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[1]韩长志.全基因组预测希金斯炭疽菌中碳水化合物酶类蛋白[J].江苏农业科学,2017,45(02):24-28.
　Han Changzhi.Prediction of CAZymes from Colletotrichum higginsianum genome[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(02):24-28.
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全基因组预测希金斯炭疽菌中碳水化合物酶类蛋白(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第45卷
期数:
2017年02期
页码:
24-28
栏目:
生物技术
出版日期:
2017-01-20

文章信息/Info

Title:
Prediction of CAZymes from Colletotrichum higginsianum genome
作者:
韩长志
西南林业大学林学院/云南省森林灾害预警与控制重点实验室，云南昆明 650224
Author(s):
Han Changzhi
关键词:
希金斯炭疽菌; 碳水化合物酶类蛋白; 预测程序; 全基因组预测
Keywords:
-
分类号:
S432.4+4
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
希金斯炭疽菌侵染菜心等十字花科植物引起的炭疽病，给各国农业生产造成了巨大的经济损失。基于前期研究结果，以658个分泌蛋白为基础序列，利用CAZymes Analysis Toolkit预测程序，分析上述蛋白中的碳水化合物酶类(CAZymes)蛋白，明确该菌中含有238个CAZymes，分为主要类别和复合类别2类，前者包括75个糖苷水解酶(GHs)、48个碳水化合物绑定结构(CBMs)、33个辅助酶类家族(AAs)、30个碳水化合物酯酶(CEs)、23个多糖裂解酶(PLs)、4个糖基转移酶(GTs)，后者则包括17个GHs/CBMs、4个AAs/CBMs、4个CEs/CBMs等。研究结果可为深入开展该病菌侵染植物作用机制的研究提供一定的理论基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2015-12-16
基金项目：国家自然科学基金(编号：31560211)；云南省森林灾害预警与控制重点实验室开放基金(编号：ZK150004)；云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目(编号：50097505)；云南省高校林下生物资源保护及利用科技创新团队(编号：2014015)。
作者简介：韩长志(1981—)，男，河北石家庄人，博士，副教授，研究方向为经济林木病害生物防治与真菌分子生物学。E-mail：hanchangzhi2010@163.com。
更新日期/Last Update: 2017-01-20