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[1]何雨航,杜易桓,郭昊,等.水稻OsENOD93b基因组织表达模式与生物信息学分析[J].江苏农业科学,2021,49(7):67-71.
 He Yuhang,et al.Tissue expression pattern and bioinformatics analysis of OsENOD93b gene in rice[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(7):67-71.
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水稻OsENOD93b基因组织表达模式与生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第7期
页码:
67-71
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-04-05

文章信息/Info

Title:
Tissue expression pattern and bioinformatics analysis of OsENOD93b gene in rice
作者:
何雨航杜易桓郭昊赵頔马银花
湖南人文科技学院农业与生物技术学院/农田杂草防控技术与应用协同创新中心,湖南娄底 417000
Author(s):
He Yuhanget al
关键词:
水稻ENODOsENOD93b组织表达模式分析生物信息学
Keywords:
-
分类号:
Q78
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
主要探究OsENOD93b基因在水稻中的组织表达模式,并对其作生物信息学分析。采用实时荧光定量PCR技术分析OsENOD93b基因的表达模式。用ExPASy-Protparam、Protscale、CDD、SOPMA、Phyre 2、Psort等在线工具对OsENOD93b进行生物信息学分析。经组织表达模式分析可知,OsENOD93b基因在叶片中的含量最多,其次是茎,含量最少的为根。通过ExPASy-Protparam分析发现,OsENOD93b分子量为16.429 89 ku,是一种具有亲水性的不稳定的碱性蛋白。该蛋白属于ENOD93超级家族。通过SOPMA在线软件对OsENOD93b蛋白的二级结构进行分析预测,发现其由无规则卷曲(41.56%)、α-螺旋(39.61%)、延伸链区(14.94%)和β-转角(3.90%)4种形式组成。此外,利用不同在线工具对OsENOD93b蛋白的三级结构、保守区域、亚细胞定位进行生物信息学分析。结果表明,OsENOD93b基因在进化过程中具有一定的保守性,并有多样的潜在功能待研究。研究结果为进一步探明OsENOD93b基因的生物学功能提供了依据。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2020-08-25
基金项目:湖南省自然科学基金(编号:2019JJ50281);湖南省教育厅项目(编号:18B455);国家级大学生创新创业训练计划平台项目(编号:201910553027X )。
作者简介:何雨航(1999—),女,湖南邵阳人,主要从事水稻遗传及转基因方面的研究。E-mail:1835147713@qq.com。
通信作者:马银花,博士,讲师,主要从事水稻遗传及转基因方面的研究。E-mail:mayinhua1988@126.com。
更新日期/Last Update: 2021-04-05