|本期目录/Table of Contents|

[1]孔杰,周洲,刘伟,等.达氏鳇亲鱼群体mtDNA Cyt b基因和D-loop区的序列特征及遗传多样性分析[J].江苏农业科学,2019,47(03):40-42.
　Kong Jie,et al.Analysis of sequence feature and genetic diversity of mtDNA Cyt b gene and D-loop in reserved parent fish broodstocks ofHuso dauricus[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(03):40-42.
点击复制

达氏鳇亲鱼群体mtDNA Cyt b基因和D-loop区
的序列特征及遗传多样性分析(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第47卷
期数:
2019年第03期
页码:
40-42
栏目:
生物技术
出版日期:
2019-02-02

文章信息/Info

Title:
Analysis of sequence feature and genetic diversity of mtDNA Cyt b gene and D-loop in reserved parent fish broodstocks ofHuso dauricus
作者:
孔杰;  周洲;  刘伟;  赵凤;  王金乐
贵州省农业科学院水产研究所，贵州贵阳 550025
Author(s):
Kong Jie; et al
关键词:
达氏鳇; mtDNA; D-loop; Cyt b; 遗传多样性
Keywords:
-
分类号:
S917.4
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
通过对线粒体细胞色素b(Cyt b)基因和控制区(D-loop)进行序列特征和遗传多样性检测，分析达氏鳇(Huso dauricus)亲鱼群体30个个体的序列特征及遗传多样性。结果表明，Cyt b基因长1 138 bp，G+C含量为4703%，共定义单倍型5个、多态性位点(S)2个，简约信息位点1个，单倍型多样性指数(Hd)为0.372，平均核苷酸差异数(K)为0.384，核苷酸多样性指数(π)为 0.000 34；D-loop区序列全长845 bp，G+C含量为37.41%，共定义单倍型6个，多态性位点8个，简约信息位点3个，单倍型多样性指数为0.424，平均核苷酸差异数为1.069，核苷酸多样性指数为0.001 27。基于线粒体D-loop与Cyt b序列的研究结果表明，养殖达氏鳇亲鱼群体的遗传多样性偏低，在利用达氏鳇亲鱼进行繁殖育苗时要注意近交的影响。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］郭向贺. 五种鲟鳇鱼种质鉴定及遗传多样性分析［D］. 保定：河北农业大学，2014：73.
［2］胡佳，汪登强，危起伟，等. 施氏鲟、达氏鳇及其杂交子代的分子鉴定［J］. 中国水产科学，2010，17(1)：21-30.
［3］苏胜彦，董在杰，朱文彬. 4个线粒体基因在鲤所属国家种质鉴定中的应用及效果评价［J］. 扬州大学学报(农业与生命科学版)，2017，38(1)：45-51.
［4］向燕，孔杰，周洲，等. 鲟鱼养殖亲鱼群体遗传多样性分析［J］. 西南农业学报，2013，26(5)：2112-2115.
［5］王巍，朱华，胡红霞. 4种鲟鱼养殖亲鱼群体遗传多样性分析［J］. 动物学杂志，2012，47(1)：105-111.
［6］牛翠娟，胡红霞，罗静，等. 史氏鲟和达氏鳇养殖亲鱼群体遗传多样性分析［J］. 水产学报，2010，34(12)：1795-1799.
［7］董新培，武小斌，万海付，等. 河北3个日本沼虾野生群体线粒体DNA D-Loop基因序列变异及种群遗传结构分析［J］. 水产学报，2017，41(2)：182-188.
［8］杨频，张浩，陈立侨，等. 利用COⅠ基因序列分析长江与澜沧江水系日本沼虾群体的遗传结构(英文)［J］. 动物学研究，2007，28(2)：113-118.
［9］张争世，胡冰洁，叶祥益，等. 基于mtDNA Cyt b序列分析齐口裂腹鱼群体遗传多样性［J］. 水生生物学报，2017，41(3)：609-616.
［10］孟玮，郭焱，海萨，等. 塔里木裂腹鱼群体遗传结构及遗传多样性分析［J］. 水生生物学报，2012，36(5)：851-857.
［11］黄志坚，徐晓鹏，唐晶晶，等. 淡水鱼类线粒体DNA D-loop基因的引物设计和应用［J］. 中山大学学报(自然科学版)，2009，48(4)：84-88.
［12］杨慧荣，赵会宏，蒙子宁，等. 赤眼鳟线粒体D-loop和Cyt b基因序列的对比分析［J］. 中山大学学报(自然科学版)，2012，51(5)：100-106，136.
［13］马亚，岳志芹，赵玉然，等. 松江鲈鱼Cyt b基因序列分析及种质鉴定［J］. 生物技术通报，2012(8)：119-124.
［14］黄原. 分子系统学——原理，方法及应用［M］. 北京：中国农业出版社，1998：65.
［15］Folmer O，Black M，Hoeh W，et al. DNA primers for amplification of mitochondrial cytochrome c oxidase subunit Ⅰ from diverse metazoan invertebrates［J］. Molecular Marine Biology and Biotechnology，1994，3(5)：294-299.
［16］刘伟，代应贵，袁振兴，等. 都柳江粗唇种群线粒体DNA Cyt b基因和D-loop序列组成及遗传多样性［J］. 淡水渔业，2016，46(3)：10-15，51.
［17］胡玉婷，胡王，凌俊，等. 滁州鲫线粒体细胞色素b基因和控制区序列比较及其系统进化分析［J］. 南方水产科学，2015，11(2)：101-108.
［18］李娜，陈少波，谢起浪，等. 闽浙地区香鱼线粒体Cyt b基因和D-loop区序列多态性分析［J］. 遗传，2008，30(7)：919-925.
［19］吴静，张研，霍堂斌，等. 利用线粒体序列分析黑龙江和松花江流域乌苏里拟鲿种群遗传结构［J］. 淡水渔业，2013，43(2)：16-20.
［20］张久盘. 基于mtDNA Cyt b基因和D-loop祁连山裸鲤遗传多样性及分类地位分析［D］. 兰州：甘肃农业大学，2015：43.
［21］Knight A，Mindell D P. Substitution bias，weighting of DNA sequence evolution，and the phylogenetic position of Feas viper［J］. Systematic Biology，1993，42(1)：18-31.
［22］Zhou H，Li D，Zhang Y，et al. Study on mitochondrial DNA genetic diversity of Tibetan antelope［J］. Hereditas，2006，28(3)：299-305.

相似文献/References:

[1]邹芝英,杨弘,罗永巨,等.长鳍鲤mtDNA D-loop区序列结构和多态性分析[J].江苏农业科学,2013,41(08):27.
　Zou Zhiying,et al.Sequence structure and polymorphism analysis of long-fin carp mtDNA D-loop region[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(03):27.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2017-11-07
基金项目：贵州省科研机构服务企业行动计划(编号：黔科合平台人才［2016］5714)；贵州省科技计划(编号：黔科合支撑［2016］2584)；现代农业产业技术体系专项资金(编号：CARS-46)。
作者简介：孔杰(1986—)，女，贵州贵阳人，硕士，助理研究员，主要从事水产生物技术相关研究。E-mail：kellykj@126.com
更新日期/Last Update: 2019-02-05