|本期目录/Table of Contents|

[1]郭敏,李祥龙.不同物种TYR基因编码蛋白结构及功能的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2017,45(21):44-48.
 Guo Min,et al.Bioinformatics analysis of structure and function of TYR gene coding protein in different species[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(21):44-48.
点击复制

不同物种TYR基因编码蛋白结构及功能的生物信息学分析(PDF)
分享到:

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第45卷
期数:
2017年第21期
页码:
44-48
栏目:
生物技术
出版日期:
2017-11-05

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of structure and function of TYR gene coding protein in different species
作者:
郭敏 李祥龙
河北科技师范学院动物科技学院,河北秦皇岛 066004
Author(s):
Guo Minet al
关键词:
物种酪氨酸酶基因毛色蛋白质结构生物信息学
Keywords:
-
分类号:
Q754
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
利用生物信息学方法对13个物种TYR基因编码蛋白的理化性质,以及一级、二级、三级结构和亚细胞定位进行预测和分析,同时拟构建13个物种TYR基因的系统发育树。结果表明:TYR基因编码产物为不稳定蛋白(貉子除外),整条多肽链表现出亲水性。二级结构主要为α螺旋、β折叠,β转角区域分布少且散,均存在信号肽和跨膜区,可以判断TYR基因编码蛋白是定位于生物膜上的膜蛋白或分泌蛋白,主要在嘌呤和嘧啶、运输和结合、电压门控离子通道及转录中发挥作用。各物种TYR基因编码产物主要定位于内质网、高尔基体以及细胞质膜。除原鸡外,其他物种该蛋白均存在跨膜区,貉子有2个跨膜区域。各物种系统发育树与动物学进化观点基本一致。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]Ito S,Wakamatsu K,Oeki H. Chemical analysis of melanins and its application to the study of the regulation of melanogenesis[J]. Pigment Cell Research,2000,13(8):103-109.
[2]Hearing V J,Tsukamoto K. Enzymatic control of pigmentation in mammals[J]. FASEB J,1991,5(14):2902-2909.
[3]Crippa R,Horak V,Prota G,et al. Chemistry of melanins[J]. The Alkaloids,1989,36:253-323.
[4]Jimbow K. Biological role of tyrosinase-related protein and its relevance to pigmentary disorders (Vitiligo vulgaris)[J]. Dermatol,1999,26(11):734-737.
[5]Aigner B,Besenfelder U,Seregi J,et al. Expression of the murine wild-type tyrosiness gene in transgenic rabbits[J]. Transgenic Res,1996,5(6):405-411.
[6]Oetting W S. The tyrosinase gene and oculocutaneous albinism type 1(OCA1):a model for understanding the molecular biology of melanin formation[J]. Pigment Cell Res,2000,13(5):320-325.
[7]付鑫,李祥龙,周荣艳,等. 14个物种RPSA基因编码区生物信息学分析[J]. 湖北农业科学,2012,51(2):389-390.
[8]杨洪一,孙立娜,张杰,等. 黄瓜绿斑驳花叶病毒抗原表位预测[J]. 河南农业科学,2013,42(8):67-70.
[9]胡慧艳,贾青,陶隽,等. 家猪TBP蛋白结构与理化性质的生物信息学分析[J]. 河南农业科学,2014,43(3):128-132.
[10]Jensen L J,Gupta R,Blom N,et al. Prediction of human protein function form post-translational modification and localization features[J]. Journal of Molecular Biology,2002,319(5):1257-1265.
[11]Jensen L J,Gupta R,Strfeldt H H,et al. Prediction of human protein function according to Gene Ontology categorise[J]. Bioinformatics,2003,19(5):635-642.
[12]李玩生,刘磊,冯海燕,等. 猪T细胞受体β链基因的克隆及生物信息学分析[J]. 甘肃农业大学学报,2010,45(3):1-6.
[13]Nakai K,Horton P. PSORT:A program for detecting sorting signals in protein and predicting their subcellular localization[J]. Trends Biochem Sci,1999,24 (1):34-36.
[14]徐小刚,刘雅婷,李永忠,等. 番茄斑萎病毒属病毒SRNA序列比对[J]. 湖南农业大学学报(自然科学版),2010,36(2):142-146.
[15]Thorton J M. From genome to function[J]. Science,2001,292(5524):2095-2097.
[16]阎隆飞,孙之荣. 蛋白质分子结构[M]. 北京:清华大学出版社,1999:221-229.

相似文献/References:

[1]张永改,李祥龙,周荣艳,等.不同物种CDK5基因编码区生物信息学分析[J].江苏农业科学,2014,42(07):32.
 Zhang Yonggai,et al.Bioinformatics analysis of coding regions of CDK5 gene among different species[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(21):32.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2016-06-01
基金项目:河北省高校创新团队领军人才培育计划(编号:LJRC004);河北省应用基础研究计划重点基础研究项目(编号:15962901D);河北省自然科学基金重点项目(编号:C2016407114)。
作者简介:郭敏(1991—),女,内蒙古呼和浩特人,硕士研究生,研究方向为功能基因组学。E-mail:1908384796@qq.com。
通信作者:李祥龙,博士,教授,博士生导师,研究方向为动物遗传育种。E-mail:lixianglongcn@yahoo.com。
更新日期/Last Update: 2017-11-05