[1]马明臻.草莓MADS-box基因家族生物信息学分析[J].江苏农业科学,2015,43(11):21-25.
　Ma Mingzhen.Genome-wide bioinformatics analysis of MADS-box gene family in strawberry[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(11):21-25.
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草莓MADS-box基因家族生物信息学分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第43卷
期数:
2015年11期
页码:
21-25
栏目:
生物技术
出版日期:
2015-11-25

文章信息/Info

Title:
Genome-wide bioinformatics analysis of MADS-box gene family in strawberry
作者:
马明臻
潍坊科技学院，山东寿光 262700
Author(s):
Ma Mingzhen
关键词:
草莓; MADS-box转录因子; 基因家族; 生物信息学
Keywords:
-
分类号:
S668.403
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
通过生物信息学的方法，利用拟南芥、水稻的MADS-box基因对草莓MADS-box基因家族进行鉴定和分析，共得到83个草莓MADS-box候选基因，且MADS-box结构域高度保守。进化分析表明，FvMADS1-FvMADS33可被细分为10个亚组，分别为AG、AGL12、AGL6、AGL2、SE、SVP、FLC、AP3、SOC1、AGL17；FvMADS34-FvMADS83可被细分为4个亚组，分别为Mα(22个成员)、Mβ(1个成员)、Mγ(17个成员)、Mδ(10个成员)。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］赵密珍，王静，王壮伟，等. 世界草莓产业发展现状及江浙沪草莓产业可持续发展对策［J］. 江苏农业科学，2012，40(2)：1-3.
［2］张雯丽. 中国草莓产业发展现状与前景思考［J］. 农业展望，2012，8(2)：30-33.
［3］Messenguy F，Dubois E. Role of MADS box proteins and their cofactors in combinatorial control of gene expression and cell development［J］. Gene，2003，316：1-21.
［4］Henschel K，Kofuji R，Hasebe M，et al. Two ancient classes of MIKC-type MADS-box genes are present in the moss Physcomitrella patens［J］. Molecular Biology and Evolution，2002，19(6)：801-814.
［5］Kaufmann K，Melzer R，Theissen G. MIKC-type MADS-domain proteins：structural modularity，protein interactions and network evolution in land plants［J］. Gene，2005，347(2)：183-198.
［6］Parenicová L，De F S，Kieffer M，et al. Molecular and phylogenetic analyses of the complete MADS-box transcription factor family in Arabidopsis：new openings to the MADS world［J］. The Plant Cell，2003，15(7)：1538-1551.
［7］Arora R，Agarwal P，Ray S，et al. MADS-box gene family in rice：genome-wide identification，organization and expression profiling during reproductive development and stress［J］. BMC Genomics，2007，8：242.
［8］Weigel D，Meyerowitz E M. The ABCs of floral homeotic genes［J］. Cell，1994，78(2)：203-209.
［9］Ma H，Depamphilis C. The ABCs of floral evolution［J］. Cell，2000，101(1)：5-8.
［10］Shulaev V，Sargent D J，Crowhurst R N，et al. The genome of woodland strawberry(Fragaria vesca)［J］. Nature Genetics，2011，43(2)：109-116.
［11］Tian Y，Dong Q，Ji Z，et al. Genome-wide identification and analysis of the MADS-box gene family in apple［J］. Gene，2015，555(2)：277-290.
［12］董庆龙，冀志蕊，迟福梅，等. 苹果MADS-box转录因子的生物信息学及其在不同组织中的表达［J］. 中国农业科学，2014，47(6)：1151-1161.
［13］董庆龙，王海荣，安淼，等. 苹果NADP依赖的苹果酸酶基因克隆、序列和表达分析［J］. 中国农业科学，2013，46(9)：1857-1866.
［14］张春华，上官凌飞，俞明亮，等. 桃NAC基因家族生物信息学分析［J］. 江苏农业学报，2012，30(2)：406-414.
［15］葛安静，张春华，董清华，等. 草莓SBP基因家族生物信息学初步分析［J］. 中国农学通报，2012，28(13)：215-220.
［16］Leseberg C H，Li A，Kang H，et al. Genome-wide analysis of the MADS-box gene family in Populus trichocarpa［J］. Gene，2006，378：84-94.
［17］Díaz R J，Lijavetzky D，Martínez Z J M，et al. Genome-wide analysis of MIKCC-type MADS box genes in grapevine［J］. Plant Physiology，2009，149(1)：354-369.
［18］Hu L，Liu S. Genome-wide analysis of the MADS-box gene family in cucumber［J］. Genome，2012，55(3)：245-256.
［19］Fan C M，Wang X，Wang Y W，et al. Genome-wide expression analysis of soybean MADS genes showing potential function in the seed development［J］. PLoS One，2013，8(4)：e62288.
［20］Xu Z，Zhang Q，Sun L，et al. Genome-wide identification，characterisation and expression analysis of the MADS-box gene family in Prunus mume［J］. Molecular Genetics and Genomics，2014，289(5)：903-920.
［21］Duan W K，Song X M，Liu T K，et al. Genome-wide analysis of the MADS-box gene family in Brassica rapa(Chinese cabbage)［J］.Molecular Genetics and Genomics，2014，290(1)：239-255.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2014－12－22
基金项目：中国教育学会学校文化研究分会“十二五”教育科研课题(编号：0613278A)。
作者简介：马明臻(1979—)，女，山东寿光人，硕士，副教授，主要从事园艺植物栽培研究。E-mail：1538543122@qq.com。
更新日期/Last Update: 2015-11-25