改良CTAB方法提取果树不同组织的RNA-《江苏农业科学》

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Title:: Improved CTAB method for extracting RNA from different tissues of fruit trees

作者:: 关玲¹; 赵密珍¹; 王庆莲¹; 吴伟民¹; 钱亚明¹; 巫建华²; 1.江苏省农业科学院果树研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室，江苏南京 210014；
2.江苏现代园艺工程技术中心，江苏句容 212400

Author(s):: Guan Ling; et al

关键词:: 果树; CTAB; RNA提取; 荧光定量RT-PCR

Keywords:: -

分类号:: S601；S188

DOI:: -

文献标志码:: A

摘要:: 果树多富含多酚、多糖等次生代谢物质。为了解决果树RNA提取工作较为困难的现象，拟改良现有的十六烷基三甲基溴化铵(hexadecyl trimethyl ammonium bromide，简称CTAB)方法，以将其用于提取多年生草本、藤本及木本果树RNA。经非变性琼脂糖凝胶电泳检测，表明应用该方法可以获得清晰明亮的RNA条带；经核酸分析发现，所提取的RNA的D_{260 nm}/D_{280 nm}值均在1.80～1.93之间，表明该方法可以去除果树中的蛋白质；D_{260 nm}/D_{230 nm}值为2.03～2.27，表明该方法可以去除果树中的多糖及小分子盐离子。结果表明，应用改良后的CTBA方法提取果树不同组织RNA所得到的反转录cDNA可以直接用于后续的逆转录PCR(RT-PCR)试验。

Abstract:: -

参考文献/References:

［1］Qiang X U，Liu C Y，Biswas M K，et al. Recent advances in fruit crop genomics［J］. Frontiers of Agricultural Science and Engineering，2014，1(1)：21-27.
［2］乔鑫，李梦，殷豪，等. 果树全基因组测序研究进展［J］. 园艺学报，2014，41(1)：165-177.
［3］王云生，聂飞，林顺权. 果树高通量测序的最新研究进展［J］. 基因组学与应用生物学，2015，34(9)：2034-2043.
［4］田鹏，苏艳丽，康保珊，等. 两个红梨品种花色苷合成相关基因及转录因子MYB10表达模式分析［J］. 江苏农业学报，2015，31(1)：166-171.
［5］王西成，吴伟民，巫建华，等. 葡萄β-1，3-葡聚糖酶基因的克隆、序列分析及表达［J］. 江苏农业学报，2015，31(4)：899-905.
［6］许园园，李晓刚，李慧，等. 梨CDPK基因家族全基因组序列鉴定分析［J］. 江苏农业学报，2015，31(3)：659-666.
［7］Gudenschwager O，González-Agüero M，Defilippi B G. A general method for high-quality RNA isolation from metabolite-rich fruits［J］. South African Journal of Botany，2012，83(4)：186-192.
［8］Couto D，Stransfeld L，Arruabarrena A，et al. Broad application of a simple and affordable protocol for isolating plant RNA［J］. BMC Research Notes，2015，8(1)：154.
［9］Eldh M，Ltvall J，Malmhll C，et al. Importance of RNA isolation methods for analysis of exosomal RNA：evaluation of different methods［J］. Molecular Immunology，2012，50(4)：278-286.
［10］Lacroix C，Renner K，Cole E，et al. Methodological guidelines for accurate detection of viruses in wild plant species［J］. Applied and Environmental Microbiology，2016，82(6)：1966-1975.
［11］王颖芳，陈艳琳，王文娟. 适用于转录组测序的人参根总RNA提取方法的筛选［J］. 广东药科大学学报，2017，33(1)：18-22.
［12］Hu C G，Honda C，Kita M，et al. A simple protocol for RNA isolation from fruit trees containing high levels of polysaccharides and polyphenol compounds［J］. Plant Molecular Biology Reporter，2012，20(1)：69.
［13］赵密珍，庞夫花，袁华招，等. 不同栽培条件下草莓品种宁玉花序分化进程［J］. 江苏农业学报，2016，32(1)：196-200.
［14］李晓颖，曹雪，房经贵，等. 杏叶片与果实总RNA提取方法研究［J］. 中国农学通报，2010，26(2)：152-156.
［15］曹建斌. RNA的提取及3种RNA提取试剂盒的比较［J］. 科技情报开发与经济，2008，18(10)：206-207.

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[1]李子艺,王振锡,岳俊,等.基于BP神经网络的高光谱果树树种识别研究[J].江苏农业科学,2016,44(05):410.
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[7]郝紫微,吴潇,刘哲,等.果树器官脱落的研究进展[J].江苏农业科学,2020,48(16):58.
　Hao Ziwei,et al.Research progress on organ abscission of fruit trees[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(15):58.
[8]徐汇,徐元元,李光辉.基于探地雷达的果树根系检测试验与分析[J].江苏农业科学,2022,50(2):170.
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[9]王增磊,宋健,赵俊芳,等.果树农药残留消解特性与数学模型研究进展[J].江苏农业科学,2023,51(2):28.
　Wang Zenglei,et al.Research progress on degradation characteristics and mathematical models of pesticide residues in fruit trees[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(15):28.
[10]王中华,杨青松,李慧,等.氨基酸的生理作用及含氨基酸水溶肥料在果树上的应用策略[J].江苏农业科学,2024,52(3):21.
　Wang Zhonghua,et al.Physiological effects of amino acids and application strategies of water-soluble fertilizers containing amino-acid in fruit trees[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2024,52(15):21.

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

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