|本期目录/Table of Contents|

[1]许哲,张晨光,张思远,等.二倍体和四倍体西瓜的转录组初步分析[J].江苏农业科学,2020,48(24):53-59.
　Xu Zhe,et al.Transcriptome analysis of diploid and tetraploid watermelon[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(24):53-59.
点击复制

二倍体和四倍体西瓜的转录组初步分析(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第48卷
期数:
2020年第24期
页码:
53-59
栏目:
生物技术
出版日期:
2020-12-30

文章信息/Info

Title:
Transcriptome analysis of diploid and tetraploid watermelon
作者:
许哲1;  张晨光2;  张思远2;  王先裕1;  高建昌2
1.广西大学，广西南宁 530001； 2.中国农业科学院蔬菜花卉研究所，北京 100081
Author(s):
Xu Zhe; et al
关键词:
多倍体; 西瓜; 转录组; 差异表达基因; GO富集分析; KEGG富集分析
Keywords:
-
分类号:
S651.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
植物染色体加倍后的表型变化与基因的表达密切相关。本研究对1份二倍体和3份四倍体西瓜材料进行转录组测序并分析差异表达基因。结果表明，二倍体和四倍体西瓜的差异表达基因显著富集的GO term为细胞氮化合物生物合成过程、光系统、半胱氨酸型内肽酶抑制剂活性、氧化还原酶活性以及类囊体等，KEGG富集分析中发现差异表达基因在光合作用、光合作用天线蛋白、叶绿素和卟啉代谢、乙醛酸和二羧酸代谢等通路较为活跃。二倍体和四倍体西瓜中高水平差异基因大都是上调表达，氧化应激蛋白、脱落酸受体、乙烯响应转录因子等差异表达基因可能是西瓜多倍体形成的关键因子，对相关基因的深入研究有助于解析植物倍性变化的分子机制。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］中华人民共和国农业部. 中国农业统计资料2016［M］. 北京：中国农业出版社，2017.
［2］姚娜，刘秀明，董园园，等. 转录组的测序方法及应用研究概述［J］. 北方园艺，2017(12)：192-198.
［3］Wechter W P，Levi A，Harris K R，et al. Gene expression in developing watermelon fruit［J］. BMC Genomics，2008，9：275.
［4］Guo S G，Liu J A，Zheng Y，et al. Characterization of transcriptome dynamics during watermelon fruit development-sequencing，assembly，annotation and gene expression profiles［J］. BMC Genomics，2011，12(1)：454.
［5］Zhu Q L，Gao P，Liu S，et al. Comparative transcriptome analysis of two contrasting watermelon genotypes during fruit development and ripening［J］. BMC Genomics，2017，18：3.
［6］龙娅丽，江雪飞，周鹏，等. 二倍体西瓜及其同源四倍体叶片sRNA表达谱分析［J］. 热带作物学报，2018，39(4)：661-668.
［7］王涛，陈孟龙，刘玲，等. 植物多倍体化中基因组和基因表达的变化［J］. 植物学报，2015，50(4)：504-515.
［8］Guo S G，Zhang J G，Sun H H，et al . The draft genome of watermelon (Citrullus lanatus) and resequencing of 20 diverse accessions［J］. Nat Genet，2013，45：51-58.
［9］Anders S，Huber W. Differential expression analysis for sequence count data［J］. Genome Biol，2010，11：1-12.
［10］Liu Y，Wei H B，Ma M D，et al. Arabidopsis FHY3 and FAR1 regulate the balance between growth and defense responses under shade conditions［J］. The Plant Cell，2019，31(9)：2089-2106.
［11］Young Matthew D，Wakefield M J，Smyth G K，et al. Gene ontology analysis for RNA-seq：accounting for selection bias［J］. Genome Biology，2010，11：R14.
［12］张少平，洪建基，邱珊莲，等. 紫背天葵高通量转录组测序分析［J］. 园艺学报，2016，43(5)：935-946.
［13］Kanehisa M，Arak M，Goto S，et al. KEGG for linking genomes to life and the environment［J］. Nucleic Acids Research，2008，36：480-484.
［14］Compton M E，Barnett N，Gray D J. Use of fluorescein diacetate (FDA) to determimne ploidy of in vitro watermelon shoots［J］. Plant Cell，Tissue and Organ Culture，1999，58：199-203.
［15］蔡力. 二倍体和四倍体紫锥菊中叶形态结构及其光合效率的比较研究［D］. 广东：华南农业大学，2016：35.
［16］王家利，王芳，郭小丽，等. 同源多倍体化效应研究进展［J］. 中国农学通报，2013，29(12)：22-29.
［17］施先锋，彭金光，李煜华，等. 西瓜多倍体鉴定方法的研究［J］. 浙江农业科学，2010(2)：273-274.

相似文献/References:

[1]高美玲,袁成志,王雅芳.西瓜果皮显微结构比较研究[J].江苏农业科学,2013,41(04):133.
[2]孙艳军,徐刚,韩冰,等.早佳8424 西瓜高产高效栽培技术[J].江苏农业科学,2013,41(04):138.
[3]褚姝频,龚伟荣,胡婕,等.江苏地区黄瓜绿斑驳花叶病毒病的发生概况与防控技术[J].江苏农业科学,2014,42(12):183.
　Chu Shupin,et al.Occurrence and control techniques of cucumber green mottle mosaic virus disease in Jiangsu area[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(24):183.
[4]侯茜,羊杏平,张曼,等.西瓜幼苗根系防御酶活性变化与枯萎病抗性的关系[J].江苏农业科学,2015,43(12):147.
　Hou Qian,et al.Relationship between root defense enzyme activity and fusarium wilt disease resistance of watermelon seedlings[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(24):147.
[5]石小兵,杨航,赵致,等.三叶木通的组织培养和多倍体诱导[J].江苏农业科学,2016,44(05):69.
　Shi Xiaobing,et al.Tissue culture and polyploid induction of Akebia trifoliata[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(24):69.
[6]葛长军,徐丽荣,闫良.西瓜产量相关性状的多元回归分析[J].江苏农业科学,2016,44(02):224.
　Ge Changjun,et al.Multivariate regression analysis of related traits of yield of watermelon fruit[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(24):224.
[7]刘露颖,赵喜亭,李明军.秋水仙碱诱导药用植物多倍体的研究进展[J].江苏农业科学,2014,42(04):178.
　Liu Luying,et al.Research progress of colchicine inducing medicinal polyploid plants[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(24):178.
[8]侯伟,杨福孙,李尚真,等.低温寡照对海南棚栽西瓜生长的影响及其灾害等级指标[J].江苏农业科学,2015,43(08):161.
　Hou Wei,et al.Effect of low temperature and low light on growth of greenhouse watermelon and its disaster grade indicators in Hainan area[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(24):161.
[9]王文英,刘喜存,董彦琪,等.不同生理指标对几个砧木嫁接西瓜效果的影响[J].江苏农业科学,2015,43(08):144.
　Wang Wenying,et al.Effect of several physiological characteristics on quality of different rootstock grafted watermelon[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(24):144.
[10]苏卫国,郭军,郑佳秋,等.西瓜与水生蔬菜水旱轮作模式栽培技术要点[J].江苏农业科学,2014,42(06):205.
　Su Weiguo,et al.Cultivation techniques of upland rotation mode of watermelon and aquatic vegetables[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(24):205.
[11]王静,乔飞,江雪飞,等.不同倍性西瓜原生质体制备与低温耐受性分析[J].江苏农业科学,2015,43(10):206.
　Wang Jing,et al.Protoplast preparation and low temperature tolerance of watermelons with different ploidy[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(24):206.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2020-03-18
基金项目：中国农业科学院科技工程创新项目(编号：CAAS-ASTIPIVFCAAS)；农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室项目。
作者简介：许哲(1994—)，男，广西南宁人，硕士研究生，主要从事西瓜遗传育种研究。E-mail：369474330@qq.com。
通信作者：高建昌，博士，副研究员，主要从事西瓜遗传育种研究。E-mail：gaojianchang@caas.cn。
更新日期/Last Update: 2020-12-20