[1]陶佩琳,凤舞剑,曹丹,等.番茄CNGC家族全基因组鉴定及病菌胁迫响应、通道特征分析[J].江苏农业科学,2026,54(2):56-63.
　Tao Peilin,et al.Genomewide identification of CNGC gene family and analysis of their responses to pathogen stress and channel properties in tomato[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2026,54(2):56-63.
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番茄CNGC家族全基因组鉴定及病菌胁迫响应、通道特征分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第54卷
期数:
2026年第2期
页码:
56-63
栏目:
生物技术
出版日期:
2026-01-20

文章信息/Info

Title:
Genomewide identification of CNGC gene family and analysis of their responses to pathogen stress and channel properties in tomato
作者:
陶佩琳; 凤舞剑; 曹丹; 张莹; 高峰
徐州生物工程职业技术学院/徐州市现代农业生物技术重点实验室，江苏徐州 221006
Author(s):
Tao Peilin; et al
关键词:
环核苷酸门控通道蛋白; 番茄; 基因家族; 钙通道; AlphaFold3
Keywords:
-
分类号:
S188；S641.201
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
环核苷酸门控通道蛋白(CNGC)是植物中典型的钙离子通道，在调控植物生长发育、应对非生物胁迫和生物胁迫的过程中发挥着重要作用。常规的基因家族挖掘无法明确CNGC家族的通道特征，因此，为了鉴定番茄中的CNGC家族蛋白，拟利用人工智能工具隐马尔科夫模型对番茄CNGC家族蛋白进行鉴定，并用ProtParam、WoLF PSORT、MEGA、PlantCARE和AlphaFold3等软件对番茄CNGC家族蛋白的理化性质、基因定位、遗传进化、核心元件和基序及蛋白质通道结构和钙离子结合特征进行分析。结果表明，在番茄基因组中共筛选出25个CNGC成员，可分为4个亚类；鉴定到6个保守基序、15个核心响应元件，参与脱落酸响应、赤霉素响应、水杨酸响应、防御响应、光响应、低温响应等。通过转录组数据筛选到Solyc02g070530.4.1、Solyc05g050360.3.1、Solyc09g007840.3.1、Solyc11g069580.2.1，在响应番茄灰霉病菌、致病疫霉病菌侵染的过程中被诱导。通过结构预测、Ca2+结合特征预测也发现上述4个蛋白可以形成Ca2+通道，分别通过残基苏氨酸、缬氨酸、谷氨酰胺与Ca2+结合。以上结果表明，联合新型人工智能工具AlphaFold3鉴定的番茄CNGC家族蛋白Solyc02g070530.4.1、Solyc05g050360.3.1、Solyc09g007840.3.1、Solyc11g069580.2.1具有钙离子通道特征，能在番茄受到灰霉侵染的过程中产生特异性响应。研究结果为探明番茄CNGC家族的基因功能提供了参考，并提供了一种全新的CNGC家族鉴定方法，为番茄抗病遗传改良研究奠定基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2025-05-17
基金项目：江苏省徐州市贾汪区设施蔬菜产业科技服务项目(编号：KC23139)。
作者简介：陶佩琳(1984—)，女，江苏南通人，博士，副教授，主要从事园艺植物生产、抗病种质创制等研究。E-mail：xswtpl@126.com。
更新日期/Last Update: 2026-01-20