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[1]刘文英,田宏先,王润梅,等.莜麦AnHRGP基因的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2019,47(18):75-78.
　Liu Wenying,et al.Bioinformatics analysis of AnHRGP gene in naked oats[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(18):75-78.
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莜麦AnHRGP基因的生物信息学分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第47卷
期数:
2019年第18期
页码:
75-78
栏目:
生物技术
出版日期:
2019-10-15

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of AnHRGP gene in naked oats
作者:
刘文英1;  田宏先2;  王润梅1;  周凤1;  刘建霞1;  刘丽珍1
1.山西大同大学应用生物技术研究所，山西大同 037009； 2.山西省农业科学院高寒区作物研究所，山西大同 037009
Author(s):
Liu Wenying; et al
关键词:
莜麦; 富含羟基脯氨酸糖蛋白; 生物信息学方法; 基因序列; 氨基酸序列; 微观分析; 立体结构; 基因功能
Keywords:
-
分类号:
S512.601
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
以AnHRGP基因编码的富含羟基脯氨酸糖蛋白(AnHRGP)为研究对象，用生物信息学方法对该蛋白质的一级结构及理化性质、跨膜区、亲疏水性、二级结构及功能位点、三级结构特点等进行分析。应用ExPASy在线分析AnHRGP的氨基酸组成及理化性质，通过SOMPA在线预测AnHRGP的二级结构，应用TMHMM Server v. 2.0对AnHRGP进行跨膜结构分析，采用Phyre2对蛋白质的三级结构进行建模。结果表明，该蛋白基因的开放阅读框(open reading frame，简称ORF)可以编码202个氨基酸，是一种无信号肽、无跨膜结构、无卷曲螺旋结构、定位于叶绿体和线粒体基质空间的不溶性疏水蛋白。无规则卷曲为AnHRGP中成分最多的二级结构。通过Phyre2工具模拟出了该蛋白质的三级结构模型。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2018-06-09
基金项目：山西省基础研究项目(编号：2015021149)；山西省高校科技创新项目(编号：2013142)；山西省大同市农业重点研究项目(编号：2017082)。
作者简介：刘文英(1981—)，女，山西大同人，博士，副教授，主要从事植物分子生物学研究。E-mail：15035246759@163.com。
更新日期/Last Update: 2019-09-20