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[1]付强,钟晓武,邹颉,等.烟草植物螯合肽合成酶PCS1基因的电子克隆和序列分析[J].江苏农业科学,2014,42(06):34-37.
　Fu Qiang,et al.In silico cloning and sequence analysis of tobacco phytochelatin synthases(PCS1)gene[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(06):34-37.
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烟草植物螯合肽合成酶PCS1基因的电子克隆和序列分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第42卷
期数:
2014年06期
页码:
34-37
栏目:
生物技术
出版日期:
2014-06-25

文章信息/Info

Title:
In silico cloning and sequence analysis of tobacco phytochelatin synthases(PCS1)gene
作者:
付强;  钟晓武;  邹颉;  林世锋;  郭玉双;  赵杰宏;  王轶;  任学良
贵州省烟草科学研究院/烟草行业烟草分子遗传重点实验室，贵州贵阳 550081
Author(s):
Fu Qiang; et al
关键词:
栽培烟草; 植物螯合肽合成酶; 镉转运
Keywords:
-
分类号:
Q785；S572.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为了研究烟草中重金属镉的代谢转运基因，以马铃薯的植物螯合肽合成酶phytochelatin synthases 1(PCS1)基因的全长cDNA序列(GenBank登录号：AJ548472.1)为信息探针，通过电子克隆的方法从烟草栽培品种中克隆到1个植物螯合肽合成酶基因(NtPCS1)，并对其进行了序列分析。序列分析结果：NtPCS1包含完整的开放读码框，编码531个氨基酸，含有2个保守域Phytochelatin_C和Phytochelatin；通过同源比对和进化分析发现，NtPCS1氨基酸序列与番茄PCS1的序列一致性达到85%，与已报道的树烟草NgPCS相比，在N端多出30个氨基酸。以上结果表明NtPCS1是栽培烟草中新发现的金属镉代谢转运基因。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］Friberg L，Piscator M，Nordberg G F，et al. Cadmium in the environment［M］. Cleveland：CRC Press，1974.
［2］张艳玲，尹启生，周汉平，等. 中国烟叶铅、镉、砷的含量及分布特征［J］. 烟草科技，2006，11(11)：49-52，57.
［3］Arao T，Ae N. Genotypic variations in cadmium levels of rice grain［J］. Soil Science and Plant Nutrition，2003，49(4)：473-479.
［4］Clemens S，Kim E J，Neumann D，et al. Tolerance to toxic metals by a gene family of phytochelatin synthases from plants and yeast［J］. The EMBO Journal，1999，18(12)：3325-3333.
［5］Cazalé A C，Clemens S. Arabidopsis thaliana expresses a second functional phytochelatin synthase［J］. FEBS Letters，2001，507(2)：215-219.
［6］Ha S B，Smith A P，Howden R，et al. Phytochelatin synthase genes from Arabidopsis and the yeast Schizosaccharomyces pombe［J］. The Plant Cell，1999，11(6)：1153-1163.
［7］Vatamaniuk O K，Mari S，Lu Y P，et al. AtPCS1，a phytochelatin synthase from Arabidopsis：isolation and in vitro reconstitution［J］. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，1999，96(12)：7110-7115.
［8］Vatamaniuk O K，Bucher E A，Ward J T，et al. A new pathway for heavy metal detoxification in animals. Phytochelatin synthase is required for cadmium tolerance in Caenorhabditis elegans［J］. Journal of Biological Chemistry，2001，276(24)：20817-20820.
［9］巩元勇，郭书巧，束红梅，等. 陆地棉GhNIP5.1基因的电子克隆及生物信息学分析［J］. 江苏农业学报，2013，29(3)：682-684.
［10］Gill R W，Sanseau P. Rapid in silico cloning of genes using expressed sequence tags(ESTs)［J］. Biotechnology Annual Review，2000，5：25-44.
［11］冯爱芹，何晓红，叶绍辉，等. 猪原癌基因JunB的电子克隆及比较基因组学分析［J］. 江苏农业科学，2012，40(10)：33-36.
［12］王俊生，范小芳，李成伟，等. 小麦Ta-UBX1基因的电子克隆和生物信息学分析［J］. 江苏农业科学，2012，40(6)：29-32.
［13］Miyadate H，Adachi S，Hiraizumi A，et al. OsHMA3，a P1B-type of ATPase affects root-to-shoot cadmium translocation in rice by mediating efflux into vacuoles［J］. New Phytologist，2011，189(1)：190-199.
［14］Sierro N，Battey J N D，Ouadi S，et al. Reference genomes and transcriptomes of Nicotiana sylvestris and Nicotiana tomentosiformis［J］. Genome Biology，2013，14(6)：R60.
［15］Petersen T N，Brunak S，von Heijne G，et al. SignalP 4.0：discriminating signal peptides from transmembrane regions［J］. Nature Methods，2011，8(10)：785-786.
[HJ1.75mm] ［16］Emanuelsson O，Brunak S，von Heijne G，et al. Locating proteins in the cell using Target P，Signal P and related tools［J］. Nature Protocols，2007，2(4)：953-971.
［17］Saitou N，Nei M. The neighbor-joining method：a new method for reconstructing phylogenetic trees［J］. Molecular Biology and Evolution，1987，4(4)：406-425.
［18］Tamura K，Dudley J，Nei M，et al. MEGA4：molecular evolutionary genetics analysis(MEGA)software version 4.0［J］. Molecular Biology and Evolution，2007，24(8)：1596-1599.
［19］Grill E，Winnacker E L，Zenk M H. Phytochelatins，a class of heavy-metal-binding peptides from plants，are functionally analogous to metallothioneins［J］. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，1987，84(2)：439-443.
［20］Davis R D. Cadmium-a complex environmental problem part Ⅱ［J］. Experientia，1984，40(2)：117-126.
［21］Guo J B，Dai X J，Xu W Z，et al. Overexpressing GSH1 and AsPCS1 simultaneously increases the tolerance and accumulation of cadmium and arsenic in Arabidopsis thaliana［J］. Chemosphere，2008，72(7)：1020-1026.

相似文献/References:

[1]付强,邹颉,余婧,等.烟草蛋白酶体α2型亚单位的克隆和序列分析[J].江苏农业科学,2016,44(09):39.
　Fu Qiang,et al.Cloning and sequence analysis of tobacco proteasome α2 subunit[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(06):39.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2013-09-11
基金项目：贵州省科技厅农业攻关项目(编号：黔科合NY字［2011］3047号)；中国烟草总公司重点项目(编号：中烟办［2010］221号)；中国烟草总公司重大专项(编号：中烟办［2012］146号)。
作者简介：付强(1984—)，男，贵州赤水人，博士，助理研究员，主要从事烟草遗传育种与蛋白质组学研究。E-mail：nesta1984fu@sina.com。
通信作者：任学良，男，博士，研究员，研究方向为烟草基因组学。E-mail：renxuel@126.com。
更新日期/Last Update: 2014-06-25