要从事水产动物遗传育种和水产养殖研究,E-mail:zhuj@ffrc.cn。
更新日期/Last Update: 2024-08-20