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[1]牛鑫,冯九海,席亚丽,等.毛头鬼伞漆酶基因的预测及其生物信息学分析[J].江苏农业科学,2021,49(5):67-74.
　Niu Xin,et al.Prediction and bioinformatics analysis of laccase gene of Coprinus comatus[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(5):67-74.
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毛头鬼伞漆酶基因的预测及其生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第5期
页码:
67-74
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-03-05

文章信息/Info

Title:
Prediction and bioinformatics analysis of laccase gene of Coprinus comatus
作者:
牛鑫; 冯九海; 席亚丽; 宋利茹; 梁倩倩; 单华佳; 陈艳霞; 柯善文; 柴倩囡; 魏生龙
河西学院甘肃省应用真菌工程实验室/甘肃省食用菌遗传育种重点实验室/祁连山食用菌产业协同创新中心，甘肃张掖 734000
Author(s):
Niu Xin; et al
关键词:
毛头鬼伞; 基因预测; 生物信息学; 序列分析; 三维结构
Keywords:
-
分类号:
S188
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
毛头鬼伞培养液具有较强的漆酶活性，漆酶在基质中木质素的降解和子实体的发育中发挥着重要作用。目前，人们已经完成毛头鬼伞基因组的测序，且数据已经释放至公共数据库中，但并未注释。为了掌握毛头鬼伞中漆酶的基因数量及其特征，基于已报道的毛头鬼伞漆酶蛋白的氨基酸序列，通过同源预测的方法从其基因组上预测获得21个漆酶基因，并采用ProtParam、SignalP 5.0、Sompa、TMHMM 2.0、SWISS-MODEL和WoLF PSORT等生物信息学工具对其中20个相应漆酶蛋白进行预测，分析其基本理化特性、信号肽、二级结构、跨膜结构、三级结构和亚细胞定位等。研究结果可为毛头鬼伞漆酶基因的克隆及分子作用机制等研究提供参考。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2020-07-04
基金项目：河西学院科研创新与应用校长基金(编号：XZ2017006、XZZX2020006)；甘肃省高等学校创新基金(编号：2020A-104)；甘肃省高校协同创新科技团队支持计划(编号：2016C-02)；国家自然科学基金地区基金(编号：31660590)；甘肃省引导科技创新发展专项(编号：2017zx-10)。
作者简介：牛鑫(1988—)，男，甘肃通渭人，博士，副研究员，主要从事菌物生物信息学、菌物资源以及真菌细胞壁研究。E-mail：niuxin1988@126.com。
通信作者：魏生龙，教授，主要从事食用菌研究。Tel：(0936)8829884；E-mail：zywsw0281@163.com。
更新日期/Last Update: 2021-03-05