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[1]陈盖,温可馨,司冰.盐胁迫下园林植物彩叶树响应菌根共生的比较转录组分析[J].江苏农业科学,2022,50(22):19-28.
　Chen Gai,et al.Transcriptome analysis of garden plant coleus in response to mycorrhizal symbiosis under salt stress[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2022,50(22):19-28.
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盐胁迫下园林植物彩叶树响应菌根共生的比较转录组分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第50卷
期数:
2022年第22期
页码:
19-28
栏目:
“转录组学”专栏
出版日期:
2022-11-20

文章信息/Info

Title:
Transcriptome analysis of garden plant coleus in response to mycorrhizal symbiosis under salt stress
作者:
陈盖1; 温可馨2; 司冰2
1.唐山工业职业技术学院，河北唐山 063299； 2.渭南职业技术学院，陕西渭南 714026
Author(s):
Chen Gai; et al
关键词:
丛枝菌根真菌; 彩叶树; 鸡爪槭; 差异基因(DEGs); 盐胁迫; 转录组
Keywords:
-
分类号:
S687.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
土壤盐分是典型的非生物胁迫因素之一，严重影响着植物的生长发育。为了解盐胁迫下鸡爪槭(Acer palmatum)对接种丛枝菌根真菌的应答分子机制，对接种丛枝菌根处理(AM)、盐胁迫处理(SS)、盐胁迫接种丛枝菌根处理(AS)及对照处理(CK)进行转录组测序分析。结果表明，基于转录组测序技术(RNA-Seq)测序共获得4 672个新基因；将SS与AS处理进行比较时，鉴定出455个差异表达基因(DEGs)，其中286个基因上调表达，169个基因下调表达。对获得的DEGs进行功能注释及富集分析，GO(gene ontology)分析结果表明，盐胁迫下接种丛枝菌根真菌涉及蛋白质生物合成相关过程、ATP生物合成过程、蛋白质谷胱甘肽化、细胞分化调控、氮同化相关过程、呼吸电子传递链以及类胡萝卜素代谢等生物过程。KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)富集分析结果表明，主要涉及苯丙烷、黄酮类、二芳基庚烷类及姜酚的次生代谢通路。综合GO、KEGG富集分析结果可知，这些基因主要参与植物细胞内部环境的改善、氮代谢相关过程和宿主光保护机制。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证表明，挑选的6个DEGs表达趋势与测序结果高度一致，说明测序结果准确可靠。本研究丰富了丛枝菌根真菌对盐胁迫的改善机制，可为后续研究功能分析的耐盐候选基因提供理论依据。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2021-12-15
基金项目：陕西省教育厅专项科学研究计划(编号：20JK0639)。
作者简介：陈盖(1990—)，男，河北唐山人，硕士，讲师，研究方向为园林生物技术。E-mail：7153267620@qq.com。
更新日期/Last Update: 2022-11-20