[1]陶丽婷,杨世鹏,王丽慧,等.辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系的建立及优化[J].江苏农业科学,2017,45(07):80-83.
　Tao Liting,et al.Establishment and optimization of Phytophthora capsici SSR-PCR reaction system[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(07):80-83.
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辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系的建立及优化()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第45卷
期数:
2017年07期
页码:
80-83
栏目:
植物保护
出版日期:
2017-04-20

文章信息/Info

Title:
Establishment and optimization of Phytophthora capsici SSR-PCR reaction system
作者:
陶丽婷;  杨世鹏;  王丽慧;  李屹;  李莉
青海大学农林科学院/青海省蔬菜遗传与生理重点实验室，青海西宁 810016
Author(s):
Tao Liting; et al
关键词:
辣椒疫霉菌; SSR-PCR; 正交设计; 体系优化
Keywords:
-
分类号:
S436.418
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为快速有效地确定辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系，采用正交优化设计方法，对影响辣椒疫霉菌SSR-PCR反应体系的4个主要因素(模板DNA、引物、dNTPs、Taq酶)在4个水平上进行优化。结果表明，不同因素下各水平浓度对SSR-PCR的反应结果均有显著性影响，最佳反应体系(20 μL)为：1.0 ng模板DNA，0.8 μmol/L引物，0.5 μmol/L dNTPs，1.0 U Taq酶。PCR扩增程序为：94 ℃预变性2 min；94 ℃变性15 s，58.4 ℃退火30 s，36个循环，72 ℃延伸 2 min，最佳循环数为36。利用该体系对12份辣椒疫霉菌进行验证，证明该体系稳定可靠，本试验为辣椒疫霉菌遗传多样性分析研究及分子育种奠定了理论基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］郑小波. 疫霉菌及其研究技术［M］. 北京：中国农业出版社，1997.
［2］Kirk P M，Cannon P F，Minter D W，et al. Ainsworth & bisby’s dictionary of the fungi［M］. 10th ed. Wallingford：CAB International，2008.
［3］梁玉琴，李芳东，傅建敏，等. 正交设计优化柿属植物SSR-PCR反应体系［J］. 经济林研究，2011，29(4)：17-22.
［4］谢晶晶，姜华，毛雪琴，等. 利用SSR技术研究浙江省稻瘟病菌群体的遗传多样性［J］. 浙江农业学报，2015，27(10)：1781-1788.
［5］郑成木. 植物分子标记原理与方法［M］. 长沙：湖南科学技术出版社，2003.
［6］Litt M，Luty J A. A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the cardiac muscle actin gene［J］. American Journal of Human Genetics，1989，44(3)：397-401.
［7］Wu K S，Tanksley S D. Abundance，polymorphism and genetic mapping of microsatellites in rice［J］. Molecular Genetics and Genomics，1993，241(1)：225-235.
［8］蔺宇，朱振东，王晓鸣，等. 大豆疫霉菌鉴定和检测的特异性SSR标记建立［C］//中国植物病理学会. 中国植物病理学会2006年学术年会论文集. 北京：中国农业科学技术出版社，2006.
［9］孙文秀，张修国，贾永健，等. 不同地区辣椒疫霉菌遗传多样性的RAPD分析［J］. 植物病理学报，2005，35(4)：340-344.
［10］姚国胜，王俊山，杨英茹，等. 河北省和黑龙江省马铃薯晚疫病菌SSR基因型分析［J］. 科技导报，2008，26(5)：35-39.
［11］申洁，侯思宇，孙朝霞，等. 正交优化枣树ISSR-PCR反应体系的研究［J］. 华北农学报，2010，25(2)：116-120.
［12］李亚利，陈书霞，孟焕文，等. 利用正交设计优化黄瓜的SSR-PCR反应体系［J］. 西北农业学报，2008，17(3)：280-284.
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［15］苏辉，李志刚，宋书宏. 正交设计优化大豆SSR-PCR反应体系及引物筛选［J］. 华北农学报，2009，24(2)：99-102.
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［19］龙萄，黄春琼，刘国道. 正交设计优化狗牙根SSR-PCR反应体系［J］. 基因组学与应用生物学，2016，35(1)：198-205.
［20］张卿哲，孟金贵，张应华，等. 用正交设计法优化辣椒ISSR-PCR反应体系［J］. 西南农业学报，2011，24(3)：1034-1038.

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2016-06-24
基金项目：青海省科技厅基础研究项目(编号：2014-ZJ-735)。
作者简介：陶丽婷(1992—)，女，青海海东人，硕士研究生，研究方向为作物遗传育种。E-mail：547145694@qq.com。
通信作者：李莉，研究员，硕士生导师，现主要从事蔬菜遗传育种及栽培生理等研究工作。Tel：(0971)5311182；E-mail：yyslili@163.com。
更新日期/Last Update: 2017-04-05