|本期目录/Table of Contents|

[1]李家艳,丁瑜,安怡珂,等.德阳柿SPL基因家族鉴定及在成花调控中的功能分析[J].江苏农业科学,2024,52(16):69-79.
　Li Jiayan,et al.Identification of SPL gene family in Diospyros deyangnsis and its functional analysis in regulation of flowering[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2024,52(16):69-79.
点击复制

德阳柿SPL基因家族鉴定及在成花调控中的功能分析(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第52卷
期数:
2024年第16期
页码:
69-79
栏目:
生物技术
出版日期:
2024-08-20

文章信息/Info

Title:
Identification of SPL gene family in Diospyros deyangnsis and its functional analysis in regulation of flowering
作者:
李家艳; 丁瑜; 安怡珂; 万建琦; 杨勇; 关长飞
西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌 712100
Author(s):
Li Jiayan; et al
关键词:
德阳柿; SPL基因家族; 成花调控; 基因鉴定; 共线性分析
Keywords:
-
分类号:
S665.201
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
SPL是植物中重要的转录因子，调控植物从幼年期向成年期转变，为探究DdSPL基因在德阳柿成花调控中的作用，为德阳柿实生苗的早花现象提供依据。本研究采用生物信息学方法对德阳柿SPL基因家族成员进行鉴定，并对其基本理化性质、系统进化关系、保守结构域、基因结构、共线性进行分析；通过融合蛋白瞬时表达鉴定亚细胞定位情况；利用qRT-PCR技术检测其在不同成花时期不同部位［茎、叶、顶芽(花)］的表达情况。结果表明，德阳柿中共鉴定得到38条DdSPL基因序列，通过聚类分析可分为8个亚族，同一聚类的蛋白具有相似的氨基酸结构(2个锌指结构ZN-1、ZN-2和1个核定位信号)和基因结构；保守基序分析发现，所有的DdSPL蛋白均含有SBP结构域。共线性分析结果显示，德阳柿38个SPL基因家族成员中存在49对直系同源基因对。亚细胞定位显示，DdSPL8、DdSPL13、DdSPL18均定位在细胞核中；DdSPL7、DdSPL13、DdSPL18这3个基因的表达模式相似，在幼苗期和现蕾期的茎、叶、顶芽(花)中表达量相对较少，在开花期的叶片中表达量明显提高，可能参与德阳柿成花调控。综上，本研究首次从德阳柿基因组中鉴定出38个SPL家族成员，序列高度保守，且均含有SBP结构域，DdSPL7、DdSPL13、DdSPL18在开花期叶片中高表达，可能参与德阳柿成花调控。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］Wu G，Park M Y，Conway S R，et al. The sequential action of miR156 and miR172 regulates developmental timing in Arabidopsis［J］. Cell，2009，138(4)：750-759.
［2］Klein J，Saedler H，Huijser P. A new family of DNA binding proteins includes putative transcriptional regulators of the Antirrhinum majus floral meristem identity gene SQUAMOSA［J］. Molecular & General Genetics，1996，250(1)：7-16.
［3］Yamasaki K，Kigawa T，Inoue M，et al. A novel zinc-binding motif revealed by solution structures of DNA-binding domains of Arabidopsis SBP-family transcription factors［J］. Journal of Molecular Biology，2004，337(1)：49-63.
［4］Cardon G H，Hhmann S，Nettesheim K，et al. Functional analysis of the Arabidopsis thaliana SBP-box gene SPL3：a novel gene involved in the floral transition［J］. The Plant Journal：for Cell and Molecular Biology，1997，12(2)：367-377.
［5］Preston J C，Hileman L C. Functional evolution in the plant squamosa-promoter binding protein-like (spl)gene family［J］. Frontiers in Plant Science，2013，4：80.
［6］Xie K B，Wu C Q，Xiong L Z. Genomic organization，differential expression，and interaction of SQUAMOSA promoter-binding-like transcription factors and microRNA156 in rice［J］. Plant Physiology，2006，142(1)：280-293.
［7］Salinas M，Xing S P，Hhmann S，et al. Genomic organization，phylogenetic comparison and differential expression of the SBP-box family of transcription factors in tomato［J］. Planta，2012，235(6)：1171-1184.
［8］Li J，Hou H M，Li X Q，et al. Genome-wide identification and analysis of the SBP-box family genes in apple (Malus×domestica Borkh.)［J］. Plant Physiology and Biochemistry，2013，70：100-114.
［9］Zhu T，Liu Y，Ma L T，et al. Genome-wide identification，phylogeny and expression analysis of the SPL gene family in wheat［J］. BMC Plant Biology，2020，20(1)：420.
［10］Xing S P，Salinas M，Hhmann S，et al. MiR156-targeted and nontargeted SBP-box transcription factors act in concert to secure male fertility in Arabidopsis［J］. The Plant Cell，2010，22(12)：3935-3950.
［11］Wu G，Poethig R S. Temporal regulation of shoot development in Arabidopsis thaliana by miR156 and its target SPL3［J］. Development，2006，133(18)：3539-3547.
［12］Schwarz S，Grande A V，Bujdoso N，et al. The micro RNA regulated SBP-box genes SPL9 and SPL15 control shoot maturation in Arabidopsis［J］. Plant Molecular Biology，2008，67(1/2)：183-195.
［13］Fan S，Zhang D，Gao C，et al. Mediation of flower induction by gibberellin and its inhibitor paclobutrazol：mRNA and miRNA integration comprises complex regulatory cross-talk in apple［J］. Plant & Cell Physiology，2018，59(11)：2288-2307.
［14］Shalom L，Shlizerman L，Zur N，et al. Molecular characterization of squamosa promoter binding protein-like (spl)gene family from Citrus and the effect of fruit load on their expression［J］. Frontiers in Plant Science，2015，6：389.
［15］Zhao M N，Liu R X，Chen Y，et al. Molecular identification and functional verification of SPL9 and SPL15 of Lilium［J］. Molecular Genetics and Genomics，2022，297(1)：63-74.
［16］李文清，杨勇，解孝满，等. E3泛素-蛋白连接酶UPL3 DNA序列揭示德阳柿和油柿为栽培柿的最近缘物种［J］. 农业科学，2018，8(6)：657-673.
［17］李宁宁. ‘南通小方柿’组培快繁及叶片再生体系的建立［D］. 南京：南京农业大学，2014.
［18］罗正荣，蔡礼鸿，胡春根. 柿属植物种质资源及其利用研究现状［J］. 华中农业大学学报，1996，15(4)：381-388.
［19］Tamura K，Peterson D，Peterson N，et al. MEGA 5：molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood，evolutionary distance，and maximum parsimony methods［J］. Molecular Biology and Evolution，2011，28(10)：2731-2739.
［20］杨杰，陈蓉，胡文娟，等. 甜橙SPL基因家族的鉴定及其在成花诱导中的表达分析［J］. 西北植物学报，2022，42(1)：48-56.
［21］Feng X，Zhou B J，Wu X L，et al. Molecular characterization of SPL gene family during flower morphogenesis and regulation in blueberry［J］. BMC Plant Biology，2023，23(1)：40.
［22］He B Y，Gao S Z，Lu H，et al. Genome-wide analysis and molecular dissection of the SPL gene family in Fraxinus mandshurica［J］. BMC Plant Biology，2022，22(1)：451.
［23］王春昱，范付华. 马尾松SPL基因家族鉴定及其响应低磷胁迫的表达分析［J］. 农业生物技术学报，2023，31(3)：509-517.
［24］宋梦瑶，赵乐，董诚明，等. 红花SPL基因家族全基因组鉴定及表达分析［J］. 江苏农业科学，2022，50(19)：36-43.
［25］Wang J W，Czech B，Weigel D. MiR156-regulated SPL transcription factors define an endogenous flowering pathway in Arabidopsis thaliana［J］. Cell，2009，138(4)：738-749.
［26］Yu N，Yang J C，Yin G T，et al. Genome-wide characterization of the SPL gene family involved in the age development of Jatropha curcas［J］. BMC Genomics，2020，21(1)：368.
［27］Feng G Y，Han J T，Yang Z F，et al. Genome-wide identification，phylogenetic analysis，and expression analysis of the SPL gene family in orchardgrass (Dactylis glomerata L.)［J］. Genomics，2021，113(4)：2413-2425.
［28］Schwab R，Palatnik J F，Riester M，et al. Specific effects of microRNAs on the plant transcriptome［J］. Developmental Cell，2005，8(4)：517-527.
［29］Yamaguchi A，Wu M F，Yang L，et al. The microRNA-regulated SBP-Box transcription factor SPL3 is a direct upstream activator of LEAFY，FRUITFULL，and APETALA1［J］. Developmental Cell，2009，17(2)：268-278.
［30］Usami T，Horiguchi G，Yano S，et al. The more and smaller cells mutants of Arabidopsis thaliana identify novel roles for squamosa promoter binding protein-like genes in the control of heteroblasty［J］. Development，2009，136(6)：955-964.
［31］Zheng J，Ma Y，Zhang M，et al. Expression pattern of FT/TFL1 and miR156-Targeted SPL genes associated with developmental stages in Dendrobium catenatum［J］. International Journal of Molecular Sciences，2019，20(11)：2725.
［32］牛明月. 光皮桦成花相关SPL基因的克隆、表达及功能分析［D］. 杭州：浙江农林大学，2015.

相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2023-09-09
基金项目：国家重点研发计划(编号：2022YFD2200400)。
作者简介：李家艳(1999—)，女，河南新乡人，硕士研究生，主要研究方向为分子生物学。E-mail：lijiayan182@163.com。
通信作者：关长飞，博士，硕士生导师，主要从事柿种质资源收集保存、鉴定评价研究。E-mail：guanchangfei@nwafu.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2024-08-20