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[1]钱荷英,李刚,何庆玲,等.蓖麻蚕核型多角体病毒的miRNAs生物信息学预测[J].江苏农业科学,2016,44(10):53-61.
　Qian Heying,et al.Bioinformatics prediction of miRNAs in PhcyNPV[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(10):53-61.
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蓖麻蚕核型多角体病毒的miRNAs生物信息学预测(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第44卷
期数:
2016年10期
页码:
53-61
栏目:
生物技术
出版日期:
2016-10-25

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics prediction of miRNAs in PhcyNPV
作者:
钱荷英;  李刚;  何庆玲;  罗旭芳;  徐安英
江苏科技大学，江苏镇江 212018
Author(s):
Qian Heying; et al
关键词:
蓖麻蚕; 核型多角体病毒; miRNA; 生物信息学
Keywords:
-
分类号:
S885.25
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
首先在GenBank中下载蓖麻蚕核型多角体(PhcyNPV)全基因组序列，通过生物信息学的方法预测表明，PhcyNPV 基因组中有142条miRNA成熟体分子；再用miRanda、RNAhybird 2个软件预测miRNAs对病毒自身的靶基因，提取有共同交集的33条miRNA。用PhcyNPV感染蓖麻蚕，取感病蓖麻蚕的脂肪体组织，提取总RNA；用逆转录PCR(reverse transcription PCR，简称RT-PCR)验证有共同交集的33条miRNA，确定其中6条为miRNA成熟体序列，分别是Phcy-miR-996_5p、Phcy-miR-696-5P、Phcy-miR-664_3p、Phcy-miR-30_5p、Phcy-miR-217_5p、Phcy-miR-1483_3p。这6条可能的miRNA对应的靶基因涉及病毒的融合蛋白、多角体蛋白等结构蛋白，以及一些蛋白激酶包括激活解旋酶表达的极早期基因等，推测其潜在的靶基因参与病毒复制及侵染的重要过程。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］Lee Y，Ahn C， Han J，et al. The nuclear RNase Ⅲ Drosha initiates microRNA processing［J］. Nature，2003，425(6956)：415-419.
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［10］钱荷英，徐安英，张月华，等. 蓖麻蚕核型多角体病毒基因gp64的克隆及荧光定量表达分析［J］. 河北农业大学学报，2013，36(6)：76-82.

相似文献/References:

[1]陈立华,张月华,钱荷英,等.蓖麻蚕对辛硫磷农药的代谢抗性机制[J].江苏农业科学,2016,44(01):264.
　Chen Lihua,et al.Metabolic resistance mechanism to phoxim of Philosamia cynthia ricini[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(10):264.
[2]刘惠芬,衣葵花,刘文光,等.斜纹夜蛾核型多角体病毒Ⅱ型分离株同源重复区hr1的结构功能分析[J].江苏农业科学,2019,47(21):100.
　Liu Huifen,et al.Structure-function analysis of homologous repeat region hr1 from Spodoptera litura nuclear polyhedrosis virus type Ⅱ[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(10):100.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2015-09-02
基金项目：现代农业产业技术体系建设专项(编号：CARS-22)。
作者简介：钱荷英(1971—)，女，江苏溧阳人，博士，副研究员，主要从事家蚕遗传育种与分子生物学研究。E-mail：qianheying123@163.com。
通信作者：徐安英，研究员，主要从事家蚕遗传育种与种质资源研究。E-mail：srixay@126.com。
更新日期/Last Update: 2016-10-25