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[1]李辉玲,董洁,张国儒,等.色素辣椒InDel-PCR反应体系优化及引物筛选[J].江苏农业科学,2021,49(18):72-76.
　Li Huiling,et al.Optimization and primer screening of InDel-PCR reaction system for pigment pepper[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(18):72-76.
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色素辣椒InDel-PCR反应体系优化及引物筛选(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第49卷
期数:
2021年第18期
页码:
72-76
栏目:
生物技术
出版日期:
2021-09-20

文章信息/Info

Title:
Optimization and primer screening of InDel-PCR reaction system for pigment pepper
作者:
李辉玲1;  董洁1;  张国儒2;  火顺利1;  叶远荣1;  杜珊珊1;  张建文1
1.巴音郭楞蒙古自治州农业科学研究院，新疆库尔勒 841000； 2.新疆农业科学院园艺作物研究所，新疆乌鲁木齐 830091
Author(s):
Li Huiling; et al
关键词:
色素辣椒; InDel-PCR; 反应体系; 引物筛选; 扩增产物; 参数优化
Keywords:
-
分类号:
S641.303
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为建立和优化色素辣椒的InDel标记PCR反应体系，筛选多态性良好且重复性高的引物，为InDel分子标记在色素辣椒辅助育种、品种纯度鉴定及遗传多样性分析等提供可靠的技术支持。采用正交试验、单因素试验方法，对影响扩增体系中的模板DNA用量、引物浓度、2×Taq PCR Mix添加量等参数进行3因素4水平的正交试验比较分析，对循环数进行单因素试验优化分析。结果表明，对InDel-PCR体系扩增结果的影响程度中引物浓度最大，其次是模板DNA用量，而2×Taq PCR Mix添加量的影响不大。根据检测结果，出于成本和模板DNA用量的考虑，确定最佳InDel-PCR反应体系(10 μL)：模板DNA用量为35 ng、引物浓度为0.5 μmol/L、2×Taq PCR Mix添加量为5 μL。扩增程序：94 ℃预变性3 min；94 ℃变性30 s，退火30 s，72 ℃变性60 s，35个循环；72 ℃变性5 min；扩增产物在4 ℃保存。从240对InDel通用引物中最终筛选出14对适用于色素辣椒InDel-PCR候选引物。InDel标记是基于PCR的分子技术，选择适宜的引物及模板DNA浓度对扩增出清晰、稳定的条带很重要，优化后的10 μL InDel-PCR反应体系及扩增程序，成功筛选出14条多态性较高的InDel引物，为后续的色素辣椒分子标记研究提供了可靠技术依据。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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[2]李辉玲,张国儒,曾卫东,等.基于InDel标记的新疆色素辣椒遗传多样性及聚类分析[J].江苏农业科学,2021,49(17):67.
　Li Huiling,et al.Genetic diversity and clustering analysis of Xinjiang pigment pepper based on InDel markers[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(18):67.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2020-12-30
基金项目：巴州财政支持基本科研业务经费(编号：202008、202104)。
作者简介：李辉玲(1988—)，女，甘肃兰州人，硕士，助理研究员，主要从事特色作物的育种与栽培。E-mail：12354399@qq.com。
通信作者：张建文，硕士，副研究员，主要从事番茄、色素辣椒等作物的育种与栽培。E-mail：1220743143@qq.com。
更新日期/Last Update: 2021-09-20