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[1]原红娟,朱红惠.不同植被根际土壤中可培养与未培养黏细菌的多样性研究[J].江苏农业科学,2020,48(07):264-269.
　Yuan Hongjuan,et al.Diversity of cultured and uncultured slime bacteria in rhizosphere soil of different vegetations[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(07):264-269.
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不同植被根际土壤中可培养与未培养黏细菌的
多样性研究(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第48卷
期数:
2020年第07期
页码:
264-269
栏目:
资源与环境
出版日期:
2020-04-13

文章信息/Info

Title:
Diversity of cultured and uncultured slime bacteria in rhizosphere soil of different vegetations
作者:
原红娟1;  朱红惠2
1.运城学院生命科学系，山西运城 044000；2.广东省微生物研究所/省部共建华南应用微生物国家重点实验室/
广东省菌种保藏与应用重点实验室/广东省微生物应用新技术公共实验室，广东广州 510070
Author(s):
Yuan Hongjuan; et al
关键词:
PCR-DGGE(聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳); 根际土壤; 黏细菌; 多样性
Keywords:
-
分类号:
S182
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为探索不同植被根际可培养黏细菌与未培养黏细菌的多样性，采用传统的辅助菌诱导方法，对样品的黏细菌进行分离纯化，通过形态特征结合16S rDNA基因的序列分析，确定黏细菌菌株的系统分类地位；利用基于黏细菌特异性引物的变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel electrophoresis，DGGE)分析黏细菌的多样性。结果显示，从不同植被根际土壤中共分离得到19株，初步鉴定为黏球菌属(Myxococcus)11株，珊瑚球菌属(Corallococcus)13株，孢囊杆菌属(Cystobacter) 2株，多囊菌属(Polyangium)1株，其中，红树林分离得到的黏细菌种类最多，共7株；樟木最少，为2株。PCR-DGGE分子指纹图谱技术对其黏细菌多样性结果显示，花梨木、铁木、亚热带常绿阔叶林、针叶林、红树林、樟木根际土壤中黏细菌的物种丰度分别为16、24、34、26、30、24，多样性指数分别为2.10、2.53、3.49、2.62、2.77、2.73。DGGE指纹图谱显示，越南不同植被根际土壤存在大量的未培养黏细菌，其技术研究黏细菌多样性比传统分离纯化的方法方便、快速。本研究为黏细菌开发利用和多样性研究提供理论与技术参考依据。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］Reichenbach H. The order Cytophagales［M］//Balous A，Trüper H G，Dworkin M，et al . The prokaryotes. 2nd ed . New York：Spriger-Verlag，1992：3631-3675.
［2］Kaiser D，Losick R. How and why bacteria talk to each other［J］. Cell，1993，73(5)：873-885.
［3］Mohr K I，Garcia R O，Gerth K，et al. Sandaracinus amylolyticus gen.nov.，sp.nov.，a starch-degrading soil myxobacterium，and description of Sandaracinaceae fam.nov［J］. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology，2012，62(5)：1191-1198.
［4］Iizuka T，Jojima Y，Hayakawa A，et al. Pseudenhygromyxa salsuginis gen.nov.，sp.nov.，a myxobacterium isolated from an estuarine marsh［J］. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology，2013，63(4)：1360-1369.
［5］Garcia R O，Reichenbach H，Ring M W，et al. Phaselicystis flava gen.nov.，sp.nov.，an arachidonic acid-containing soil myxobacterium，and the description of Phaselicystidaceae fam.nov［J］. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology，2009，59(6)：1524-1550.
［6］Kathrin I M，Ronald O G，Klaus G，et al. Sandaracinus amylolyticus gen.nov.，sp.nov.，astarch-degrading soil myxobacterium，and description of Sandaracinaceae fam.nov［J］. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology，2012，62(5)：1191-1198.
［7］Shimkets L J，Dworkin M，Reichenbach H. The myxobacteria［M］// Dworkin M. The prokaryotes. 3rd ed. Berlin：Springer，2006：31-115.
［8］Reichenbach H. Myxobacteria，producers of novel bioactive substances［J］. Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology，2001，27(3)：149-156.
［9］Wenzel S C，Müller R. Myxobacteria-‘microbial factories’ for the production of bioactive secondary metabolites［J］. Molecular Biosystems，2009，5(6)：567-574.
［10］李越中，陈琦. 海洋微生物资源多样性［J］. 生物工程进展，1998. 18(4)：34-40.
［11］李越中，李健，周璐，等. 我国黏细菌(Myxobacteria)资源的分离与鉴定［J］. 微生物学报，2000，40(6)：652-656.
［12］方晓梅，张利平. 黏细菌生态多样性的初步研究［J］. 生物多样性，2001，9(3)：207-213.
［13］李艳青，张利平，杨润蕾. 河北省黏细菌物种资源多样性的研究——承德市区及其五县生态样品的研究［J］. 河北科技大学学报，2005，26(3)：215-218，224.
［14］张鲜姣，黎志坤，谭志远，等. 新疆阿克苏地区盐碱地黏细菌分离鉴定［J］. 微生物学报，2012，52(2)：160-168.
［15］赵智颖，张鲜姣，谭志远，等. 药用植物根系土壤可培养黏细菌的分离鉴定［J］. 微生物学报，2013，53(7)：657-668.
［16］李友发，宋兵，宋亚娜，等. 福建省稻田土壤细菌群落的16S rDNA-PCR-DGGE分析［J］. 微生物学通报，2008，35(11)：1715-1720.
［17］Muyzer G，de Waal E C，Uitterlinden A G. Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain reaction-amplified genes coding for 16S rRNA［J］. Applied and Environmental Microbiology，1993，59(3)：695-700.
［18］Oros-Sichler M，Gomes N C M，Neuber G，et al. A new semi-nested PCR protocol to amplify large 18S rRNA gene fragments for PCR-DGGE analysis of soil fungal communities［J］. Journal of Microbiological Methods，2006，65(1)：63-75.
［19］李百元.新疆盐碱地黏细菌的分离及多样性的研究［D］. 北京：中国科学院大学，2013.
［20］徐秋芳.森林土壤活性有机碳库的研究［D］. 杭州：浙江大学，2004.
［21］Sprer C，Reichenbach H，Stackebrandt E. The correlation between morphological and phylogenetic classification of myxobacteria［J］. International Journal of Systematic Bacteriology，1999，49(3)：1255-1262.
［22］Reichenbach H. The Myxococcales［M］//Garrity G M.Bergeys manual of systematic bacteriology：Part 3：The alpha-，beta-，delta-，and epsilon-proteobacteria. 2nd ed. New York：Springer-Verlag，2005：1059-1143.
［23］Reichenbach H，Dworkin M.The Myxobacteria［M］// Balous A，Trüper H G，Dworkin M，et al . The prokaryotes. 2nd ed . New York：Spriger-Verlag，1992：3416-3487.
［24］Dawid W. Biology and global distribution of myxobacteria in soils［J］. FEMS Microbiology Reviews，2000，24(4)：403-427.
［25］Li B Y，Yao Q，Zhu H H. Approach to analyze the diversity of myxobacteria in soil by semi-nested PCR-denaturing gradient gel electrophoresis(DGGE)based on taxon-specific gene［J］. PLoS One，2014，9(10)：e108877.

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　Lu Haiju,et al.Determination of colonization ability of endophytic Trichoderma P3.9 strain in loquat rhizosphere soil[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(07):263.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2020-02-06
基金项目：山西省青年基金(面上青年基金)(编号：201601D202061)；广东省国际合作项目(编号：20120501)；运城学院博士启动基金(编号：YQ-2017009)；山西省重点学科建设经费资助项目(编号：FSKSC)；运城学院学科项目(编号：XK-2019007)。
作者简介：原红娟(1978—)，女，山西运城人，博士，副教授，主要从事黏细菌资源开发。E-mail：yhj1793@163.com。
通信作者：朱红惠，博士，研究员，博士生导师，主要从事微生物发掘与保护研究。E-mail：zhuhh@gdim.cn。
更新日期/Last Update: 2020-04-05