«上一篇/Previous Article|本期目录/Table of Contents|下一篇/Next Article»

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第43卷

期数:

2015年第12期

页码:

53-56

栏目:

生物技术

出版日期:

2015-12-25

文章信息/Info

Title:

Sequence comparison and phylogenetic analysis of rbcL and 18S rDNA gene of Bangia (Bangiales，Rhodophyta)

作者:

田翠翠¹; 2;  朱建一¹;  陆勤勤³;  邓银银³;  姜波¹;  沈宗根¹

1.常熟理工学院生物与食品工程学院，江苏常熟 215500；2.苏州大学基础医学与生物科学学院，江苏苏州 215123；
3.江苏省海洋水产研究所，江苏南通 226007

Author(s):

Tian Cuicui; et al

关键词:

红毛菜; 紫菜; rbcL基因; 18S rDNA; 序列分析; 遗传距离

Keywords:

-

分类号:

S917

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

对山西娘子关(SN)、兰州五泉山(LW)、兰州兴隆山(LX)3个淡水红毛菜(暗紫红毛菜)及江苏海门(JH)、浙江南麂岛(ZN)海水红毛菜的rbcL和18S rDNA区进行PCR扩增和序列分析。结果表明，rbcL、18S rDNA基因片段的A+T平均含量分别为61.6%、52.1%，且A+T含量均高于G+C含量；长度为1 455 bp的rbcL基因片段突变率为14.09%，长度为1 780 bp左右的18S rDNA基因片段突变率为11.85%，说明rbcL基因比18S rDNA基因具有更大的变异度。基于rbcL基因序列的分析结果显示，紫菜与红毛菜形成2个独立分支，样品中3个淡水红毛菜与国外其他地区的淡水红毛菜以100%置信度聚类在一起，与海水红毛菜形成明显的2个分支，表明淡水和海水红毛菜为2个独立存在的种群；18S rDNA基因序列分析结果显示，淡水与海水红毛菜间的遗传距离(0.118~0.122)大于红毛菜与紫菜间的遗传距离(0.066~0.117)，且海水红毛菜与紫菜聚为一大支，与经典分类结果不同。本研究为我国红毛菜物种的亲缘关系鉴别和系统分类积累了基础资料。

Abstract:

-

参考文献/References:

［1］施之新. 中国淡水藻志［M］. 北京：科学出版社，2006：27-30.
［2］郑宝福，李钧. 中国海藻志［M］. 北京：科学出版社，2009：56-65.
［3］Nelson W A，Farr T J，Broom J E. Phylogenetic relationships and generic concepts in the red order Bangiales：challenges ahead［J］. Phycologia，2006，45(3)：249-259.
［4］汪文俊，王广策，许璞，等. 红毛菜生物学研究进展Ⅰ.生活史和有性生殖研究［J］. 海洋科学，2008，32(4)：92-97.
［5］谢树莲，凌元洁. 山西省的淡水红藻［J］. 西北植物学报，2004，24(8)：1489-1492.
［6］Butterfield N J，Knoll A H，Swett K. A bangiophyte red alga from the Proterozoic of Arctic Canada［J］. Science，1990，250(4977)：104-107.
［7］Sheath R G，Cole K M. Systematics of Bangia (Rhodophyta) in North America Ⅰ.Biogeographic trends in morphology［J］. Phycologia，1984，23(3)：383-396.
［8］汤晓荣，潘光华，许东海. 紫菜分子遗传学研究进展［J］. 中国海洋大学学报：自然科学版，2006，36(5)：687-692.
［9］王艇，苏应娟，朱建明. 叶绿体rbcL基因序列在植物系统学研究中的应用［J］. 武汉植物学研究，1999，17(增刊1)：8-14.
［10］Müller K M，Sheath R G，Vis M L，et al. Biogeography and systematics of Bangia (Bangiales，Rhodophyta) based on the rubisco spacer，rbcL gene and 18S rRNA gene sequences and morphometric analysis.Ⅰ.North America［J］. Phycologia，1998，37(3)：195-207.
［11］Sutherland J E，Lindstrom S C，Nelson W A，et al. A new look at an ancient order：generic revision of the Bangiales(Rhodophyta)［J］. Journal of Phycology，2011，47(5)：1131-1151.
［12］杨立恩. 中国红毛菜科植物rbcL基因序列的系统学研究［D］. 苏州：苏州大学，2009：22-38.
［13］Milstein D，de Oliveira M C. Molecular phylogeny of Bangiales(Rhodophyta) based on small subunit rDNA sequencing：emphasis on Brazilian Porphyra species［J］. Phycologia，2005，44(2)：212-221.
［14］王亚军，仪茜茜，王钢，等. 中国沿海浒苔属rbcL和ITS序列比较及系统进化分析［J］. 生态科学，2010，29(6)：507-511.
［15］应成琦，张婷，李信书，等. 我国近海浒苔漂浮种类ITS与18S rDNA序列相似性分析［J］. 水产学报，2009，33(2)：215-219.
［16］Lin Z H，Shen S D，Chen W Z，et al. Phylogenetic analyses of four species of Ulva and Monostroma grevillei using ITS，rbcL and 18S rDNA sequence data［J］. Chinese Journal of Oceanology and Limnology，2013，31(1)：97-105.
［17］Hanyuda T，Suzawa Y，Suzawa T，et al. Biogeography and taxonomy of Batrachospermum helminthosum (Batrachospermales，Rhodophyta) in Japan inferred from rbcL gene sequences［J］. Journal of Phycology，2004，40(3)：581-588.
［18］Saunders G W. Gel purification of red algal genomic DNA：an inexpensive and rapid method for the isolation of polymerase chain reaction-friendly DNA［J］. Journal of Phycology，1993，29(2)：251-254.
［19］Broom J E，Nelson W A，Farr T J，et al. Relationships of the Porphyra(Bangiales，Rhodophyta) flora of the falkland islands：a molecular survey using rbcL and nSSU sequence data［J］. Australian Systematic Botany，2010，23(1)：27-37.
［20］李海涛，杨官品，张秀芳，等. 新月细柱藻的分离培养及形态和分子鉴定［J］. 中国海洋大学学报：自然科学版，2007，37(4)：627-630，620.
［21］毕相东，侯林，刘晓惠，等. 核糖体RNA基因在海洋动物分子系统学中的应用［J］. 应用与环境生物学报，2005，11(6)：779-783.
［22］仉晓文，王俊甫，王可可，等. α-淀粉酶基因的进化分析［J］. 江苏农业科学，2013，41(4)：25-27.
［23］明庆磊，王阿曼，程超.基于28S rRNA和CO[QX(Y15]Ⅰ[QX)]基因探讨赤拟谷盗与杂拟谷盗的遗传分化和系统发育［J］. 江苏农业学报，2013，29(5)：992-998.
［24］邓银银.红毛菜科植物的细胞学观察及基于rbcL、nrSSU序列的系统学分析［D］. 苏州：苏州大学，2014：12-23.

相似文献/References:

[1]徐佳杰,姜波,朱建一,等.红毛菜28S rDNA和IGS序列分析及系统发育[J].江苏农业科学,2016,44(04):66.
　Xu Jiajie,et al.Molecular and phylogenetic analysis of 28S rDNA and IGS sequences of Bangia (Bangiales，Rhodophyta)[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(12):66.
[2]陈淑吟,陆勤勤,张美如,等.紫菜丝状体种质特性的ISSR分析[J].江苏农业科学,2015,43(07):17.
　Chen Shuyin,et al.ISSR marker analysis of germplasm characteristics of Porphyra conchocelis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(12):17.

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2015-01-03
基金项目：国家自然科学基金(编号：31270256、31272664)。
作者简介：田翠翠(1989—)，女，山东济宁人，硕士，主要从事海藻生物学研究。E-mail：tiancuicui198997@126.com。
通信作者：沈宗根(1962—)，男，博士，教授，主要从事结构与发育植物学研究。E-mail：zonggenshen@cslg.cn。

常用功能

更新日期/Last Update: 2015-12-25