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[1]张悦,施唯,李丹,等.灰葡萄孢基因中微卫星序列分析[J].江苏农业科学,2013,41(04):44-46.
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灰葡萄孢基因中微卫星序列分析
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第41卷
期数:
2013年04期
页码:
44-46
栏目:
生物技术
出版日期:
2013-04-30

文章信息/Info

Title:
-
作者:
张悦1; 施唯2; 李丹3; 路沁1; 陈子牛1
1.昆明学院生命科学与技术系，云南昆明 650214； 2.个旧市农民科技教育培训中心，云南个旧 661000； 3.云南交通技师学院，云南昆明 650300
Author(s):
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关键词:
灰葡萄孢; 微卫星序列; 基因组; 生物信息学
Keywords:
-
分类号:
Q781
DOI:
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文献标志码:
-
摘要:
微卫星(SSR)一般是指由单、双、三、四、五和六核苷酸重复单元串联排列的简单重复序列，它广泛分布于生物基因组内，在不同生物中，微卫星DNA的数目、类型及其分布情况存在很大的差异。本研究主要统计了已公布的灰葡萄孢基因序列中的SSR数量及类型，在灰葡萄孢的564个预测基因区域中发现669个微卫星序列，其中大多数基因(477个基因)只含有1 个碱基SSR，占含SSR基因总数的71.3%；72个基因含有2个碱基SSR，13个基因含有3 个碱基SSR，含4个和5个碱基SSR的基因则各只有1个。所有SSR序列中，出现数量最多的为3个碱基和6个碱基的SSR序列，分别达到了135次和330次，1个碱基、2个碱基、4个碱基和5个碱基的SSR则分别出现了7、41、64和92次。SSR碱基数越多，重复的次数越少，重复次数最少的SSR是6个碱基的AGAGGG重复。重复次数最高的SSR为122次，是3个碱基的AAT重复，这表明，在选择压力下，SSR趋向于密码子的整数倍，这与其他物种的分析结果一致。发现大多数含有SSR的基因并没有明确的功能描述，这可能是由于这些基因受到SSR的影响而在进化上变化较快所致。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

[1]张 悦,李 丹,陈子牛,等.不同环境因素对昆明本地灰葡萄孢、 黄曲霉菌株生长的影响[J].江苏农业科学,2015,43(07):118.
　Zhang Yue,et al.Effects of environment factors on growth of Botrytis cinerea and Aspergillus flavus strains in Kunming area[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(04):118.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2012-10-21 基金项目：云南省应用基础研究计划(青年项目)(编号：2012FD046)；云南省教育厅科学研究基金一般项目(编号：2011Y234)。 作者简介：张悦(1981—)，男，博士，副教授，研究方向为植物病理学。E-mail：www151519190@163.com。
更新日期/Last Update: 1900-01-01