|本期目录/Table of Contents|

[1]王桢璐,姚东林,谢少林,等.基于线粒体Cyt b 和COⅠ基因序列的华南鲤群体遗传结构分析[J].江苏农业科学,2018,46(18):179-183.
　Wang Zhenlu,et al.Analysis of population genetic structure of Cyprinus carpio rubrofuscus based on mitochondrial Cyt b and COⅠ gene sequences[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(18):179-183.
点击复制

基于线粒体Cyt b 和COⅠ基因序列
的华南鲤群体遗传结构分析(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第46卷
期数:
2018年第18期
页码:
179-183
栏目:
畜牧兽医与水产蚕桑
出版日期:
2018-09-20

文章信息/Info

Title:
Analysis of population genetic structure of Cyprinus carpio rubrofuscus based on mitochondrial Cyt b and COⅠ gene sequences
作者:
王桢璐1;  姚东林2;  谢少林1; 3;  范兰芬1;  邹记兴1;  周爱国1; 3; 4
1.华南农业大学海洋学院，广东广州 510642； 2.广东省清远市水产技术推广站，广东清远 511510；
3.清远市北江水产科学研究所，广东清远 511510； 4.广东省清远市兴渔水产科技有限公司，广东清远 511510
Author(s):
Wang Zhenlu; et al
关键词:
华南鲤; Cyt b基因; COⅠ基因; 群体遗传结构; 遗传距离; 多样性指数; 分化年代
Keywords:
-
分类号:
Q173
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
运用线粒体Cyt b 和COⅠ基因序列测定技术，分析华南鲤(Cyprinus carpio rubrofuscus Lacepede)3个种群的群体遗传结构及其变异。结果表明，海南鲤、珠江鲤、榕江鲤平均遗传距离分别为0.003 1(Cyt b)、0.003 0(COⅠ)；52尾个体分别检测出13(Cyt b)、12(COⅠ)个单倍型，总群体单倍型多样性(Hd)分别为0.874(Cyt b)、0.770(COⅠ)，核苷酸多样性指数(π)分别为0.004 15(Cyt b)和0.003 38(COⅠ)，平均核苷酸差异数(K)分别为3.027(Cyt b)和 1.835(COⅠ)。构建NJ系统进化树发现，各种群间未形成明显的谱系结构，未发现明显的地理结构。海南鲤与珠江鲤、榕江鲤的分化约在2.50万、2.65万年前，而珠江鲤和榕江鲤之间的的分化年代约在1.50万年前。珠江鲤和榕江鲤的遗传分化指数差异不显著，2个种群间的交流更加频繁。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]王幼槐. 中国鲤亚科鱼类的分类、分布、起源及演化［J］. 水生生物学报，1979，3(4)：419-438.
[2]王成辉. 中国红鲤遗传多样性研究［D］. 上海：上海水产大学，2002：29-147.
[3]卢红. 东平湖鲤的种质遗传特征研究［D］. 济南：山东大学，2013：26-55.
[4]李献儒，柳淑芳，李达，等. DNA条形码在鲱形目鱼类物种鉴定和系统进化分析中的应用［J］. 中国水产科学，2015，22(6)：1133-1141.
[5]孙鹏，彭士明，尹飞，等. 利用COⅠ和Cyt b序列探讨东海区3种鲳属鱼类的种群遗传结构［J］. 海洋渔业，2011，33(4)：398-404.
[6]郑小东，马媛媛，程汝滨. 线粒体DNA标记在头足纲动物分子系统学中的应用［J］. 水产学报，2015，39(2)：294-303.
[7]于萍，曹婷，施力光，等. 猪线粒体DNA研究应用进展［J］. 家畜生态学报，2014，35(7)：1-6.
[8]哈丽亚. 利用线粒体Cyt b基因检测骨顶鸡(Fulica atra)种内巢寄生的初步研究［D］. 哈尔滨：东北林业大学，2014：15-17.
[9]于涛，吴彪，杨爱国，等. 栉孔扇贝、虾夷扇贝及其杂交子代线粒体COⅠ和Cyt b基因遗传多样性分析［J］. 海洋科学，2016，40(3)：1-9.
[10]邢炳鹏，林汝榕，王彦国，等. 基于COⅠ基因的厦门海域鱼类DNA条形码鉴定［J］. 应用海洋学学报，2016(1)：144-150.
［11］谢少林，吕子君，周爱国，等. 基于线粒体Cyt b和COⅠ基因对珠江、海南和红河长臀鮠群体遗传结构分析［J］. 生态科学，2016(3)：65-72.
［12］胡静，侯新远，尹绍武，等. 基于mtDNA COⅠ和Cyt b基因序列对南中国海不同海域波纹唇鱼群体遗传多样性的研究［J］. 水生生物学报，2014，38(6)：1008-1016.
［13］熊丹，李敏，李永振，等. 南海短尾大眼鲷线粒体Cyt b基因序列及种群判别分析［J］. 中国水产科学，2016，23(1)：188-197.
［14］毕潇潇，高天翔，肖永双，等. 4种鳕鱼线粒体16S rRNA、COⅠ和Cyt b基因片段序列的比较研究［J］. 南方水产科学，2009，5(3)：46-52.
［15］Liu L T，Xiao W H，Liu W W. Effect of 5-Aza-2′-deoxycytidine on the P16 tumor suppressor gene in hepatocellular carcinoma cell line HepG2［J］. World Journal of Gastroenterology，2001，7(1)：131-135.
［16］任桂静，刘奇，高天翔，等. 基于线粒体DNA序列探讨斑头鱼分类地位［J］. 动物分类学报，2011，36(2)：332-340.
［17］Despoina X，Arnold B B，Evangelia D，et al. Base substitution in fish mitochondrial DNA：patterns and rates-molecular systematics of fishes-chapter 2［J］. European Journal of Work & Organizational Psychology，2012，21(4)：489-517.
［18］Dibattista J D，Randall J E，Newman S J. Round herring (genusEtrumeus) contain distinct evolutionary lineages coincident with a biogeographic barrier along Australias southern temperate coastline［J］. Marine Biology，2014，161(11)：2465-2477.
［19］李青，王波，郑风荣，等. 星斑川鲽，黄盖鲽和石鲽线粒体基因Cyt b和COⅠ片段序列的比较研究［J］. 水产科学，2016，35(6)：625-632.
［20］胡玉婷，胡王，凌俊，等. 滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析［J］. 南方水产科学，2015(2)：101-108.
［21］谢少林，王超，吕子君，等. 基于线粒体控制区Dloop序列的长臀鮠种群遗传结构分析［J］. 华南农业大学学报，2016(1)：1-6.
［22］Ovenden J R，Berry O，Welch D J，et al. Oceans eleven：a critical evaluation of the role of population，evolutionary and molecular genetics in the management of wild fisheries［J］. Fish and Fisheries，2015，16(1)：125-159.
［23］Zhang J X，Jiao T，Zhao S G. Genetic diversity in the mitochondrial DNA D-loop region of global swine (Sus scrofa) populations［J］. Biochemical and Biophysical Research Communications，2016，473(4)：814-820.
［24］李敏，李玉芳，张鹏，等. 基于线粒体控制区序列的南海圆舵鲣种群遗传结构分析［J］. 南方水产科学，2016，12(4)：88-95.
［25］Ichikawa-Seki M，Tokashiki M，Opara M N，et al. Molecular charatterization and phylogenetic analysis of Fasciola gigantica from Nigeria［J］. Parasitology International，2017，66(1)：893-897.
［26］曹艳，章群，宫亚运，等. 中国南海康氏马鲛线粒体COⅠ序列遗传变异分析［J］. 南方水产科学，2016，12(5)：53-60.
［27］熊丹，李敏，陈作志，等. 南海短尾大眼鲷的种群遗传结构分析［J］. 南方水产科学，2015(2)：27-34.
［28］Heather K，Freeland J R. Applications and implications of neutralversus non-neutral markers in molecular ecology［J］. International Journal of Molecular Sciences，2011，12(6)：3966-3988.
［29］林小植，李冬梅，刘焕章，等. 广东韩江潮州江段鱼类多样性及季节变化［J］. 生物多样性，2016，24(2)：185-194.
［30］邢迎春，赵亚辉，张春光，等. 中国近现代内陆水域鱼类系统分类学研究历史回顾［J］. 动物学研究，2013，34(4)：251-266.

相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2017-04-05
基金项目：国家现代农业产业技术体系建设专项(编号：CARS-46-43)；华南农业大学青年科技人才培育专项(编号：201707N025)；华南农业大学引进人才专项；华南农业大学海洋学院青年教师科研启动基金。
作者简介：王桢璐(1994—)，女，重庆人，硕士，主要从事水产动物种质资源研究。E-mail：wangzhenlu1994@163.com。
通信作者：周爱国，博士，讲师，主要从事水产动物遗传育种和种业研究。E-mail：scauzhoua
更新日期/Last Update: 2018-09-20