[1]龚意辉,谢雪阳,魏媛媛,等.金冠8-18油桃叶绿体全基因组序列特征及其系统发育[J].江苏农业科学,2023,51(19):30-36.
　Gong Yihui,et al.Characterization and phylogenetic analysis of complete chloroplast genome of Prunus persica var. nectarinacultivar Jinguan 8-18[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2023,51(19):30-36.
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金冠8-18油桃叶绿体全基因组序列特征及其系统发育()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第51卷
期数:
2023年第19期
页码:
30-36
栏目:
生物技术
出版日期:
2023-10-05

文章信息/Info

Title:
Characterization and phylogenetic analysis of complete chloroplast genome of Prunus persica var. nectarinacultivar Jinguan 8-18
作者:
龚意辉; 谢雪阳; 魏媛媛; 周桂花; 李丽梅; 曾永贤
湖南人文科技学院农业与生物技术学院，湖南娄底 417000
Author(s):
Gong Yihui; et al
关键词:
油桃; 叶绿体基因组; 组装; SSR位点; 系统发育
Keywords:
-
分类号:
S662.101
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
以金冠8-18油桃为试材，利用 Illumina NovaSeq 6000 测定金冠8-18的 DNA 序列，采用 SPAdes v3.10.1软件组装叶绿体基因组，以桃树叶绿体基因组(MZ673795.1)为参考序列，对金冠8-18叶绿体基因组序列特征及其系统发育地位进行研究。结果表明：金冠8-18叶绿体基因组长度为153 754 bp，包括大单拷贝区(LSC，85 923 bp)，小单拷贝区(SSC，19 100 bp)以及2个反向重复序列(IR，26 381 bp)，AT和GC总含量分别为63.23%、36.77%。共在金冠8-18叶绿体基因组中注释到 133 个基因，其中含编码基因(CDS)、转运RNA 基因、核糖体RNA基因、假基因数分别为84、37、8、4个。按照功能分类将基因分成 4类：光合作用相关基因共44个、自我复制相关基因共58个、其他基因共5个、未知功能基因6个，其中含1个和2个内含子的基因数分别为14、3个。共鉴定出251个 SSR 位点，包括 158个单核苷酸重复位点，93个复合核苷酸重复位点。系统发育分析表明：金冠8-18与桃树(MH169125.1)的亲缘关系最近。本研究丰富了金冠8-18遗传资源信息，为油桃品种鉴定、遗传育种和系统发育研究提供了分子依据和理论支撑。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2022-12-06
基金项目：湖南省科技特派员服务乡村振兴项目(编号：2022NK4218)；湘潭市农业科学研究所横向项目(编号：380220590112)。
作者简介：龚意辉(1988—)，男，湖南涟源人，博士，从事果实分子生物学方向研究。E-mail：gyhzgh@163.com。
通信作者：曾永贤，高级农艺师，从事果蔬分子生物学方向研究。E-mail：1123346336@qq.com。
更新日期/Last Update: 2023-10-05