[1]赵志新,王星星.植物三萜皂苷代谢中达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2019,47(18):86-92.
Zhao Zhixin,et al.Bioinformatics analysis of DS and β-AS in metabolism of triterpenoid saponins in plants[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(18):86-92.
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植物三萜皂苷代谢中达玛烷合成酶和β-香树脂
合成酶的生物信息学分析(PDF)
《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]
- 卷:
-
第47卷
- 期数:
-
2019年第18期
- 页码:
-
86-92
- 栏目:
-
生物技术
- 出版日期:
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2019-10-15
文章信息/Info
- Title:
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Bioinformatics analysis of DS and β-AS in metabolism of triterpenoid saponins in plants
- 作者:
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赵志新1; 王星星2
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1.商洛学院生物医药与食品工程学院,陕西商洛 726000; 2.西藏阿里地区中等职业技术学校,西藏阿里 859000
- Author(s):
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Zhao Zhixin; et al
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- 关键词:
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达玛烷合成酶; β-香树脂合成酶; 生物信息学分析; 三萜皂苷; 理化性质; 蛋白特性; 进化亲缘关系; 糖基化位点; 保守结构域; 酶学特征
- Keywords:
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- 分类号:
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S188
- DOI:
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- 文献标志码:
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A
- 摘要:
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搜集4种植物的10条达玛烷合成酶及22种植物的30条β-香树脂合成酶,利用生物信息学工具对这2种三萜皂苷代谢关键酶的理化性质、蛋白特性及进化亲缘关系等进行分析。理化性质分析显示,这2种酶的氨基酸序列在氨基酸数目、组成、分子量、理论pI和脂肪指数等方面均表现出较强的一致性;同时,这2种酶的糖基化位点具有高度的保守性,并且大豆(2)、绿玉树、木榄这3条β-香树脂合成酶序列有极大的可能性有糖基化位点;信号肽预测分析表明,这2种酶没有明确的信号肽;α-螺旋和无规则卷曲是多肽链中主要存在的二级结构元件;系统进化树显示序列间差异较小,并且聚类结果与序列的科属特性相一致。不同植物的达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶蛋白特性差别不大,进化距离也比较近,说明这2种酶具有较高的保守性和稳定性。这有助于理解达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶的保守结构域及进化变异,为研究这2种酶的酶学特征及三萜皂苷代谢提供帮助。
- Abstract:
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参考文献/References:
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相似文献/References:
备注/Memo
- 备注/Memo:
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收稿日期:2019-01-15
基金项目:国家级大学生创新创业训练计划(编号:201811396018X)。
通信作者:赵志新(1982—),男,河南滑县人,博士,讲师,从事药用植物转录组代谢及基因组进化研究。E-mail:zxzhao@slxy.edu.cn。
更新日期/Last Update:
2019-09-20