|本期目录/Table of Contents|

[1]徐凯祥,焦玚,王帅帅,等.陆地棉GhRTE基因家族的鉴定与耐盐性分析[J].江苏农业科学,2024,52(6):52-60.
　Xu Kaixiang,et al.Identification and salt tolerance analysis of GhRTE gene family in Gossypium hirsutum[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2024,52(6):52-60.
点击复制

陆地棉GhRTE基因家族的鉴定与耐盐性分析(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第52卷
期数:
2024年第6期
页码:
52-60
栏目:
生物技术
出版日期:
2024-03-20

文章信息/Info

Title:
Identification and salt tolerance analysis of GhRTE gene family in Gossypium hirsutum
作者:
徐凯祥; 焦玚; 王帅帅; 陈全家; 郑凯
新疆农业大学农学院/棉花教育部工程研究中心，新疆乌鲁木齐830052
Author(s):
Xu Kaixiang; et al
关键词:
陆地棉; RTE基因家族; 非生物胁迫; 表达特性分析; 耐盐性
Keywords:
-
分类号:
S562.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
RTE(reversion-to-ethylene)是一种植物乙烯响应的负调节因子，参与植物生长发育并在非生物胁迫的逆境中起着重要作用。通过对陆地棉(Gossypium hirsutum)RTE家族成员的鉴定及其在盐胁迫下的表达模式进行解析，为进一步探索棉花RTE家族成员的功能提供一定的研究指导。通过棉花全基因组数据，鉴定棉花RTE家族成员，以陆地棉为主要研究对象，结合海岛棉(Gossypium barbadense)、亚洲棉(Gossypium arboreum)、雷蒙德氏棉(Gossypium raimondii)等植物的RTE基因家族成员进行物种内的进化分析。同时，利用转录组学方法，研究陆地棉RTE家族基因的表达量及其对盐胁迫的应答规律。结果表明，棉花RTE蛋白家族共鉴定出24个RTE基因，其中来自陆地棉和海岛棉的各有8个，有4个来自雷蒙德氏棉，4个来自亚洲棉。系统发育树分析将24个RTE基因分成3个亚族，GhRTE基因同一亚族成员间具有相似的基因结构和保守基序。GhRTE启动子区包含了许多与植物激素反应、生长发育和逆境应答密切相关的顺式调控因子。通过对转录组数据分析以及荧光定量分析，初步验证该家族GhRTE6基因可能在棉花生长发育以及盐胁迫响应中发挥作用，可为阐明GhRTE基因耐盐的分子机制提供理论依据。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］李建，黄琳丽. 乙烯在植物抗性反应中的作用［J］. 生物化工，2020，6(6)：140-142.
［2］周欣，张杰，文光. RTE1：拟南芥乙烯受体ETR1的调节子［C］//2006年中国植物逆境生理生态与分子生物学学术研讨会论文摘要汇编.上海：中国植物生理学会，2006.
［3］Lacape J M，Nguyen T B，Courtois B，et al. QTL analysis of cotton fiber quality using multiple Gossypium hirsutum×Gossypium barbadense backcross generations［J］. Crop Science，2005，45(1)：123-140.
［4］Chartzoulakis K，Klapaki G. Response of two greenhouse pepper hybrids to NaCl salinity during different growth stages［J］. Scientia Horticulturae，2000，86(3)：247-260.
［5］张超，马晓丽，卢晓峰，等. 盐分胁迫下土施甲哌钅翁对棉苗叶片生理和根系形态的影响［J］. 江苏农业科学，2022，50(22)：81-86.
［6］Sexton P D，Gerard C J. Emergence force of cotton seedlings as influenced by salinity［J］. Agronomy Journal，1982，74(4)：699-702.
［7］熊丽. 2022年全国棉花产量增长4.3%［N］. 经济日报，2022-12-27(4).
［8］石婧，黄超，刘娟，等. 脱硫石膏不同施用量对新疆盐碱土壤改良效果及作物产量的影响［J］. 环境工程学报，2018，12(6)：1800-1807.
［9］王俊铎，黎玉华，龚照龙，等. 棉花耐盐性研究进展［J］. 棉花科学，2021，43(5)：3-10.
［10］范蓉，郭亚萍，赵柯柯，等. 旱、盐胁迫下棉花3个转录因子基因的表达与生理指标相关性分析［J］. 生物学杂志，2021，38(4)：86-91.
［11］郑巨云，曾辉，王俊铎，等. 陆地棉品种资源萌发期耐盐性的隶属函数法评价［J］. 新疆农业科学，2018，55(9)：1579-1592.
［12］王亦学，董艳辉，张欢欢，等. 陆地棉胁迫相关蛋白基因GhSAP8的克隆及其耐盐性分析［J］. 农业生物技术学报，2020，28(7)：1230-1239.
［13］Zhu T，Liang C Z，Meng Z G，et al. CottonFGD：an integrated functional genomics database for cotton［J］. BMC Plant Biology，2017，17(1)：101-113.
［14］Wilkins M R，Gasteiger E，Bairoch A，et al. Protein identification and analysis tools in the ExPASy server［J］. Methods in Molecular Biology，1999，112：531-552.
［15］陈琴，李多露，赵杰银，等. 陆地棉UDPGP基因家族的鉴定及抗旱性分析［J］. 棉花学报，2022，34(1)：12-22.
［16］Kumar S，Stecher G，Li M，et al. MEGA X：molecular evolutionary genetics analysis across computing platforms［J］. Molecular Biology and Evolution，2018，35(6)：1547-1549.
［17］Subramanian B，Gao S H，Lercher M J，et al. Evolview v3：a webserver for visualization，annotation，and management of phylogenetic trees［J］. Nucleic Acids Research，2019，47(W1)：W270-W275.
［18］Chen C J，Chen H，Zhang Y，et al. TBtools：an integrative toolkit developed for interactive analyses of big biological data［J］. Molecular Plant，2020，13(8)：1194-1202.
［19］Yu J，Jung S，Cheng C H，et al. CottonGen：a genomics，genetics and breeding database for cotton research［J］. Nucleic Acids Research，2014，42(D1)：D1229-D1236.
［20］ODriscoll A，Belogrudov V，Carroll J，et al. HBLAST：parallelised sequence similarity：a Hadoop MapReducable basic local alignment search tool［J］. Journal of Biomedical Informatics，2015，54：58-64.
［21］Wang Y P，Tang H B，Debarry J D，et al. MCScanX：a toolkit for detection and evolutionary analysis of gene synteny and collinearity［J］. Nucleic Acids Research，2012，40(7)：e49.
［22］陈琴，李多露，高文举，等. 陆地棉APX基因家族鉴定及抗旱性分析［J］. 农业生物技术学报，2021，29(10)：1894-1903.
［23］Bailey T L，Boden M，Buske F A，et al. MEME SUITE：tools for motif discovery and searching［J］. Nucleic Acids Research，2009，37：W202-W208.
［24］Lescot M，Déhais P，Thijs G，et al. PlantCARE，a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences［J］. Nucleic Acids Research，2002，30(1)：325-327.
［25］Zhang T Z，Hu Y，Jiang W K，et al. Sequencing of allotetraploid cotton (Gossypium hirsutum L. acc. TM-1) provides a resource for fiber improvement［J］. Nature Biotechnology，2015，33(5)：531-537.
［26］Livak K J，Schmittgen T D.Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2-ΔΔCT method［J］. Methods，2001，25(4)：402-408.
［27］张岚，程琦，梁士辰，等. 棉花UGPase基因鉴定与生物信息学分析［J］. 棉花学报，2021，33(4)：337-346.
［28］Tan Y Y，Liu J X，Huang F，et al. PhGRL2 protein，interacting with PhACO1，is involved in flower senescence in the petunia［J］. Molecular Plant，2014，7(8)：1384-1387.
［29］张朵朵，林丽梅，国红玉，等. 人参与三七鲨烯环氧酶家族的适应性进化［J］. 华北理工大学学报(自然科学版)，2022，44(1)：98-106.
［30］Dong C H，Jang M，Scharein B，et al. Molecular association of the Arabidopsis ETR1 ethylene receptor and a regulator of ethylene signaling，RTE1［J］. The Journal of Biological Chemistry，2010，285(52)：40706-40713.
［31］Barry C S，Giovannoni J J. Ripening in the tomato Green-ripe mutant is inhibited by ectopic expression of a protein that disrupts ethylene signaling［J］. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，2006，103(20)：7923-7928.
［32］Dong C H，Rivarola M，Resnick J S，et al. Subcellular co-localization of Arabidopsis RTE1 and ETR1 supports a regulatory role for RTE1 in ETR1 ethylene signaling［J］. The Plant Journal，2008，53(2)：275-286.
［33］Shi J R，Drummond B J，Wang H Y，et al. Maize and Arabidopsis ARGOS proteins interact with ethylene receptor signaling complex，supporting a regulatory role for ARGOS in ethylene signal transduction［J］. Plant Physiology，2016，171(4)：2783-2797.
［34］Shi J R，Habben J E，Archibald R L，et al. Overexpression of ARGOS genes modifies plant sensitivity to ethylene，leading to improved drought tolerance in both Arabidopsis and maize［J］. Plant Physiology，2015，169(1)：266-282.

相似文献/References:

[1]王志军,谢宗铭,董永梅,等.棉花陆海杂交亲本及子代光合叶绿素荧光参数分析[J].江苏农业科学,2016,44(05):134.
　Wang Zhijun,et al.Analysis of photosynthetic chlorophyll fluorescence parameters of parents and child generation of interspecific hybrid cotton[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(6):134.
[2]邓琳,刘静,张咪,等.基于黄褐棉导入系的抗黄萎病QTL鉴定分析[J].江苏农业科学,2018,46(15):68.
　Deng Lin,et al.Identification of QTL for resistance to Vertioillium wilt based on introgression lines of Gossypium mustelinum[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(6):68.
[3]马亮,李飞,张金宝,等.不同陆地棉品种花芽分化与茎尖内源激素的关系[J].江苏农业科学,2018,46(16):71.
　Ma Liang,et al.Relationship between flower bud differentiation and shoot tip endogenous hormones of different upland cotton varieties[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(6):71.
[4]蔡继鸿,徐鹏,张香桂,等.盐胁迫下陆地棉耐盐相关WRKY基因的表达分析[J].江苏农业科学,2018,46(18):28.
　Cai Jihong,et al.Analysis of salt-tolerant WRKY genes expression in upland cotton under salt stress[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(6):28.
[5]邓惠清,唐灿明,刘正銮,等.陆地棉空间诱变SP1～SP3主要性状变异分析[J].江苏农业科学,2020,48(12):64.
　Deng Huiqing,et al.Study on variation of main traits of upland cotton space mutation SP1~SP3[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(6):64.
[6]刘剑光,赵君,徐剑文,等.200份陆地棉种质资源的遗传多样性分析[J].江苏农业科学,2021,49(14):66.
　Liu Jianguang,et al.Genetic diversity analysis on 200 upland cotton germplasm resources[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(6):66.
[7]刘文豪,田琴,余渝,等.陆地棉CNGC全基因组鉴定及表达分析[J].江苏农业科学,2021,49(24):49.
　Liu Wenhao,et al.Genome identification and expression analysis of CNGC in Gossypium hirsutum[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2021,49(6):49.
[8]李娟,周小凤,刘文豪,等.42个早熟陆地棉产量与品质性状的多样性分析[J].江苏农业科学,2022,50(2):73.
　Li Juan,et al.Diversity analysis of yield and quality traits of 42 early-maturing upland cotton cultivars[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(6):73.
[9]邓惠清,苏锦其,姜利农,等.陆地棉芽黄隐性核雄性不育系Yt30的选育[J].江苏农业科学,2022,50(18):313.
　Deng Huiqing,et al.Breeding of virescent recessive nuclear male sterile line Yt30 in upland cotton[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(6):313.
[10]吴珂,余渝,何良荣,等.陆地棉品质和产量性状配合力及杂种优势分析[J].江苏农业科学,2023,51(6):67.
　Wu Ke,et al.Combining ability and heterosis analysis of quality and yield characters of upland cotton[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(6):67.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2023-05-29
基金项目：新疆维吾尔自治区重大科技专项(编号：2022A03004-2)。
作者简介：徐凯祥(1995—)，男，甘肃兰州人，硕士研究生，研究方向为棉花耐盐性。E-mail：965762115@qq.com。
通信作者：陈全家，博士，教授，博士生导师，从事棉花遗传育种研究，E-mail：chenqjia@126.com；郑凯，博士，副教授，从事棉花种质资源优异基因挖掘和分子育种研究，E-mail：zhengkai555@126.com。
更新日期/Last Update: 2024-03-20