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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第50卷

期数:

2022年第12期

页码:

34-41

栏目:

生物技术

出版日期:

2022-06-20

文章信息/Info

Title:

Comparative study on mitochondrial genomes in Reduviidae

作者:

赵婉清; 李巧; 李莹; 杨柳; 郑茜之; 张虎芳

忻州师范学院生物系，山西忻州 034000

Author(s):

Zhao Wanqing; et al

关键词:

猎蝽科; 线粒体基因组; 比较基因组学; 系统发育; 分子标记; 基因重排; 碱基组成; 密码子使用偏好性

Keywords:

-

分类号:

S433.3

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

线粒体基因组是系统发育常用的分子标记，本研究旨在对猎蝽科昆虫的线粒体基因组进行比较研究，着重分析基因重排、碱基组成、密码子使用偏好性等特征，并构建基于13个蛋白编码基因的系统发育关系。在GenBank数据库下载猎蝽科11亚科30属代表物种的线粒体基因组序列，通过Geneious 8.0.4抽提各编码基因的序列。利用MEGA 7.0统计碱基组成、氨基酸和核苷酸序列信息位点、起始密码子、终止密码子、相对密码子使用频率(RSCU)等序列基本信息。另外，利用DnaSP 6.0计算蛋白编码基因的非同义替换率(K_a)和同义替换率(K_s)，并通过K_a/K_s值比较基因的核苷酸进化速率。通过jModelTest选择进化模型，在MrBayes 3.2.2软件中构建基于贝叶斯法(BI)的系统发育树。结果表明：猎蝽科线粒体基因组均呈共线性结构，没有发现大面积的基因重排现象，只有部分序列中rrnS和trnT基因编码方向与原始序列编码方向相反，trnR和cytb基因出现多拷贝的现象。猎蝽科线粒体最常使用ATN起始密码子和TAA终止密码子。BI系统发育树对猎蝽科各亚科之间的关系进行了一定的解析，光猎蝽亚科(Ectrichodiinae)和猎蝽亚科(Reduviinae)为并系群，真猎蝽亚科(Harpactorinae)和锥猎蝽亚科(Triatominae)为单系群。本研究为猎蝽科昆虫的线粒体基因组进行了比较分析，为后续研究该科系统发生关系奠定了科学基础。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2021-11-23
基金项目：山西省高等学校科技创新项目(编号：2019L09841)；忻州师范学院院级科研基金(编号：2018KY04)。
作者简介：赵婉清(1989—)，女，山西灵石人，博士，主要从事昆虫分子系统学研究。E-mail：zhaowanqing@vip.163.com。
通信作者：张虎芳，博士，教授，主要从事昆虫分子系统学研究。E-mail：zh_hufang@sohu.com。

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更新日期/Last Update: 2022-06-20