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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第44卷

期数:

2016年05期

页码:

34-37

栏目:

生物技术

出版日期:

2016-05-25

文章信息/Info

Title:

Bioinformatics analysis of CusB protein in Acidovorax citrulli

作者:

刘星¹;  胡金凤²;  王希东¹;  刘君²

1.新疆农业大学农学院，新疆乌鲁木齐 830052；2.新疆农业大学林学与园艺学院，新疆乌鲁木齐 830052

Author(s):

Liu Xing; et al

关键词:

瓜类细菌性果斑病; 西瓜食酸菌; RND外排转运体; CusB蛋白; 生物信息学分析

Keywords:

-

分类号:

S182

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

为了解西瓜食酸菌耐药结节细胞分化(RND)家族外排转运体中膜融合蛋白CusB生物信息学信息，利用相关软件对西瓜食酸菌和其他革兰氏阴性细菌的CusB蛋白进行理化性质分析，同时对西瓜食酸菌CusB蛋白的疏水性、跨膜结构域、磷酸化位点、信号肽及分泌蛋白亚细胞定位、蛋白质二级结构进行预测。结果表明：西瓜食酸菌CusB蛋白理化性质及进化树分析结果与大肠杆菌较为接近，梨火疫病菌、荧光假单胞菌与其他5种细菌遗传距离较远，预测西瓜食酸菌CusB蛋白有1个区域疏水性较高，存在1个近N端的跨膜结构域，且还有多个磷酸化位点，前1～36个氨基酸残基组成了信号肽，分泌蛋白位于周质空间，二级结构含有较多的α-螺旋、无规则卷曲。对CusB蛋白进行生物信息学分析，既丰富了信息学信息，又有助于在其分子水平的研究，同时也为西瓜食酸菌的抗铜性机理研究提供了依据。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2015-04-27
基金项目：新疆维吾尔自治区自然科学基金(编号：2015211A020)。
作者简介：刘星(1988—)，男，湖南邵东人，硕士研究生，主要从事分子生物学研究。E-mail：617325059@163.com。
通信作者：王希东，硕士，副教授，主要从事分子生物学研究，E-mail：372257510@qq.com；刘君，博士，副教授，主要从事植物生理学研究，E-mail：liujem@126.com。

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更新日期/Last Update: 2016-05-25