[1]吴瑶,李丹丹,龙添添,等.红花R2R3-MYB转录因子家族鉴定及组织表达分析[J].江苏农业科学,2025,53(9):15-24.
　Wu Yao,et al.Identification and tissue expression analysis of the R2R3-MYB transcription factor family in safflower[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2025,53(9):15-24.
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红花R2R3-MYB转录因子家族鉴定及组织表达分析()

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第53卷
期数:
2025年第9期
页码:
15-24
栏目:
生物技术
出版日期:
2025-05-05

文章信息/Info

Title:
Identification and tissue expression analysis of the R2R3-MYB transcription factor family in safflower
作者:
吴瑶1; 李丹丹1; 2; 龙添添1; 李开杰1; 余浪1
1.贵州大学农学院，贵州贵阳 550025； 2.贵州省药用植物繁育与种植重点实验室，贵州贵阳 550025
Author(s):
Wu Yao; et al
关键词:
红花; R2R3-MYB转录因子; 生物信息分析; 组织表达
Keywords:
-
分类号:
S567.21+9.01
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
筛选红花(Carthamus tinctorius)在各组织中优势表达的候选MYB基因，以红花基因组测序数据为基础，鉴定红花中MYB转录因子，并分析其理化性质、系统发育、保守基序、二级结构及分析MYB基因在红花5个不同组织部位表达模式。共鉴定到108个红花R2R3-MYB基因，蛋白氨基酸数目为163~996个，理论等电点在4.52~9.55之间，不稳定指数为35.51~76.26，亲水系数为-1.131~-0.448，蛋白相对分子质量为6 092.20~110 047.15 u，所有蛋白均为亲水性蛋白；蛋白二级结构分析发现红花R2R3-MYB蛋白主要由α-螺旋和无规则卷曲构成；通过将其与拟南芥MYB构建系统进化树，发现有91个红花R2R3-MYB转录因子聚类于22个拟南芥R2R3-MYB亚组中，17个红花R2R3-MYB转录因子聚类于2个C亚组中。基于转录组数据的组织表达模式分析筛选在根、茎、叶、花及种子不同组织中优势高表达的MYB基因，发现在根、花及种子中优势表达的MYB基因数目较多，花中特异高表达的R2R3-MYB基因有13个，其中CtMYB6和CtMYB19分别与拟南芥具有调节花青素合成功能的位于S6和S7亚组的基因聚为一类，预测其为参与红花花中有效成分红花黄色素累积的重要候选基因。本研究对红花R2R3-MYB转录因子家族进行了系统鉴定及组织表达谱分析，为后续红花MYB转录因子调节次生代谢成分累积等功能研究奠定基础。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2024-03-27
基金项目：贵州省科技计划(编号：黔科合基-ZK［2022］一般064)；国家重点研发计划(编号：2021YFD1601001)；贵州省粮油作物分子育种重点实验室项目(编号：黔科合中引地［2023］008)；贵州省高等学校功能农业重点实验室项目(编号：黔教技［2023］007号)。
作者简介：吴瑶(1998—)，女，贵州铜仁人，硕士研究生，主要从事药用植物资源评价与利用研究。E-mail：1908048578@qq.com。
通信作者：李丹丹，博士，讲师，主要从事药用植物资源评价与利用研究。E-mail：ddli3@gzu.edu.cn。
更新日期/Last Update: 2025-05-05