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[1]符亚茹,李少珂,姚卫杰,等.西藏砂生槐EST-SSR引物开发及多态性检测[J].江苏农业科学,2015,43(11):78-81.
　Fu Yaru,et al.Development and polymorphism identification of EST-SSR primer in Sophora moorcroftiana[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(11):78-81.
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西藏砂生槐EST-SSR引物开发及多态性检测(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第43卷
期数:
2015年11期
页码:
78-81
栏目:
生物技术
出版日期:
2015-11-25

文章信息/Info

Title:
Development and polymorphism identification of EST-SSR primer in Sophora moorcroftiana
作者:
符亚茹;  李少珂;  姚卫杰;  李慧娥
西藏大学农牧学院，西藏林芝 860000
Author(s):
Fu Yaru; et al
关键词:
砂生槐; 转录本; EST-SSR; 多态性; 引物
Keywords:
-
分类号:
S718.43
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
砂生槐为青藏高原特有灌木种，具有重要生态价值。开发多态EST-SSR 引物对其居群遗传多样性研究及保护策略的制定具有重要意义。利用SciRoKo v3.4软件对前期获得的砂生槐转录组中146 943个转录本进行扫描共发现9 428个SSR位点。转录本中的微卫星种类十分丰富，其中以三核苷酸和五核苷酸重复最多，分别占SSR总位点数的33.32%和21.70%，重复次数主要集中在3~9次重复。其中(AG/CT)n、(GA/TC)n、(GAA/TTC)n、(AAAAT/ATTTT)n 重复基序最多，占总重复基序的4.50%、 4.34%、 3.13%和2.44%。本研究中设计130对EST-SSR引物，有80对扩增出预期大小条带，经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测，最终有11对具有较高多态性，且对于30个模板得到的位点平均等位基因数为2.9；观测杂合度(HO)和期望杂合度(HE)平均值分别为0.423 9和0.336 4。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2014-12-19
基金项目：国家自然科学基金(编号：31260189)；西藏特色农牧资源研发协同创新中心建设——高原生态。
作者简介：符亚茹(1988—)，女，陕西西安人，硕士研究生，主要从事高原植物分子生态研究。E-mail： fuyaruxw@126. com。
通信作者：李慧娥，博士，副教授，主要从事高原植物分子生物学研究。E-mail： lihuiesh@126.com。
更新日期/Last Update: 2015-11-25