|本期目录/Table of Contents|

[1]陈明辉,张志录,杨雨华,等.红豆杉种质资源遗传多样性的目标起始密码子多态性(SCoT)分析[J].江苏农业科学,2016,44(10):116-119.
 Chen Minghui,et al.Analysis on genetic diversity of Taxus germplasm resources by SCoT markers[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(10):116-119.
点击复制

红豆杉种质资源遗传多样性
的目标起始密码子多态性(SCoT)分析
(PDF)
分享到:

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第44卷
期数:
2016年10期
页码:
116-119
栏目:
生物技术
出版日期:
2016-10-25

文章信息/Info

Title:
Analysis on genetic diversity of Taxus germplasm resources by SCoT markers
作者:
陈明辉 张志录 杨雨华 佟伟霜 杨风岭
平顶山学院,河南平顶山 467000
Author(s):
Chen Minghuiet al
关键词:
红豆杉目标起始密码子多态性(SCoT)遗传多样性聚类分析亲缘关系
Keywords:
-
分类号:
S791.490.4
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
采用目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记技术,研究红豆杉18份种质的遗传多样性及种质间的遗传关系,为红豆杉资源的保护、利用以及遗传育种提供依据。以18份红豆杉种质资源为材料,从80条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物进行PCR扩增,利用NTSYS-pc2.10e软件对其扩增位点多态性进行分析。结果表明:19条引物共扩增出134条带,其中97条具有多态性,多态性带比率为72.39%。18个红豆杉种质间遗传相似系数在031~0.89之间,说明SCoT标记能够揭示材料间较高的遗传多样性。利用UPGMA进行系统的聚类分析显示,在相似系数0.53处可将18份红豆杉资源分成两大类;主坐标分析结果与聚类分析结果相一致。红豆杉资源具有较丰富的遗传多样性,SCoT分子标记技术可有效地从分子水平揭示红豆杉种质资源的遗传背景和亲缘关系。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]中国科学院植物研究所. 中国高等植物图鉴:第1册[M]. 北京:科学出版社,1972:332.
[2]李先琨,向悟生,欧祖兰,等. 濒危植物南方红豆杉种群克隆生长空间格局与动态[J]. 云南植物研究,2003,25(6):625-632.
[3]Wani M C,Tayl H L,Wan M E,et a1.Plant antitumor agent:The isolation and structure of taxol,a novel antileukemic and antitumor agent from Taxus brevifolia[J]. American Chem Soci,1971,93(2):2325-2327.
[4]臧敏,卞新民. 江西三清山珍稀濒危植物考察研究[J]. 武汉植物学研究,2003,21(6):515-520.
[5]Zhou Q X,Ge S,Yue Z S,et al. Genetic variation and relationships within Taxus and between the genus and Pseudotaxus in China[J]. Acta Phytotaxonmica Sinica,1998,36(4):323-332.
[6]李乃伟,贺善安,束晓春,等. 基于ISSR标记的南方红豆杉野生种群和迁地保护种群的遗传多样性和遗传结构分析[J]. 植物资源与环境学报,2011,20(1):25-30.
[7]李乃伟,束晓春,何树兰,等. 南方红豆杉的ISSR遗传多样性分析[J]. 西北植物学报,2010,30(12):2536-2541.
[8]王艇,苏应娟,黄超. 红豆杉科及其相关类群的RAPD分析[J]. 中山大学学报,2000,39(5):129-130.
[9]王誉茜,姜卫兵,魏家星. 红豆杉在城乡园林绿化中的开发应用[J]. 江苏农业科学,2015,43(6):180-183.
[10]赵赘鑫,张欢,邓百万,等. 红豆杉内生真菌产紫杉醇的培养基优化[J]. 江苏农业科学,2014,42(11):389-392.
[11]谢美华,李霖,李雪玲,等. 云南红豆杉叶斑病病原菌的分离鉴定和生物学特性[J]. 江苏农业科学,2014,42(11):146-149.
[12]张雪梅,李德铢,高连明. 南方红豆杉谱系地理学研究[J]. 西北植物学报,2012,32(10):1983-1989.
[13]Miao Y C,Lang X D,Zhang Z Z,et al.Phylogeography and genetic effects of habitat fragmentation on endangered Taxus yunnanensis in southwest China as revealed by microsatellite data[J]. Plant Biol,2014,16(2):365-374.
[14]吴琼,段小群,陈旭,等. 基于高通量测序的红豆杉EST-SSRs标记研究[J]. 中国中药杂志,2012,37(24):3728-3733.
[15]Collard B C Y,Mackill D J.Start codon targeted (SCoT) polymorphism:a simple,novel DNA marker technique for generating gene-targeted markers in plants[J]. Plant Mol Biol Rep,2009,27(1):86-93.
[16]熊发前,唐荣华,陈忠良,等. 目标起始密码子多态性(SCoT):一种基于翻译起始位点的目的基因标记新技术[J]. 分子植物育种,2009,7(3):635-638.
[17]Andersen J R,Lubberstedt T.Functional markers in plant[J]. Trends Plant Sci,2003,8(11):554-560.
[18]陆才瑞,喻树迅,于霁雯,等. 功能型分子标记(ISAP)的开发及评价[J]. 遗传,2008,30(9):1207-1216.
[19]熊发前,蒋蒨,钟瑞春,等. 目标起始密码子多态性(SCoT)分子标记技术在花生属中的应用[J]. 作物学报,2010,36(12):2055-2061.
[20]陈虎,何新华,罗聪,等. 龙眼24个品种的SCoT遗传多样性分析[J]. 园艺学报,2010,37(10):1651-1654.
[21]Luo C,He X H,Chen H,et al.Analysis of diversity and relationships among mango cultivars using Start Codon Targeted(SCoT) markers[J]. Biochem Syst Ecol,2010,38(6):1176-1184.
[22]Luo C,He X H,Chen H,et al.Genetic diversity of mango cultivars estimated using SCoT and ISSR markers[J]. Biochemical Systematics and Ecology,2011,39(4/5/6):676-684.
[23]刘杰,高连明. 红豆杉属植物三种不同总DNA提取方法的分析比较[J]. 广西植物,2011,31(2):244-249.
[24]Li G,Quiros C F.Sequence-related amplified polymorphism (SRAP),a new marker system based on a simple PCR reaction:its application to mapping and gene tagging in Brassica[J]. Theor Appl Genet,2001,103(2/3):455-461.
[25]Hu J,Vick B A.Target region amplification polymorphism:a novel marker technique for plant genotyping[J]. Plant Mol Bio Rep,2003,21(3):289-294.

相似文献/References:

[1]赵赟鑫,张欢,邓百万,等.红豆杉内生真菌产紫杉醇的培养基优化[J].江苏农业科学,2014,42(11):389.
 Zhao Yunxin,et al(89).Optimization of medium for Taxus chinensis endophytic fungi to produce taxol[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(10):389.
[2]李青,李荣华,陈迪勇,等.盆栽植物红豆杉对室内空气中二氧化硫污染的净化作用[J].江苏农业科学,2016,44(07):268.
 Li Qing,et al.Clean-up effect of potted plant Taxus chinensis on indoor air sulfur dioxide pollution[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(10):268.
[3]王誉茜,姜卫兵,魏家星.红豆杉在城乡园林绿化中的开发应用[J].江苏农业科学,2015,43(06):180.
 Wang Yuxi,et al.Application of Taxus spp. in greening in rural and urban landscape[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(10):180.
[4]郑鹏坤,贺小妮,胡喜巧,等.光照度对不同产地南方红豆杉幼苗生长发育的影响[J].江苏农业科学,2018,46(15):103.
 Zheng Pengkun,et al.Influence of illuminance on growth and development of Taxus mairei seedlings in different regions[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(10):103.
[5]张欢,赵赟鑫,李昭莹,等.红豆杉内生真菌产紫杉醇的发酵条件优化研究[J].江苏农业科学,2018,46(21):306.
 Zhang Huan,et al.Study on optimization of fermentation conditions for taxol production by endophytic fungi of Taxus chinensis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(10):306.
[6]赵赟鑫,张欢,张颜青,等.生长调节剂对红豆杉内生真菌产紫杉醇的影响[J].江苏农业科学,2019,47(07):120.
 Zhao Yunxin,et al.Influence of growth regulators on taxol produced by endophytic fungi in Taxus chinensis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(10):120.
[7]赵赟鑫,张欢,周俞辛,等.前体物质对红豆杉内生真菌产紫杉醇的影响[J].江苏农业科学,2019,47(13):234.
 Zhao Yunxin,et al.Impact of precursors on taxol production by endophytic fungi isolated in Taxus chinensis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(10):234.
[8]郝婧玮,梅念念,渠利霞,等.UV-B对红豆杉不同提取方式紫杉醇含量的影响[J].江苏农业科学,2019,47(21):266.
 Hao Jingwei,et al.Effect of UV-B on taxol contents in Taxus cuspidate under different extraction methods[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(10):266.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2015-09-25
基金项目:河南省科学攻关计划 (编号:122102310652);河南省环境科学重点学科建设项目(编号:Pxy-zdxk-2013003)。
作者简介:陈明辉(1974—),男,河南平顶山人,博士,讲师,主要从事植物生理生化及分子生物学研究。E-mail:cmh_abc@126.com。
通信作者:杨风玲,博士,教授,主要从事植物化学研究。E-mail:yangfl0001@163.com。
更新日期/Last Update: 2016-10-25