|本期目录/Table of Contents|

[1]刘娜,李梦臻.DNA条形码技术在病原真菌分类鉴定中的应用[J].江苏农业科学,2015,43(03):10-12.
　Liu Na,et al.Application of DNA barcode technology in taxonomic identification of pathogenic fungi[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(03):10-12.
点击复制

DNA条形码技术在病原真菌分类鉴定中的应用(PDF)
分享到：

《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第43卷
期数:
2015年03期
页码:
10-12
栏目:
专论
出版日期:
2015-03-25

文章信息/Info

Title:
Application of DNA barcode technology in taxonomic identification of pathogenic fungi
作者:
刘娜;  李梦臻
河南工业大学，河南郑州 450001
Author(s):
Liu Na; et al
关键词:
DNA条形码; 病原真菌; 分类鉴定
Keywords:
-
分类号:
Q949.32；S432.4+4
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
病原真菌是一种具有致病性的真菌，对植物有极大的危害。DNA条形码技术是通过对足够变异、短、能够作为标准目的基因的DNA序列进行分析，并进一步对未知物种进行快速、高效地分类和鉴定或者发现新物种的一项新技术。在介绍DNA条形码技术概况的基础上，对DNA条形码技术在病原真菌分类鉴定中的应用前景进行展望，以推进我国病原真菌DNA条形码在相关研究和应用领域的发展。
Abstract:
-

参考文献/References:

［1］杨祝良. 基因组学时代的真菌分类学：机遇与挑战［J］. 菌物学报，2013，32(6)：931-946.
［2］吴绍熙，郭宁如. 真菌的分子生物学［J］. 中国真菌学杂志，2007，2(4)：231-239，242.
［3］高山，王孟飞，胡平，等. 基于ITS序列对万寿菊叶斑病病原菌的分子鉴定［J］. 湖北农业科学，2013，52(9)：2074-2076.
［4］李斌，盛鸥，李春雨，等. 香蕉枯萎病病原菌的研究进展［J］. 分子植物育种，2013，11(5)：638-646.
［5］Seifert K A，Samson R A，Dewaard J R，et al. Prospects for fungus identification using CO1 DNA barcodes，with Penicillium as a test case［J］. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，2007，104(10)：3901-3906.
［6］吴清平，黄龙花，杨小兵，等. 核酸序列分析在真菌分类鉴定中的应用［J］. 中国卫生检验杂志，2009，19(4)：959-961.
［7］郑雪芳，蓝江林，曹宜，等. 瓜类作物枯萎病病原菌的分类鉴定及其ITS序列差异性分析［J］. 中国农业科学，2008，41(12)：4077-4084.
［8］朱桂宁，蔡健和，胡春锦，等. 广西山药炭疽病病原菌的鉴定与ITS序列分析［J］. 植物病理学报，2007，37(6)：572-577.
［9］白树猛，田黎. ITS序列分析在真菌分类鉴定和分子检测中的应用［J］. 畜牧与饲料科学，2009，30(1)：52-53，189.
［10］齐慧霞，李双民，余金咏，等. 八仙花炭疽病病原菌鉴定及其生物学特性［J］. 经济林研究，2008，26(3)：84-87.
［11］Hebert P D N，Cywinska A，Ball S L，et al. Biological identifications through DNA barcodes［J］. Biological Sciences，2003，270(1512)：313-321.
［12］李立平，罗玉萍，李思光. 真菌非编码RNA［J］. 微生物学报，2013，53(8)：790-797.
［13］武宇鹏，丁亮，李捷，等. DNA条形码的应用进展及讨论［J］. 环境昆虫学报，2011，33(1)：99-106.
［14］杨耀华. DNA条形码技术的应用进展［J］. 中国医药指南，2013，11(17)：484-485.
［15］Gregory T R. DNA barcoding does not compete with taxonomy［J］. Nature，2005，434：1067.
［16］Velmurugan S，Prasannakumar C，Manokaran S，et al. DNA barcodes for marine fungal identification and discovery［J］. Fungal Ecology，2013，6(5)：408-418.
［17］周均亮，赵瑞琳. 真菌DNA条形码技术研究进展［J］. 微生物学通报，2013，40(8)：1468-1477.
［18］马英，鲁亮. DNA条形码技术［J］. 中国媒介生物学及控制杂志，2012，23(3)：185-190，205.
［19］Stoeckle M Y，Hebert P N. Bar code of Life：DNA tags help classify animals［J］. Scientific American，2008，299(4)：82-88.
［20］Schoch C L，Seifert K A，Huhndorf S，et al. Nuclear ribosomal internal transcribed spacer(ITS) region as a universal DNA barcode marker for fungi［J］. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，2012，109(16)：6241-6246.
［21］Eberhardt U. A constructive step towards selecting a DNA barcode for fungi［J］. New Phytologist，2010，187(2)：266-268.
［22］刘淑艳，张傲，李玉. 菌物DNA条形码技术的研究进展［J］. 华中农业大学学报，2012，31(1)：121-126.
［23］Kress W J，Wurdack K J，Zimmer E A，et al. Use of DNA barcodes to identify flowering plants［J］. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America，2005，102(23)：8369-8374.
［24］陈士林，庞晓慧，罗焜，等. 生物资源的DNA条形码技术［J］. 生命科学，2013，25(5)：459-466.
［25］闫化学，于杰. DNA条形码技术在植物中的研究现状［J］. 植物学报，2010，45(1)：102-108.
［26］Seifert K A. Progress towards DNA barcoding of fungi［J］. Molecular Ecology Resources，2009，9(1)：83-89.
［27］Min X J，Hickey D A. Assessing the effect of varying sequence length on DNA barcoding of fungi［J］. Molecular Ecology Notes，2007，7(3)：365-373.
［28］王颖，方绍庆，刘明杰，等. DNA条形码技术在媒介蝇类分子鉴定中的应用［J］. 口岸卫生控制，2013，18(3)：55-58.
［29］焦明超，赵大显，欧阳珊，等. DNA条形码技术在生物分类学中的应用前景［J］. 湖北农业科学，2011，50(5)：886-890.
［30］Nguyen H D T，Seifert K A. Description and DNA barcoding of three new species of Leohumicola from South Africa and the United States［J］. Persoonia，2008，21：57-69.
［31］Martin F N，Tooley P W. Phylogenetic relationship among Phytophthora species inferred from sequence analysis of mitochondrial encoded cytochrome oxidase Ⅰ and Ⅱ genes［J］. Mycologia，2003，95(2)：269-284.
［32］Li H C，Bouchara J P，Hsu M M，et al. Identification of dermatophytes by an oligonucleotide array［J］. Journal of Clinical Microbiology，2007，45(10)：3160-3166.
［33］Landeweert R，Leeflang P，Kuyper T W，et al. Molecular identification of ectomycorrhizal mycelium in soil horizons［J］. Applied and Environmental Microbiology，2003，69(1)：327-333.
［34］Vialle A，Feau N，Allaire M，et al. Evaluation of mitochondrial genes as DNA barcode for Basidiomycota［J］. Molecular Ecology Resources，2009，9(1)：99-113.
［35］段维军，张慧丽，郭立新，等. ITS片段作为轮枝菌DNA条形码的评价研究［J］. 植物保护，2013，39(4)：72-77，89.
［36］Bryn T M D，Maryna Y D，Jean-Marc M. Comparing CO1 and ITS as DNA barcode markers for mushrooms and allies(Agaricomycotina)［J］. Plos One，2011，6(9)：e25081.
［37］Boyanton B L，Luna R A，Fasciano L R，et al. DNA pyrosequencing based identification of pathogenic Candida species by using the internal transcribed spacer 2 region［J］. Archives of Pathology & Laboratory Medicine，2008，132(4)：667-674.
［38］Sert H B，Sümbül H，Sterflinger K. Microcolonial fungi from antique marbles in Perge/Side/Termessos (Antalya/Turkey)［J］. Antonie Van Leeuwenhoek，2007，91(3)：217-227.
［39］Feau N，Vialle A，Allaire M，et al. Fungal pathogen (mis—) identifications：a case study with DNA barcodes on Melampsora rusts of aspen and white poplar［J］. Mycological Research，2009，113(6/7)：713-724.
［40］李依韦，银玲. rDNA-ITS序列分析在植物病原真菌分类鉴定中的应用［J］. 内蒙古民族大学学报：自然科学版，2012，27(1)：66-67.
［41］陈亚辉，朱海军，生静雅，等. DNA条形码序列对不同品种美国山核桃的鉴定［J］. 江苏农业学报，2013，29(6)：1445-1450.
［42］崔志伟，王康才，郑晖，等. DNA条形码序列对不同品种金银花的鉴定［J］. 江苏农业科学，2013，41(8)：43-45.
［43］Frzal L，Leblois R. Four years of DNA barcoding：current advances and prospects［J］. Infection，Genetics and Evolution，2008，8：727-736.

相似文献/References:

[1]崔志伟,王康才,郑晖,等.DNA条形码序列对不同品种金银花的鉴定[J].江苏农业科学,2013,41(08):43.
　Cui Zhiwei,et al.Identification of different varieties of Lonicera japonica by DNA barcoding sequences[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2013,41(03):43.
[2]郭义红,孙威江,林伟东,等.植物DNA条形码鉴定研究进展[J].江苏农业科学,2016,44(07):19.
　Guo Yihong,et al.Research progress of plant Identification by DNA barcoding[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(03):19.
[3]郝莉花,董彩文,陈春生,等.红枣贮藏期间主要病原真菌的分离、鉴定与ITS序列分析[J].江苏农业科学,2016,44(02):304.
　Hao Lihua,et al.Isolation， identification and ITS sequence analysis of pathogens of dried jujube during storage[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(03):304.
[4]韩宝艳,纪明山,刘妍,等.苦参抑菌活性成分的化学结构与作用机理[J].江苏农业科学,2016,44(02):170.
　Han Baoyan,et al.Chemical structure and action mechanism of antifungal activity components isolated from Sophora flavescens[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(03):170.
[5]胡伟毅,汪连军,秦国勋,等.5种DNA条形码在苍耳属中遗传距离比较[J].江苏农业科学,2014,42(04):36.
　Hu Weiyi et al.Comparison of evolutionary distances among five DNA barcodes in Xanthium[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2014,42(03):36.
[6]周德明,艾芹,周国英.12种植物对油茶炭疽病菌和软腐病菌的抑制活性[J].江苏农业科学,2015,43(06):121.
　Zhou Deming,et al.Inhibitory activity of 12 kinds of plants to Camellia anthrax and soft rot pathogen[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2015,43(03):121.
[7]王铁军,钟万芳,朱丽梅,等.烟粉虱病原真菌的分离鉴定及生物活性初步研究[J].江苏农业科学,2016,44(11):148.
　Wang Teijun,et al.Isolation and characterization of Bemisia tabaci pathogenic fungi and its biological activity[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2016,44(03):148.
[8]唐伟,朱治任,汪财生,等.基于COⅠ基因的DNA条形码在鳖科动物鉴定上的应用[J].江苏农业科学,2017,45(06):30.
　Tang Wei,et al.Application of DNA barcode based on COⅠ gene in identification of Trionychidae species[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(03):30.
[9]魏星任,叶清莲,马新业,等.凉粉草DNA条形码通用序列的筛选及其混伪品分子鉴定[J].江苏农业科学,2017,45(13):32.
　Wei Xingren,et al.Screening of common sequence of DNA barcode of Mesona chinensis and molecular identification of its adulterant[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(03):32.
[10]刘政泽,刘博.基于ITS+matK序列探讨部分藤黄属植物的种间亲缘关系[J].江苏农业科学,2017,45(13):39.
　Liu Zhengze,et al.Study on genetic relationships of several Garcinia species(Clusiaceae) based on ITS+matK sequence[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(03):39.

备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2014-04-24
基金项目：国家自然科学基金(编号：31300015)；河南省科技厅基础与前沿项目(编号：132300410350)。
作者简介：刘娜(1978—)，女，河南周口人，博士，副教授，主要从事真菌分子系统学研究。E-mail：liuna3456@163.com。
更新日期/Last Update: 2015-03-25