[1]崔向华,隗正阳,杜振伟,等.芝麻产量相关性状全基因组关联分析[J].江苏农业科学,2023,51(21):106-113.
　Cui Xianghua,et al.Genome-wide association study on yield-related traits of sesame (Sesamum indicum L.)[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(21):106-113.
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芝麻产量相关性状全基因组关联分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第51卷
期数:
2023年第21期
页码:
106-113
栏目:
遗传育种与耕作栽培
出版日期:
2023-11-05

文章信息/Info

Title:
Genome-wide association study on yield-related traits of sesame (Sesamum indicum L.)
作者:
崔向华1; 隗正阳1; 杜振伟2; 周霞丽1; 刘焱3; 石明权1; 阚跃峰1; 张少泽1; 崔承齐2; 梅鸿献2
1.驻马店市农业科学院，河南驻马店 463000； 2.河南省农业科学院芝麻研究中心，河南郑州 450008；3.南阳市农业科学院，河南南阳 473085
Author(s):
Cui Xianghua; et al
关键词:
芝麻; 产量性状; 全基因组关联分析; SNP标记; 功能注释基因; 广义遗传力; 候选基因预测
Keywords:
-
分类号:
S565.303.2
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
以294份遗传多样性丰富的芝麻种质资源为试验材料，于2014年调查驻马店市、商丘市、南阳市3个地点的株高、始蒴高度、单株蒴数、蒴粒数、千粒质量、单株产量等6个产量相关性状，结合33 027个SNP标记，使用混合线性模型进行全基因组关联分析，对重复检测到的显著SNP位点两侧99 kb区域内挖掘所有功能注释基因，根据注释信息找寻与目标性状相关的基因，并进行功能富集分析。结果表明，6个性状存在广泛变异，3个环境下变异系数表现为单株产量和单株蒴数>始蒴高度>蒴粒数>千粒质量>株高。6个性状均呈现正态分布，广义遗传力为44.07%~85.49%。经关联分析共检测到171个显著关联位点，表型变异解释率为5.46%~11.56%。在驻马店和商丘共同检测到6个与蒴粒数显著关联的位点，在其侧翼各99 kb区域内共挖掘到118个功能注释基因，其中SIN_1012613基因与拟南芥CKI1(AT2G47430)是同源基因，该基因可能通过调控雌配子的发育来决定芝麻蒴粒数。本研究结果有助于解析芝麻产量相关性状的遗传机制，为芝麻产量的遗传改良奠定理论基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2023-04-11
基金项目：国家特色油料产业技术体系建设专项(编号：CARS-14-1-01、CARS-14-2-16)；河南省重大科技专项(编号：201300110600)；河南省中央引导地方科技发展资金 (编号：Z20221343038)；河南省农业科学院科技创新团队项目(编号：2023TD31)；河南省农业科学院基础性科研工作项目(编号：2023JC13)。
作者简介：崔向华(1973—)，男，河南驻马店人，副研究员，从事芝麻遗传育种及高产栽培技术研究。E-mail
更新日期/Last Update: 2023-11-05