|本期目录/Table of Contents|

[1]邓宽平,杨秀伟,杨胜伟,等.基于SSR标记的树莓资源遗传多样性分析[J].江苏农业科学,2020,48(21):62-67.
 Deng Kuanping,et al.Genetic diversity analysis of raspberry resources based on SSR markers[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(21):62-67.
点击复制

基于SSR标记的树莓资源遗传多样性分析(PDF)
分享到:

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第48卷
期数:
2020年21期
页码:
62-67
栏目:
生物技术
出版日期:
2020-11-05

文章信息/Info

Title:
Genetic diversity analysis of raspberry resources based on SSR markers
作者:
邓宽平1 杨秀伟1 杨胜伟1 杨选辉1 张永刚1 陈荣辉2 徐德林2
1.遵义市农业科学研究院,贵州遵义 563000; 2.遵义医科大学,贵州遵义 563099
Author(s):
Deng Kuanpinget al
关键词:
树莓SSR标记种质资源遗传多样性聚类分析
Keywords:
-
分类号:
S663.202
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为探索树莓种内个体之间和不同树莓品种间的遗传特性,应用SSR标记开展树莓的遗传多样性分析。对引进、收集的树莓种质资源进行基因组DNA提取,然后应用PCR扩增和PAGE电泳检测筛选材料间的多态性SSR标记,利用NTsys 2.10 e软件进行遗传多样性分析。结果表明,从75对SSR标记中筛选出22对多态性良好的标记引物,共扩增得到285个条带,引物扩增出的清晰条带数为7~25个,平均每对引物的多态性比率为96.8%。对引物的扩增结果进行聚类分析发现,树莓样品在遗传系数为0.71的水平上共聚类为两大类群,第一类包括21份树莓样品,其中除sm46、sm85、sm102从辽宁省农业科学院引种外,其余树莓样品均来自贵州省,从辽宁省农业科学院引种的22份树莓样品,除上述归为第一类的3份外,其余的与贵州省遵义市习水土城、贵州省雷山县永乐、从广东省引种的树莓样品归为第二大类。45份树莓具有较丰富的遗传多样性,筛选出的SSR可有效应用于贵州省树莓品种的遗传多样性研究。
Abstract:
-

参考文献/References:

[1]左经会,向红,王绪英,等. 贵州西部悬钩子属植物资源研究及开发利用[C]//中国植物学会第十六次全国会员代表大会暨85周年学术年会论文摘要汇编,2018.
[2]杨鼎元,张群英,陈哲,等. 悬钩子属植物的组培快繁技术研究进展[J]. 现代园艺,2019(11):16-18.
[3]桂明珠,胡宝忠. 小浆果栽培生物学[M]. 北京:中国农业出版社,2002:36-38.
[4]郭清明. 优良树莓品种及当地野生树莓的引种比较研究[J]. 低碳世界,2017(34):344-345.
[5]刘会,彭春钰,武忠亮,等. 植物SSR标记开发及应用研究进展[J]. 科学技术创新,2018(36):18-20.
[6]徐德林,陈红波,马激,等. 白及SSR-PCR扩增体系的优化[J]. 中成药,2018,40(12):2672-2676.
[7]Li L,Fang Z W,Zhou J F,et al. An accurate and efficient method for large-scale SSR genotyping and applications[J]. Nucleic Acids Research,2017,45(10):e88.
[8]Xu D L,Chen H B,Aci M,et al. De Novo assembly,characterization and development of EST-SSRs from Bletilla striata transcriptomes profiled throughout the whole growing period[J]. PLoS One,2018,13(10):e0205954.
[9]李媛媛,郭修武,代汉萍,等. 树莓SSR体系的建立及优化[J]. 沈阳农业大学学报,2009,40(4):478-480.
[10]Dong H,Shang X D,Zhao X Y,et al. Construction of a genetic linkage map of Lentinula edodes based on SSR,SRAP and TRAP markers[J]. Breeding Science,2019,69(4):585-591.
[11]Adjebeng-Danquah J,Manu-Aduening J,Asante I K,et al. Genetic diversity and population structure analysis of Ghanaian and exotic cassava accessions using simple sequence repeat (SSR) markers[J]. Heliyon,2020,6(1):e03154.
[12]忻雅,方献平,王淑珍,等. 简单重复序列标记和序列相关扩增多态性标记在草莓遗传多样性分析中的比较[J]. 浙江大学学报(农业与生命科学版),2019,45(3):278-287.
[13]张怀山,鄢秀芹,鲁敏,等. 基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析[J]. 中国农业科学,2017,50(6):1098-1108.
[14]吴晶,项显波,陆开形,等. 水稻超短根突变体ssr1的遗传分析和基因定位[J]. 西北植物学报,2015,35(4):701-706.
[15]单红丽,李文凤,黄应昆,等. 甘蔗抗褐锈病基因定位亲本间多态性SSR标记筛选[J]. 核农学报,2019,33(11):2119-2125.
[16]Dipnarayan S,Rajeev S R,Sukla C,et al. Development of a set of SSR markers for genetic polymorphism detection and interspecific hybrid jute breeding[J]. The Crop Journal,2017,5(5):416-429.
[17]Qi Z,Mu K M,Ni Z X,et al. Analysis of genetic diversity of ancient ginkgo populations using SSR markers[J]. Industrial Crops and Products,2020,145:111942.
[18]苏一钧,王娇,霍恺森,等. 甘薯引进种SSR遗传多样性分析[J]. 江苏农业学报,2018,34(5):984-997.
[19]张鹤山,陈志宏,田宏,等. 49份白三叶种质资源遗传多样性的SSR分析[J]. 种子,2019,38(11):1-6.

相似文献/References:

[1]戴金平,宋贤勇.基于SSR标记的“一管两步”法检测两系杂交稻种子纯度[J].江苏农业科学,2013,41(05):43.
 Dai Jinping,et al.Purity identification of two-line hybrid rice seeds by “one tube and two steps” based on SSR markers[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(21):43.
[2]钱荷英,张月华,郭锡杰,等.家蚕斑纹突变基因(q)的SSR标记定位分析[J].江苏农业科学,2013,41(07):15.
 Qian Heying,et al.Mapping analysis of quail (q) gene in Bombyx mori based on SSR markers[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(21):15.
[3]王波,彭宏,罗绪标,等.盐溶蛋白电泳和SSR标记鉴定苏玉20种子纯度的比较研究[J].江苏农业科学,2016,44(03):72.
 Wang Bo,et al.Comparative study on seed purity identification of corn “Suyu 20” using salt-soluble protein PAGE and SSR markers[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(21):72.
[4]张振良,郝德荣,陈国清,等.SSR标记在糯玉米品种鉴定上的应用[J].江苏农业科学,2016,44(06):104.
 Zhang Zhenliang,et al.Application of SSR molecular markers in authenticity identification of waxy maize varieties[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(21):104.
[5]陈祥,魏臻武,任海龙,等.聚丙烯酰胺凝胶电泳检测南苜蓿SSR标记[J].江苏农业科学,2015,43(11):382.
 Chen Xiang,et al.Detection of Medicago polymorpha SSR maker by polyacrylamide gel electrophorus[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(21):382.
[6]张羽,李小刚,王保军,等.常规SNPs-PCR在水稻遗传多样性研究中的应用[J].江苏农业科学,2016,44(09):28.
 Zhang Yu,et al.Application of conventional SNPs-PCR in rice genetic diversity[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(21):28.
[7]李勤霞,张萍.新疆野核桃F1表型性状与SSR标记连锁分析[J].江苏农业科学,2017,45(09):41.
 Li Qinxia,et al.Linkage analysis of phenotypic traits and SSR marker in Juglans regia F1 hybrids[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(21):41.
[8]杨国慧,范婷婷,陈效杰,等.树莓叶果中水杨酸含量测定及其抑菌性分析[J].江苏农业科学,2017,45(23):181.
 Yang Guohui,et al.Determination of salicylic acid contents in leaves and fruits of raspberry and its bacteriostatic analysis[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(21):181.
[9]王书珍,黄兴学,王斌才,等.生菜SSR遗传多样性及其与营养品质性状的关联分析[J].江苏农业科学,2018,46(24):161.
 Wang Shuzhen,et al.SSR genetic diversity of lettuce and its association with nutritional quality traits[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(21):161.
[10]杨峰,冉茂林,李晓梅,等.不同抽薹性萝卜遗传多样性的SSR分子标记分析[J].江苏农业科学,2019,47(04):123.
 Yang Feng,et al.Genetic diversity of radish(Raphanus sativus L.) with different bolting-resistance based on SSR markers[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(21):123.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2020-01-30
基金项目:国家自然科学基金(编号:31560079、31960074);贵州省科技支撑计划(编号:黔科合支撑[2018]2281);贵州省中医药、民族医药科学技术研究专项(编号:QZYY-2019-060);贵州省中药材现代产业技术体系建设项目(编号:GZCYTX-02)。
作者简介:邓宽平(1976—),男,贵州遵义人,硕士,副研究员,研究方向为中药材资源保存评价利用。E-mail:dkp2003@126.com。
通信作者:杨胜伟,硕士,农
更新日期/Last Update: 2020-11-05