«上一篇/Previous Article|本期目录/Table of Contents|下一篇/Next Article»

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第48卷

期数:

2020年第09期

页码:

86-92

栏目:

生物技术

出版日期:

2020-05-05

文章信息/Info

Title:

Molecular evolution and phylogenetic analysis of main wild mushrooms in Xilin Gol Grassland，Inner Mongolia

作者:

李亚娇¹;  孙国琴¹;  郭九峰²;  王海燕¹;  庞杰¹

1.内蒙古自治区农牧业科学院蔬菜研究所，内蒙古呼和浩特 010031； 2.内蒙古大学物理科学与技术学院，内蒙古呼和浩特 010021

Author(s):

Li Yajiao; et al

关键词:

草原蘑菇; ITS序列; 分子系统发生学; 系统进化树; 分化时间

Keywords:

-

分类号:

S646.1⁺10.1

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

为探究内蒙古中部地区锡林郭勒草原蘑菇的遗传多样性及其进化特点，从分子水平上对89株草原蘑菇进行深入分析，旨在为后续草原蘑菇的种质资源创新和遗传改良提供理论依据。在内蒙古锡林郭勒盟白音锡勒草原地区采集草原蘑菇为试验材料提取基因组DNA，采用通用引物18S和ITS序列扩增片段进行PCR产物直接测序，利用BLAST、MEGA 6.0软件对测序结果进行比对分析，并以羊肚菌为外类群，分别构建系统进化树并计算分化时间。结果表明，89株草原蘑菇ITS序列中，保守位点数为275，变异位点数为268，简约信息位点数为180，单一位点数为88，覆盖率为330，简并位点：zore-fold为319、tow-fold为62、four-fold为40，G+C碱基平均含量：黑蘑为42.73%、白蘑为41.14%，遗传距离为0~0.45。ITS序列构建进化树结果表明，89株草原蘑菇分为3个类群，黑蘑1个类群、白蘑2个类群，且白蘑与黑蘑分化时间为11万年前，其中黑蘑中34号与其他黑蘑分化时间为3万年前，白蘑中B类群和C类群分化时间为1万年前。

Abstract:

-

参考文献/References:

［1］吴芳. 木耳属的分类与系统发育研究［D］. 北京：北京林业大学，2016.
［2］Wu F，Yuan Y，Malysheva VF，et al.Species clarif canon of the most important and cultivated Auricularia mushroom wHeimuer：evidence from morphological and molecular data［J］. Phytotaxa，2014，186(5)：241-253.
［3］渠志臻. 蒙古口蘑菌丝体营养生理特性及培养条件研究［D］. 呼和浩特：内蒙古农业大学，2010.
［4］Yang K，Tian Z X，Chen C H，et al.Genome sequencing of adzuki bean(Vigna angularis) provides insight into high starch and low fat accumula-tion and domestication［J］. Proc Natl Acad Sci USA，2015，112(43)：13213-13218.
［5］Moncalvo J M，Lutzoni F M，Rehner S A，et al.Phylogenetic relationships ofagaric fungi based on nuclear large subunit ribosomal DNA sequences［J］. Systematic Biology，2000，49(2)：278-305.
［6］邹莉，孙婷婷，王旭彤，等. 松杉灵芝分离纯化及ITS分子鉴［J］. 江苏农业科学，2016，44(8)：278-280.
［7］武冬梅. 新疆野生羊肚菌分子系统学和遗传多样性研究［D］. 乌鲁木齐：新疆大学，2015.
［8］刘晓亮，图力古尔，王向华. 东北大小兴安岭地区的红菇属物种多样性［J］. 菌物学报，2017，36(10)：1355-1368.
［9］王彤，刘静，郭月，等. 基于matK基因和ITS序列的江苏地方豆类植物的亲缘关系研究［J］. 南京农业大学学报，2017，40(5)：795-803.
［10］谭河林，许欣颖，付立曼，等. 甘蓝型油菜及其亲本物种甲基化酶Ⅰ基因的克隆及表达模式［J］. 作物学报，2015，41(3)：405-413.
［11］李建伏. 基于DNA序列的进化树构建算法的研究［D］. 哈尔滨：哈尔滨工业大学，2008.
［12］姜芳燕，黄海，杨宁，等. 海南几种大型绿藻18S rRNA基因的克隆与序列分析［J］. 热带农业科学，2017，37(6)：49-54.
［13］何文，张静，黄智林，等. 基于ITS序列对栽培中国樱桃遗传多样性及其群体遗传结构的分析［J］. 西北植物学报，2014，34(4)：0463-0472.
［14］刘悦，汤欢，李西文，等. 基于ITS序列的伞菌类药用食用真菌的DNA条形码鉴定研究［J］. 世界中医药，2016，11(5)：791-795.
［15］Schoch C L，Seifert K A，Huhndorf S，et al.Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for fungi［J］. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，2012，109(16)：4241-6246.
［16］杨光，俞菊华，徐跑，等. 利用18S和ITS序列揭示8种鲇形目鱼类的系统发育［J］. 动物学杂志，2010，45(4)：110-117.
［17］沈洪，陈明杰，赵永昌，等. 云南羊肚菌rDNA的ITS序列与亲缘关系分析［J］. 食用菌学报，2007，14(2)：15-18.
［18］钱雪婷，陈文强，邓百万，等. 基于ITS序列分析秦巴山区黑木耳菌株的遗传多样性［J］. 北方园艺，2016(12)：147-151.
［19］戴淑娟，戴玉成. 采自东南亚的变色卧孔菌一新种［J］. 菌物学报，2018，37(2)：145-150.
［20］刘丽娜，张平. 金针菇一个新变型的形态学鉴定及ITS序列分析［J］. 菌物研究，2016，14(1)：38-42，51.
［21］吴晓彤. 蒙古口蘑分子鉴定及其菌丝体液体发酵技术与应用［D］. 呼和浩特：内蒙古大学，2014.
［22］孟建宇，宋馨宇. 蒙古口蘑子实体凝集素性质初步研究［J］. 生物技术通报，2012(2)：188-192.
［23］刘晓婷，郭九峰，王淑妍，等. 蒙古口蘑担孢子萌发及初生菌丝生物学特性研究［J］. 北方园艺，2016(16)：136-141.
［24］解亚杰，孙国琴，庞杰，等. 草原野生食用菌蒙古口蘑的研究进展［J］. 食药用菌，2017，25(1)：28-33.
［25］刘晓婷，郭九峰，王淑妍，等. 用rDNA-ITS方法鉴别内蒙古多种野生食用菌［J］. 食药用菌，2015，23(5)：301-306.
［26］卯晓岚. 中国大型真菌［M］. 郑州：河南科技出版社，2000.
［27］郑怡鸿. 南瓜属植物的分子系统发育及分子钟研究［D］. 武汉：武汉大学，2011.
［28］张明. 华南地区牛肝菌科分子系统学及中国金牛肝属分类学研究［D］. 广州：华南理工大学，2016.
［29］韩美玲. 中国拟层孔菌属及近缘属的分类与系统发育研究［D］. 北京：北京林业大学，2016.

相似文献/References:

[1]李家敏,周秀玲,姜琼.濒危药用植物盘龙参rDNA ITS序列分析[J].江苏农业科学,2014,42(05):30.
　Li Jiamin,et al.Analysis of rDNA ITS sequence from endangered medicinal plant Radix seu Spiranthis Lanceae[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(09):30.
[2]蒋向辉,刘良科,佘朝文.葛属11份种质基于核rDNA ITS序列的亲缘关系分析[J].江苏农业科学,2015,43(07):46.
　Jiang Xianghui,et al.Analysis of phylogenetic relationship of eleven Pueraria species based on nrDNA ITS sequences[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(09):46.
[3]丁锦平,张庆琛,裴冬丽,等.枸杞白粉病的病原菌鉴定[J].江苏农业科学,2015,43(06):137.
　Ding Jinping,et al.Identification of Lycium chinense powdery mildew pathogen[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(09):137.
[4]冯媛媛,夏珊,曾其国,等.基于ITS序列对紫薇的分子鉴定[J].江苏农业科学,2015,43(04):67.
　Feng Yuanyuan,et al.Molecular identification of crape myrtle based on ITS sequence[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(09):67.
[5]张宗豪,李玉玲.冬虫夏草粉红菌株的分子鉴定[J].江苏农业科学,2016,44(07):59.
　Zhang Zonghao,et al.Molecular identification of pink fungi strain of Cordyceps sinensis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(09):59.
[6]石志刚,马婷慧,万如,等.基于ITS条形码序列早期筛选枸杞种内杂交种[J].江苏农业科学,2017,45(06):138.
　Shi Zhigang,et al.Early screening of intraspecific hybrid of Chinese wolfberry based on ITS bar code sequence[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(09):138.
[7]刘紫英,袁斌,冷桂华.1株华木莲内生真菌的抗氧化活性分析和菌株鉴定[J].江苏农业科学,2017,45(10):213.
　Liu Ziying,et al.Antioxidant activity analysis and identification of an endophytic fungus from Sinomanglietia glaula[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(09):213.
[8]娄喜艳,向文华,刘冬梅,等.河南省商丘地区棉花枯萎病菌的分子鉴定与致病力[J].江苏农业科学,2017,45(16):86.
　Lou Xiyan,et al.Molecular identification and pathogenicity of Fusarium oxysporum f. Sp. in Shangqiu area of Henan Province[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(09):86.
[9]陈兴银,石建明,杨鹏,等.无籽刺梨及其近缘种ITS序列分析[J].江苏农业科学,2017,45(17):42.
　Chen Xingyin,et al.ITS sequence analysis of Rosa sterilis and its relatives[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(09):42.
[10]唐冬兰,蒋立奔,唐泉,等.应用二次PCR检测草莓炭疽病菌[J].江苏农业科学,2023,51(9):125.
　Tang Donglan,et al.Detection of pathogen for strawberry anthracnose using two-time PCR[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(09):125.

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2019-04-11
基金项目：内蒙古农牧业创新基金(编号：2019CXJJN09-1)；内蒙古食用菌资源开发利用新技术创新人才团队项目(编号：第七批“草原英才”产业创新创业人才团队)。
作者简介：李亚娇(1990—)，女，黑龙江佳木斯人，硕士，研究实习员，主要从事内蒙古食用菌种质资源收集与创新研究。E-mail：726450605@qq.com。
通信作者：孙国琴，硕士，研究员，主要从事食用菌研究工作。E-mail：sgq9648@126.com。

常用功能

更新日期/Last Update: 2020-05-05