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[1]魏磊,常霞,全彦涛,等.五加科植物鲨烯合酶核苷酸及其编码氨基酸序列的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2019,47(12):57-62.
　Wei Lei,et al.Bioinformatics analysis of squalene synthase coding gene and amino acid sequence in Araliaceae[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(12):57-62.
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五加科植物鲨烯合酶核苷酸及其编码氨基酸
序列的生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第47卷
期数:
2019年第12期
页码:
57-62
栏目:
生物技术
出版日期:
2019-07-10

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of squalene synthase coding gene and amino acid sequence in Araliaceae
作者:
魏磊;  常霞;  全彦涛;  陈飞;  景炳年;  崔炜;  朱杰;  王伟
河南省生物技术开发中心/河南省植物天然产物开发工程技术研究中心，河南郑州 450002
Author(s):
Wei Lei; et al
关键词:
五加科; 生物信息学; 鲨烯合酶; 三萜生物合成
Keywords:
-
分类号:
S188
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
鲨烯合酶(squalene synthase，EC2.5.1.21，简称SQS)是三萜类化合物生物合成通路的关键酶之一。采用生物信息学方法对13种五加科植物的SQS核苷酸及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、磷酸化位点、亲/疏水性、信号肽、导肽、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、功能域、三级结构及进化关系进行初步预测和分析，并构建SQS蛋白家族的系统进化树。结果表明，13种五加科植物的SQS氨基酸序列结构与理化性质基本一致，均表现出亲水性，没有信号肽，具有跨膜结构域；亚细胞定位分析显示，除Panax sokpayensis定位于内质网膜上，其余均定位于质膜上。α螺旋和无规则卷曲为SQS二级结构中最主要的结构元件，保守区包括底物结合区、镁离子结合位点、活性位点残基盖、催化残基和2个天冬氨酸富集区，具有典型的多聚异戊二烯基合成酶活性结构域和鲨烯/八氢番茄红素合成酶活性结构域。分析结果可为SQS的酶学特性及三萜类化合物生物合成的分子机制研究提供理论基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2018-02-08
基金项目：河南省科技攻关项目(编号：172102310345、182102310061)。
作者简介：魏磊(1986—)，男，河南新乡人，博士，助理研究员，主要从事植物分子生物学研究。E-mail：yhweilei2@163.com。
通信作者：王伟，博士，助理研究员，主要从事生化与分子生物学研究。Tel：(0371)65353099；E-mail：fangchensci@163.com。
更新日期/Last Update: 2019-06-20