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[1]曹尚银,牛娟,张杰,等.2种蛋白质组学方法在石榴中的应用比较[J].江苏农业科学,2017,45(20):68-71.
 Cao Shangyin,et al.A comparative study on application of two proteomics methods in pomegranate[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(20):68-71.
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2种蛋白质组学方法在石榴中的应用比较(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第45卷
期数:
2017年20期
页码:
68-71
栏目:
生物技术
出版日期:
2017-10-20

文章信息/Info

Title:
A comparative study on application of two proteomics methods in pomegranate
作者:
曹尚银 牛娟 张杰 李好先 薛辉 陈丽娜 刘蓓蓓 张富红 赵第广
中国农业科学院郑州果树研究所,河南郑州 450009
Author(s):
Cao Shangyinet al
关键词:
双向聚丙烯酰胺凝胶电泳(2-DE)相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)蛋白质组学石榴
Keywords:
-
分类号:
Q946.1;S665.401
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
对蛋白质组学中的双向聚丙烯酰胺凝胶电泳(two-dimensional gel electrophoresis,简称2-DE)、相对和绝对定量同位素标记(isobaric tags for relative and absolute quantification,简称iTRAQ)2种技术进行比较,以期为石榴的蛋白质组学研究提供选择参考。取花后120 d的三白石榴籽粒为材料,分别用双向电泳、iTRAQ 2种技术检测三白石榴籽粒蛋白。结果表明,利用2-DE技术检测到890种蛋白;通过质谱鉴定出5种蛋白;利用iTRAQ技术得到1 940种蛋白,其中分子量在10 ku以下的有16种,200 ku以上的有19种,pH值大于11的有11种,说明iTRAQ技术在鉴定大分子、小分子蛋白方面具有优势。由以上结果可知,iTRAQ技术比2-DE技术能发现更多数量、更多种类的蛋白,而且iTRAQ技术可以通过信息检索了解到被检索肽段的真实身份,该技术的出现,使得对同种蛋白质表达变化的鉴定更为准确。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]赵静,周变华,田二杰,等. 蛋白质组学试验技术及其应用[J]. 动物医学进展,2015,36(1):116-120.
[2]Jorrín-Novo J V,Maldonado A M,Echevarría-Zomeo S,et al. Plant proteomics update (2007—2008):second-generation proteomic techniques,an appropriate experimental design,and data analysis to fulfill MIAPE standards,increase plant proteome coverage and expand biological knowledge[J]. Journal of Proteomics,2009,72(3):285-314.
[3]Weiland F,Zammit C M,Reith F,et al. High resolution two-dimensional electrophoresis of native proteins[J]. Electrophoresis,2014,35(12/13):1893-1902.
[4]Viswanathan S,nlü M,Minden J S. Two-dimensional difference gel electrophoresis[J]. Nature Protocols,2006,1(3):1351-1358.
[5]Aebersold R,Mann M. Mass spectrometry-based proteomics[J]. Nature,2003,422(6928):198-207.
[6]Ross P L,Huang Y N,Marchese J N,et al. Multiplexed protein quantitation in Saccharomyces cerevisiae using amine-reactive isobaric tagging reagents[J]. Molecular & Cellular Proteomics,2004,3(12):1154-1169.
[7]Pierce A,Unwin R D,Evans C A,et al. Eight-channel iTRAQ enables comparison of the activity of six leukemogenic tyrosine kinases[J]. Molecular & Cellular Proteomics,2008,7(5):853-863.
[8]Marsh E,Alvarez S,Hicks L M,et al. Changes in protein abundance during powdery mildew infection of leaf tissues of Cabernet Sauvignon grapevine (Vitis vinifera L.)[J]. Proteomics,2010,10(10):2057-2064.
[9]曹尚银,牛娟,曹达,等. 石榴果实成熟期不同品种果皮蛋白质表达的双向电泳分析[J]. 果树学报,2015,32(6):1062-1069.
[10]Cao S Y,Niu J,Cao D,et al. Comparative proteomics analysis of pomegranate seeds on fruit maturation period (Punica granatum L.)[J]. Journal of Integrative Agriculture,2015,14(12):2558-2564.
[11]Bradford M M. A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding[J]. Analytical Biochemistry,1976,72:248-254.
[12]Candiano G,Bruschi M,Musante L,et al. Blue Silver:a very sensitive colloidal Coomassie G-250 staining for proteome analysis[J]. Electrophoresis,2004,25(9):1327-1333.
[13]潘三强,宿宝贵,吕来清. 二维电泳和iTRAQ的实验比较[J]. 神经解剖学杂志,2008,24(5):538-542.
[14]谢秀枝,王欣,刘丽华,等. iTRAQ技术及其在蛋白质组学中的应用[J]. 中国生物化学与分子生物学报,2011,27(7):616-621.
[15]Harry J L,Wilkins M R,Herbert B R,et al. Proteomics:capacity versus utility[J]. Electrophoresis,2000,21(6):1071-1081.
[16]López J L. Two-dimensional electrophoresis in proteome expression analysis[J]. Journal of Chromatography B,2007,849(1/2):190-202.

相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2016-04-28
基金项目:国家科技基础性工作专项重点项目(编号:2012FY110100);中国农业科学院科技创新工程(编号:CAAS-ASTIP-201X-CCZFI)。
作者简介:曹尚银(1961—),男,河南信阳人,博士,研究员,研究方向为果树遗传育种。Tel:(0371)65330963;E-mail:13937192127@163.com。
更新日期/Last Update: 2017-10-20