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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第44卷

期数:

2016年06期

页码:

45-49

栏目:

生物技术

出版日期:

2016-06-25

文章信息/Info

Title:

Identification and sequence analysis of PAL gene family in main crops

作者:

盖江涛;  沈建凯;  王鹏

中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，海南儋州 571737

Author(s):

Gai Jiangtao; et al

关键词:

苯丙氨酸解氨酶; PAL; 基因家族; 氨基酸

Keywords:

-

分类号:

Q78

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

苯丙氨酸解氨酶(PAL，phenylalanine ammonia-lyase ［EC：4.3.1.24］)存在于各种植物和部分微生物中，是与植物抗病性相关的关键酶，具有重要的植物生理意义。采用BLASTP的方法，依托全基因组数据库，获得了拟南芥［Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.］、水稻(Oryza sativa L.)、玉米(Zea mays Linn.)、小麦(Triticum aestivum Linn.)、谷子［Setaria italica (L.) P. Beauv.］、大豆［Glycine max (Linn.) Merr.］6种植物中的PAL基因家族共45条序列，对其进行了系统进化分析、生物信息学分析等。分析结果显示：单子叶植物与双子叶植物分别聚集在不同的分支，说明单子叶植物水稻、玉米、小麦、谷子亲缘关系较近，双子叶植物拟南芥、大豆亲缘关系较近，而单子叶植物与双子叶植物亲缘关系较远，也说明PAL基因的分化在单子叶植物和双子叶植物分化前形成；酸性蛋白质占93.3%，稳定性蛋白占97.8%，有信号肽的蛋白占2.2%，有导肽的蛋白占4.4%，所有蛋白均为有明显跨膜现象的亲水性蛋白；所有PAL基因亚细胞定位于细胞质中，都有蛋白活性位点。分析结果为进一步研究作物中PAL代谢机理提供理论支持。

Abstract:

-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2015-04-21
基金项目：芒果萜类物质合成关键酶基因的鉴定和分析(编号：1630032015026)；基因组学研究(编号：0314026)；茄科植物中生物碱合成相关基因资源研究(编号：0313219)。
作者简介：盖江涛(1983—)，女，山西长治人，硕士研究生，助理研究员，从事植物基因组学研究。E-mail：gjt006616@163.com。
通信作者：王鹏，博士研究生，副研究员，从事植物基因组学研究。E-mail：pwang521@163.com。

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更新日期/Last Update: 2016-06-25