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[1]熊健,屈燕,冷秋思,等.绿绒蒿SSR-PCR反应体系的建立与优化[J].江苏农业科学,2019,47(08):60-63.
　Xiong Jian,et al.Establishment and optimization of Meconopsis SSR-PCR reaction system[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(08):60-63.
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绿绒蒿SSR-PCR反应体系的建立与优化(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第47卷
期数:
2019年第08期
页码:
60-63
栏目:
生物技术
出版日期:
2019-05-19

文章信息/Info

Title:
Establishment and optimization of Meconopsis SSR-PCR reaction system
作者:
熊健;  屈燕;  冷秋思;  赵琬玥
西南林业大学园林植物与观赏园艺省高校重点实验室/西南林业大学园林学院，云南昆明 650224
Author(s):
Xiong Jian; et al
关键词:
绿绒蒿; SSR; PCR体系优化
Keywords:
-
分类号:
Q949.95
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为建立适合绿绒蒿属(Meconopsis Vig.)的SSR反应体系，以多刺绿绒蒿(M. horridula)为试材，应用L25(56)进行正交试验，对影响SSR-PCR的主要因素进行优化。结果发现，Mg2+对PCR反应效果影响最大，而dNTPs的影响最小。5个因素水平的变化对绿绒蒿属SSR-PCR反应体系的影响从大到小依次为Mg2+＞Taq酶含量＞引物浓度＞DNA模板量＞dNTPs浓度。适宜绿绒蒿属的SSR反应体系：总体积25 μL，Mg2+浓度2 mmol/L，dNTPs浓度 0.2 mmol/L，引物浓度 0.5 μmol/L，DNA模板量60 ng，Taq聚合酶量 1.6 U，其余用ddH2O补充。扩增程序为94 ℃ 15 min；94 ℃ 20 s，最适退火温度20 s，72 ℃ 1 min，共35个循环；72 ℃ 5 min；4 ℃ 保存。利用优化后的反应体系对同属另外8种绿绒蒿(M. wallichi、M. racemosa、M. lingholm、M. prattii、M. rudis、M. napaulensis Pinky、M. paniculata、M. superba)进行PCR扩增，均获得优良的扩增产物。因此，该试验建立的反应体系适用于绿绒蒿属植物的 SSR-PCR 反应。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］中国科学院中国植物志编辑委员会.中国植物志［M］. 北京：科学出版社，1999：7.
［2］屈燕，区智. 绿绒蒿属植物国内外研究进展［J］. 北方园艺，2012(2)：191-194.
［3］徐阳，陈金慧，王颖，等. 杉木SSR-PCR体系优化［J］. 林业科技开发，2014，28(1)：15-20.
［4］李银霞，李天红. 桃SSR反应体系的优化［J］. 中国农业大学学报，2005，10(6)：57-61.
［5］何正文，刘运生，陈立华，等. 正交设计直观分析法优化PCR条件［J］. 湖南医科大学学报，1998，23(4)：76-77.
［6］吴爱军，王红，俞守义. 在多基因PCR中对dNTP与Mg2+的浓度关系的研究［J］. 中国公共卫生，2001(2)：17-18.
［7］周静，陈书霞，程智慧，等. 大蒜SSR体系的建立与优化［J］. 西北农业学报，2011，20(11)：117-122.
［8］徐阳，陈金慧，王颖，等. 杉木SSR-PCR体系优化［J］. 林业科技开发，2014，28(1)：15-20.
［9］李雪，韩熹，梁琼麟，等. Taq酶对PCR定量检测结果的影响［J］. 生命科学仪器，2006(5)：34-36.
［10］丁海麦，白羽，石松利. 濒危植物蒙古扁桃ISSR反应体系优化［J］. 江苏农业科学，2017，45(24)：32-34.
［11］周 静，陈书霞，程智慧，等. 大蒜SSR体系的建立与优化［J］. 西北农业学报，2011，20(11)：117-122.
［12］唐健民，陈宗游，韦霄，等. 东兴金花茶SSR-PCR反应体系的优化及引物筛选［J］. 基因组学与应用生物学，2014，33(2)：398-404.
［13］赵雅楠，王颖，张东杰，等. 小豆SSR-PCR反应体系优化及引物筛选［J］. 江苏农业科学，2017，45(11)：33-37.
［14］贾新平，孙晓波，梁丽建，等. 绣球SSR-PCR反应体系的建立与优化［J］. 华北农学报，2016，31(4)：68-73.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2018-02-28
基金项目：国家自然科学基金 (编号：31460218)；云南省高校重点建设学科(风景园林学)建设项目；云南省农业基础研究联合专项［编号：2017FG001(-68)］；国家级质量工程园林专业综合改革试点项目(编号：50126002)。
作者简介：熊健(1993—)，男，重庆人，硕士研究生，主要从事风景园林植物应用方向的研究。E-mail：xiongjian205@163.com。
通信作者：屈燕，博士，副教授，主要从事园林植物及中草药植物资源保
更新日期/Last Update: 2019-04-20