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[1]戴宝玲,肖英平,戴贤君,等.基于Illumina高通量测序技术分析草莓表面微生物结构[J].江苏农业科学,2018,46(20):25-28.
　Dai Baoling,et al.Analysis of surface microbial flora structure of strawberry based on Illumina high-throughput sequencing technology[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2018,46(20):25-28.
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基于Illumina高通量测序技术分析
草莓表面微生物结构(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第46卷
期数:
2018年第20期
页码:
25-28
栏目:
生物技术
出版日期:
2018-10-20

文章信息/Info

Title:
Analysis of surface microbial flora structure of strawberry based on Illumina high-throughput sequencing technology
作者:
戴宝玲1; 2;  肖英平2; 3;  戴贤君1;  何祥祥2;  王佩佩2;  杨华2; 3
1.中国计量大学生命科学学院，浙江杭州 310018； 2.浙江省农业科学院农产品质量标准研究所，浙江杭州 310021；
3.浙江省植物有害生物防控省部共建国家重点实验室培育基地，浙江杭州 310021
Author(s):
Dai Baoling; et al
关键词:
草莓; 菌群结构; 高通量测序; 病原菌; 微生物检测
Keywords:
-
分类号:
S668.401；S182
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为了解不同基地草莓表面微生物的结构特点，在浙江省8个草莓生产基地采集草莓样本，并提取表面微生物DNA样本，利用特异性的引物分别对细菌16S rRNA基因的V3~V4区进行PCR扩增，然后基于Illumina高通量测序技术分析不同基地草莓微生物的菌群结构。结果表明，不同基地草莓表面微生物在门的水平上主要包括变形菌门、厚壁菌门、蓝藻细菌门、放线菌门、拟杆菌门；在属的水平上，优势菌属主要为布赫纳氏菌属、甲基杆菌属和葡糖杆菌属，其中所检出的寡养单胞菌属、苯基杆菌属、埃希杆菌属和葡萄球菌属均具有一定的致病性。由此说明高通量测序技术应用于草莓表面微生物的分析，可在一定程度上提供草莓污染的病原菌信息。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2017-05-26
基金项目：浙江省植物有害生物防控重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地项目(编号：2010DS700124-ZM1608)。
作者简介：戴宝玲(1992—)，女，河南信阳人，硕士，研究方向为食品微生物。E-mail：bldaihz123@126.com。
通信作者：杨华，硕士，研究方向为农产品质量安全。E-mail：yanghua806@hotmail.com。
更新日期/Last Update: 2018-10-20