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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第51卷

期数:

2023年第8期

页码:

51-61

栏目:

生物技术

出版日期:

2023-04-20

文章信息/Info

Title:

Genome-wide identification and analysis of oxidation resistance genes in Cucurbitacea plants

作者:

钱玉磊¹; 2; 闫晋强¹; 刘文睿¹; 吴智明²; 谢大森¹; 江彪¹

1.广东省农业科学院蔬菜研究所/广东省蔬菜新技术研究重点实验室，广东广州 510640；2.仲恺农业工程学院园艺园林学院，广东广州 510225

Author(s):

Qian Yulei; et al

关键词:

葫芦科; OXR基因; 保守结构域; 顺式作用元件; 生物信息学; 表达谱; 亲缘关系

Keywords:

-

分类号:

S188；S642.01

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

抗氧化(oxidation resistance，OXR)基因是含有TLDc结构域的一类基因，能有效清除活性氧，在抗氧化过程中发挥着重要作用。基于葫芦科基因组数据库，从6个葫芦科作物中共鉴定出37个OXR成员，其中冬瓜、西瓜、甜瓜、葫芦和黄瓜均有6个成员，南瓜有7个成员。通过系统发育以及保守结构域分析，将这些OXR成员分为 5个亚族：OXR1、OXR2、OXR3、OXR4和OXR5。OXR基因在染色体上呈不均匀分布，同一亚族OXR成员所编码的氨基酸数、分子量、外显子数、内含子数以及保守基序的排列模式都极为相似，表明OXR基因具有高度保守性。顺式作用元件分析结果显示，OXR基因的启动子区域含有多种顺式作用元件以及MYB转录因子的结合位点。基因复制分析发现，葫芦科OXR2成员通过片段复制或全基因组复制发生了一定扩张，这些复制基因对均受到纯化选择。共线性分析结果显示，在亲缘关系较近的葫芦科作物之间，OXR基因所在的共线性区块较大。不同组织的表达谱分析结果显示，葫芦科OXR4成员有相似的表达模式，在叶片中表达量均较高；OXR2亚族内复制基因出现了非对称表达的现象。

Abstract:

-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2022-06-22
基金项目：国家自然科学基金(编号：31972403、32102406)；广东省农业科学院中青年学科带头人项目(编号：R2020PY-JG003)；广东省农业科学院优秀博士项目(编号：R2021YJ-YB2004)。
作者简介：钱玉磊(1997—)，男，河南郑州人，硕士研究生，研究方向为蔬菜分子生物学。E-mail：qylei2022@163.com。
通信作者：江彪，博士，研究员，研究方向为蔬菜遗传育种与分子生物学。E-mail：jiangbiao@gdaas.cn。

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更新日期/Last Update: 2023-04-20