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[1]庞宁宁,樊怀福,王哲,等.黄瓜PP2-A1蛋白的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2019,47(02):46-49.
　Pang Ningning,et al.Bioinformatics analysis of PP2-A1 protein in cucumber[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(02):46-49.
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黄瓜PP2-A1蛋白的生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第47卷
期数:
2019年第02期
页码:
46-49
栏目:
生物技术
出版日期:
2019-01-20

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of PP2-A1 protein in cucumber
作者:
庞宁宁1;  樊怀福1; 2;  王哲1;  柴里昂1;  杜长霞1; 2
1.浙江农林大学农业与食品科学学院，浙江临安 311300； 2.浙江农林大学浙江省农产品品质改良技术研究重点实验室，浙江临安 311300
Author(s):
Pang Ningning; et al
关键词:
黄瓜; PP2-A1蛋白; 分子生物信息学; 亲水性; 系统发育树
Keywords:
-
分类号:
S642.201
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
韧皮部蛋白2(PP2)是植物特异性的韧皮部蛋白，通过参与植物调控其细胞内基因表达水平和产物活性来应对自然界中的各种胁迫，对于维持植物株体形态、体内物质运转和保护愈合植物伤口有重要意义。以前期克隆得到的黄瓜(Cucumis sativus)PP2-A1蛋白序列为对象，利用生物信息学方法，对黄瓜PP2-A1蛋白序列进行生物学功能分析。结果表明，黄瓜PP2-A1蛋白具有亲水性，比较不稳定，半衰期短，无信号肽段，没有跨膜结构，是定位在胞质的非分泌蛋白；结合对其二级结构和三级结构的预测分析，得出PP2-A1是以无规则卷曲和延伸链为主的片层结构；构建PP2的系统发育树，发现其与香瓜亲缘关系最近，同时预测其结构功能域，发现其具有1个典型的PP2结构功能域。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2017-10-24
基金项目：国家自然科学基金(编号：31201658)；浙江省自然科学基金(编号：Y18C150012、LY15C150006)。
作者简介：庞宁宁(1993—)，女，黑龙江哈尔滨人，硕士研究生，主要从事园艺植物种质资源创新与遗传育种学研究。E-mail：pangning020110@163.com。
通信作者：杜长霞，博士，副教授，硕士生导师，主要从事设施园艺、植物逆境蛋白质组学及分子生物学等方面的基础与应用研究工作、家庭园艺、观赏植物成花机理和保鲜生理等领域的科研与教学工作。E-mail：cxhappy-83@163.com。
更新日期/Last Update: 2019-01-20