[1]何培,孙会改,荣正普,等.苍术属植物叶绿体密码子偏好性分析[J].江苏农业科学,2026,54(3):41-49.
 He Pei,et al.Analysis of codon preference in chloroplasts of Atractylodes plants[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2026,54(3):41-49.
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苍术属植物叶绿体密码子偏好性分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第54卷
期数:
2026年第3期
页码:
41-49
栏目:
生物技术
出版日期:
2026-02-05

文章信息/Info

Title:
Analysis of codon preference in chloroplasts of Atractylodes plants
作者:
何培1孙会改2荣正普2郑玉光3韩晓伟2裴林1
1.河北中医药大学第四附属医院,河北石家庄 050031; 2.河北中医药大学,河北石家庄 050200;3.河北化工医药职业技术学院,河北石家庄 050026
Author(s):
He Peiet al
关键词:
苍术属密码子偏性最优密码子突变压力自然选择
Keywords:
-
分类号:
S188;S567.21+1.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为探究苍术属药用植物叶绿体基因组基因密码子使用偏好性,以关苍术、苍术、白术、鄂西苍术叶绿体基因组的52条共有基因序列为材料,利用EMBOSS在线工具和CodonW1.4.2软件,统计各基因的有效密码子数、核苷酸百分比、同义密码子使用频率、密码子总GC含量及密码子3位GC含量(GC1、GC2、GCc3),并通过PR2-plot分析、ENC-plot 分析和中性绘图分析,最终鉴定出最优密码子。结果表明,4种苍术属植物叶绿体基因组密码子偏好以 A/U 结尾。PR2-plot、中性绘图及ENC-plot分析结果显示,苍术属植物叶绿体基因组密码子使用偏好受突变压力与自然选择共同影响;共鉴定出5个最优密码子(UUA、UCU、ACU、GCU、UAA),且最优密码子均以A/U 结尾。本研究揭示了苍术属密码子偏性形成的主要影响因素,为苍术属叶绿体基因组密码子优化、物种进化及遗传育种研究提供了支撑。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2025-04-16
基金项目:国家中医药管理局科技司中药质量保障与创新发展项目(编号:2024002845);中央本级重大增减支项目(编号:2060302-2405-03);河北省省级科技计划(编号:H2024423018、22326418D);河北省现代农业产业技术体系建设专项(编号:HBCT2023080201、HBCT2023080205);河北省中医药管理局科研计划(编号:2023351)。
作者简介:何培(1985—),女,浙江慈溪人,硕士,主管中药师,主要从事中药资源保护与开发研究。E-mail:hepei_85@126.com。
通信作者:韩晓伟,博士,副教授,硕士生导师,主要从事中药资源与开发研究,E-mail:hanxiaowei2015@126.com;裴林,博士,教授,博士生导师,主要从事中药资源保护与开发研究,E-mail:13831190309@163.com。
更新日期/Last Update: 2026-02-05