[1]王新亮,彭玲,王健,等.盐碱胁迫下平邑甜茶的转录组分析[J].江苏农业科学,2022,50(22):29-37.
　Wang Xinliang,et al.Transcriptome analysis of Malus hupehensis Rehd. under saline-alkali stress[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(22):29-37.
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盐碱胁迫下平邑甜茶的转录组分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第50卷
期数:
2022年第22期
页码:
29-37
栏目:
“转录组学”专栏
出版日期:
2022-11-20

文章信息/Info

Title:
Transcriptome analysis of Malus hupehensis Rehd. under saline-alkali stress
作者:
王新亮1; 2; 彭玲2; 王健1; 贾晶晶1; 唐立平1
1.滨州学院学报编辑部，山东滨州 256603； 2.滨州学院山东省黄河三角洲生态环境重点实验室，山东滨州 256603
Author(s):
Wang Xinliang; et al
关键词:
平邑甜茶; 盐碱胁迫; 转录组; 基因表达; 胁迫响应
Keywords:
-
分类号:
S661.101
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为了解平邑甜茶对盐碱胁迫的响应机制，利用RNA-seq技术检测了盐碱胁迫下其幼苗的基因表达水平。结果显示，每个样品平均产出6.48 Gb数据，43.82×106 个原始数据；纯净数据为42.71×106～43.44×106个，表达的基因数为 41 008，其中已知的基因为38 465个，预测的新基因为2 543个。基因表达量聚类分析显示，根和叶中的基因分别聚类成12 个基因簇，并对根中基因簇1、7、9、10、11以及叶中基因簇4、7、8、10进行了GO和KEGG 富集分析。GO富集分析结果显示，生物过程中的基因主要富集于细胞过程和代谢过程中，细胞组分中的基因主要富集于膜、膜部分、细胞和细胞器中，分子功能中的基因主要富集于结合和催化活性中；KEGG富集分析显示，根和叶中富集基因较多的途径有内质网内蛋白质加工、碳代谢、氨基酸的生物合成、核糖体、RNA转运、植物激素信号转导等。进一步分析表明，叶绿素a/b结合蛋白、查尔酮合成酶、查尔酮-黄酮异构酶、热休克蛋白、转录因子、细胞色素P450蛋白和未知蛋白等编码基因参与了平邑甜茶对盐碱胁迫的响应，并发挥了重要的调节作用。本研究有助于进一步了解平邑甜茶对混合耐盐碱胁迫响应的分子机制，为今后苹果砧木抗盐碱分子育种提供参考。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-11-08
基金项目：滨州学院博士学位人员及具有硕士学位的高级职称人员科研启动费项目(编号：2019Y36)。
作者简介：王新亮 (1983—)，男，山东宁津人，博士，高级工程师，主要从事果树抗逆及氮素吸收利用研究。E-mail：wiln1@163.com。
更新日期/Last Update: 2022-11-20