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[1]赵志新,王星星.植物三萜皂苷代谢中达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶的生物信息学分析[J].江苏农业科学,2019,47(18):86-92.
 Zhao Zhixin,et al.Bioinformatics analysis of DS and β-AS in metabolism of triterpenoid saponins in plants[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2019,47(18):86-92.
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植物三萜皂苷代谢中达玛烷合成酶和β-香树脂
合成酶的生物信息学分析
(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第47卷
期数:
2019年第18期
页码:
86-92
栏目:
生物技术
出版日期:
2019-10-15

文章信息/Info

Title:
Bioinformatics analysis of DS and β-AS in metabolism of triterpenoid saponins in plants
作者:
赵志新1 王星星2
1.商洛学院生物医药与食品工程学院,陕西商洛 726000; 2.西藏阿里地区中等职业技术学校,西藏阿里 859000
Author(s):
Zhao Zhixinet al
关键词:
达玛烷合成酶β-香树脂合成酶生物信息学分析三萜皂苷理化性质蛋白特性进化亲缘关系糖基化位点保守结构域酶学特征
Keywords:
-
分类号:
S188
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
搜集4种植物的10条达玛烷合成酶及22种植物的30条β-香树脂合成酶,利用生物信息学工具对这2种三萜皂苷代谢关键酶的理化性质、蛋白特性及进化亲缘关系等进行分析。理化性质分析显示,这2种酶的氨基酸序列在氨基酸数目、组成、分子量、理论pI和脂肪指数等方面均表现出较强的一致性;同时,这2种酶的糖基化位点具有高度的保守性,并且大豆(2)、绿玉树、木榄这3条β-香树脂合成酶序列有极大的可能性有糖基化位点;信号肽预测分析表明,这2种酶没有明确的信号肽;α-螺旋和无规则卷曲是多肽链中主要存在的二级结构元件;系统进化树显示序列间差异较小,并且聚类结果与序列的科属特性相一致。不同植物的达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶蛋白特性差别不大,进化距离也比较近,说明这2种酶具有较高的保守性和稳定性。这有助于理解达玛烷合成酶和β-香树脂合成酶的保守结构域及进化变异,为研究这2种酶的酶学特征及三萜皂苷代谢提供帮助。
Abstract:
-

参考文献/References:

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相似文献/References:

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2019-01-15
基金项目:国家级大学生创新创业训练计划(编号:201811396018X)。
通信作者:赵志新(1982—),男,河南滑县人,博士,讲师,从事药用植物转录组代谢及基因组进化研究。E-mail:zxzhao@slxy.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2019-09-20