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[1]李瑞瑞,张子晓,赵振华,等.gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析[J].江苏农业科学,2024,52(5):64-69.
　Li Ruirui,et al.Tissue-specific expression of gga-miR-26a and predictive analysis of its target genes[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2024,52(5):64-69.
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gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第52卷
期数:
2024年第5期
页码:
64-69
栏目:
生物技术
出版日期:
2024-03-05

文章信息/Info

Title:
Tissue-specific expression of gga-miR-26a and predictive analysis of its target genes
作者:
李瑞瑞1; 2; 张子晓3; 赵振华1; 韩威1; 向海2; 王钱保2; 黄正洋2; 李春苗2; 宗毅2; 黄华云1
1.江苏省家禽科学研究所，江苏扬州225125； 2.佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种重点实验室，广东佛山528225； 3.河北科技师范大学，河北秦皇岛066600
Author(s):
Li Ruirui; et al
关键词:
gga-miR-26a; 鸡; 表达特性; 靶基因
Keywords:
-
分类号:
S831.2
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为初步阐明gga-miR-26a在鸡脂肪沉积中的作用，以矮小品系S3系(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材，采用实时荧光定量PCR法检测gga-miR-26a在2个品种不同生长发育时期肝脏、腹脂及腿肌组织，腹脂和肌内脂肪细胞增殖期和分化期的表达变化，并利用生物信息学的方法，对gga-miR-26a靶基因进行预测和分析。结果表明，gga-miR-26a在S3系鸡(DW)和隐性白羽鸡(RR)16 W时肝脏组织中的表达存在显著的品种差异，S3系鸡在5个发育阶段表达均高于隐性白羽鸡；腹脂组织中，gga-miR-26a在0 W时存在极显著的品种差异(P＜0.01)且显著高于其他周龄；gga-miR-26a在腿肌组织中的表达无显著的品种差异(P>0.05)；在脂肪细胞中，gga-miR-26a在分化4 d的表达显著高于增殖期(P<0.05)。利用TargetScan、miRDB、miRmap等3个软件对gga-miR-26a靶基因进行预测，共预测到163个交集靶基因；GO及KEGG分析提示gga-miR-26a可能通过靶向调节PTEN、ULK2和PRKCD的表达，进而调控鸡的脂肪沉积。综上所述，gga-miR-26a在2个品种鸡脂肪相关组织及脂肪细胞中均有表达，且具有显著的品种差异；gga-miR-26a参与了鸡的脂肪沉积过程，PTEN、ULK2和PRKCD可能是gga-miR-26a调控脂肪沉积的预测靶基因。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2023-04-14
基金项目：现代农业产业技术体系建设专项(编号：CARS-41-Z05)；江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目［编号：JBGS(2021)109、JBGS(2021)029］；国家家养动物种质库建设项目(编号：2023)；国家自然科学基金(编号：32102538)。
作者简介：李瑞瑞(1998—)，女，山东泰安人，硕士，从事家禽遗传育种研究。E-mail：liruirui117@163.com。
通信作者：黄华云，博士，副研究员，主要从事家禽遗传育种研究。E-mail：huanghuayun520@163.com。
更新日期/Last Update: 2024-03-05