«上一篇/Previous Article|本期目录/Table of Contents|下一篇/Next Article»

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第49卷

期数:

2021年第20期

页码:

64-69

栏目:

生物技术

出版日期:

2021-11-01

文章信息/Info

Title:

Interpretation of important miRNAs and target genes for maize resistance and susceptibility to rough dwarf disease

作者:

吴斌¹; 崔汉青²; 张眉¹; 邵春国²; 姜珊珊¹; 郭霞¹; 徐德坤³; 王升吉¹

1.山东省农业科学院植物保护研究所/山东省植物病毒学重点实验室，山东济南 250100； 2.山东省平度市职业中等专业学校，山东平度 266752； 3.山东省临沂市农业技术推广服务中心，山东临沂 276000

Author(s):

Wu Bin; et al

关键词:

玉米粗缩病; 差异miRNA; 高通量测序; 靶基因; 富集分析

Keywords:

-

分类号:

S435.13

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

借助高通量测序和生物学分析手段，筛选不同抗性品种间的差异表达miRNA，预测相关靶基因。对玉米抗、感粗缩病不同种质材料高通量测序鉴定出的差异miRNA的靶基因，在Genome、Gene Ontology等生物信息数据库中进行比对，同时做GO(Gene Ontology，简称GO)、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，简称KEGG)富集性分析。从某些相关差异miRNA的靶基因及其作用位点的有关GO ID及其生物学功能注释中，发现一些可能与玉米粗缩病抗性有较大关系的miRNA，如zma-miR156a、zma-miR156k、zma-miR1432等；通过进一步的miRNA靶基因KEGG富集性分析，获得代谢通路ID，根据其生物功能注释，推测也有一定数量的miRNA与玉米种质抗(感)病相关。结合所涉差异miRNA在玉米抗、感种质接毒前后上、下调的表现，对这些重要miRNA靶基因可能涉及粗缩病的致病机制或玉米抗性相关的GO ID、KEGG通路ID所蕴含的功能进行了诠释。研究旨在探明抗病相关miRNA通过靶向作用其靶基因，在抗病过程中可能发挥的重要生物学功能和作用途径，研究结果可为探讨玉米抗粗缩病的抗病机制研究奠定理论基础。

Abstract:

-

参考文献/References:

［1］孙晓民，韩成卫，曾苏明，等. 玉米粗缩病发生规律与防控对策［J］. 吉林农业科学，2010，35(5)：31-33.
［2］陈佳，朱芹芹，袁从阳，等. 引起玉米粗缩病的水稻黑条矮缩病病毒山东分离物的分子特性［J］. 植物病理学报，2008，38(5)：540-543.
［3］王升吉，张恒木，赵玖华，等. 山东玉米粗缩病原S10序列分析［J］. 玉米科学，2013，21(6)：26-30.
［4］Carrington J C，Ambros V. Role of microRNAs in plant and animal development［J］. Science，2003，301(5631)：336-338.
［5］Wu J G，Yang Z R，Wang Y，et al. Viral-inducible Argonaute18 confers broad-spectrum virus resistance in rice by sequestering a host microRNA［J］. Elife，2015，4：e05733.
［6］任春梅，杨柳，刘保申，等. 一种高通量玉米粗缩病人工接种鉴定方法的建立及应用［J］. 玉米科学，2018，26(2)：142-148.
［7］施艳，韩晓玉，刘焱昆，等. 河南省玉米粗缩病抗病品种鉴定及病害与产量的相关性分析［J］. 河南科学，2020，38(2)：208-211.
［8］Liu H J，Wei C H，Zhong Y W，et al. Rice black-streaked dwarf virus minor core protein P8 is a nuclear dimeric protein and represses transcription in tobacco protoplasts［J］. FEBS Letters，2007，581(13)：2534-2540.
［9］黄强. 玉米粗缩病症与内源激素水平变化的关系研究［D］. 成都：四川农业大学，2010.
［10］杨青，郝俊杰，王新涛，等. 玉米粗缩病抗病基因定位和抗病育种研究进展［J］. 分子植物育种，2020，18(12)：4021-4028.
［11］Peng D，Wu J G，Zhang J Y，et al. Viral infection induces expression of novel phased microRNAs from conserved cellular microRNA precursors［J］. PLoS Pathogens，2011，7(8)：e1002176.
［12］Xu D L，Mou G P，Wang K，et al. MicroRNAs responding to southern rice black streaked dwarf virus infection and their target genes associated with symptom development in rice［J］. Virus Research，2014，190(9)：60-68.
［13］李荣改，陆艳梅，王月影，等. 玉米粗缩病的分子研究新进展［J］. 植物学报，2017，52(3)：375-387.
［14］Zhou Y，Xu Z N，Duan C X，et al. Dual transcriptome analysis reveals insights into the response to rice black-streaked dwarf virus in maize［J］. Journal of Experimental Botany，2016，67(15)：4593-4609.
［15］雷凯键，刘浩. 植物调控枢纽miR156及其靶基因SPL家族研究进展［J］. 生命的化学，2016，36(1)：13-20.
［16］Wang J W，Czech B，Weigel D. MiR156-regulated SPL transcription factors define an endogenous flowering pathway in Arabidopsis thaliana［J］. Cell，2009，138(4)：738-749.
［17］朱早兵，虞夏清，翟于菲，等. 黄瓜microRNA171的克隆与功能分析［J］. 园艺学报，2019，46(5)：864-876.
［18］Li Z X，Li S G，Zhang L F，et al. Over-expression of miR166a inhibits cotyledon formation in somatic embryos and promotes lateral root development in seedlings of Larix leptolepis［J］. Plant Cell，Tissue and Organ Culture，2016，127(2)：461-473.

相似文献/References:

[1]杜琳琳,吕建颖,曹晓燕,等.玉米品种抗粗缩病人工接种鉴定方法研究[J].江苏农业科学,2017,45(17):93.
　Du Linlin,et al.Study on identification method of artificial inoculation of maize varieties against rough dwarf disease[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(20):93.

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2021-02-11
基金项目：山东省重点研发计划(编号：2018GSF121029)；国家重点研发计划(编号：2018YFD0200603)；山东省农业科学院农业科学创新工程(编号：CXGC2016B11-绿色防控)。
作者简介：吴斌(1986—)，男，山东临清人，博士，助理研究员，主要从事植物病毒学研究。E-mail：wubin228@126.com。
通信作者：王升吉，硕士，研究员，主要从事植物病毒学研究。E-mail：shjiw@163.com。

常用功能

更新日期/Last Update: 2021-10-20