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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:

第43卷

期数:

2015年04期

页码:

21-24

栏目:

生物技术

出版日期:

2015-04-25

文章信息/Info

Title:

Optimization and testing for ISSR system of aromatic rice by orthogonal design

作者:

徐君;  刘凤军;  张国芹;  徐瑶;  谢裕林;  陈培峰; 王建平;  乔中英;  黄萌;  朱勇良

江苏太湖地区农业科学研究所，江苏苏州 215155

Author(s):

Xu Jun; et al

关键词:

香稻; ISSR-PCR; 正交优化

Keywords:

-

分类号:

S511.03

DOI:

-

文献标志码:

A

摘要:

利用正交试验设计，从Taq酶、Mg²⁺、模板DNA、dNTP、引物5种因素的4个水平对香稻不育系的ISSR-PCR反应体系进行优化，确立适合香稻的ISSR-PCR反应体系：1.0 U Taq酶、2.5 mmol/L Mg²⁺、40 ng模板DNA、0.25 mmol/L dNTP、0.1 μmol/L引物浓度。进一步验证试验表明，在该体系下将筛选的13个ISSR引物对15个香稻不育系进行PCR扩增，均可获得稳定、清晰的条带。

Abstract:

-

参考文献/References:

［1］方宣钧，吴为人，唐纪良. 作物DNA标记辅助育种［M］. 北京：科学出版社，2001.
［2］何予卿，张宇，孙梅，等. 利用ISSR分子标记研究栽培稻和野生稻亲缘关系［J］. 农业生物技术学报，2001，9(2)：123-127.
［3］钱韦，葛颂，洪德元. 采用RAPD和ISSR标记探讨中国疣粒野生稻的遗传多样性［J］. 植物学报，2000，42(7)：741-750.
［4］李进波，牟同敏，方宣钧.12个水稻光温敏核不育系的ISSR标记鉴定及遗传分析［J］. 中国农学通报，2002，18(1)：6-9.
［5］朱勇良，谢裕林，黄凌哲，等. 太湖稻区及国内部分香稻SSR指纹图谱构建及遗传多样性初析［J］. 植物遗传资源学报，2012，13(4)：666-671.
［6］陈兆贵，邓汉超，赵淑平. 47份水稻品种资源的ISSR遗传多样性分析［J］. 基因组学与应用生物学，2009，28(3)：498-502.
［7］李进波，牟同敏，夏建武，等. 利用微卫星标记鉴定两系杂交稻两优培胜的种子纯度［J］. 中国农学通报，2002，18(6)：10-13.
［8］李雪，韩曙，杨正安，等. 大蒜ISSR-PCR反应体系的正交优化建立［J］. 中国农学通报，2013，29(10)：126-131.
［9］Doyle J J. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue［J］. Phytochemical Bulletin，1987，9(1)：11-15.
［10］孙清信，陈坚，张辉，等. 紫云英ISSR引物的筛选及PCR反应体系的优化［J］. 植物遗传资源学报，2012，13(5)：870-878.
［11］王彦华，侯喜林，徐明宇. 正交设计优化不结球白菜ISSR反应体系研究［J］. 西北植物学报，2004，24(5)：899-902.
［12］杨金花，秦瑞云，付庆云，等.菠菜ISSR-PCR体系的建立与优化［J］.江苏农业科学，2013，41(2)：36-38.

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[1]思彬彬,张靠稳,孟北乾.雌根结线虫DNA的提取方法[J].江苏农业科学,2013,41(06):27.
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[10]林彦均,杨天燕,朱岚倩,等.龙头鱼ISSR-PCR多态性引物最佳退火温度的筛选[J].江苏农业科学,2020,48(8):70.
　Lin Yanjun,et al.Screening of optimum annealing temperature for ISSR-PCR polymorphism primers in Harpadon nehereus[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2020,48(04):70.

备注/Memo

备注/Memo:

收稿日期：2014-05-28
基金项目：江苏省自然科学基金(编号：BK2010207)；江苏省苏州市应用基础项目(编号：YJG0902)。
作者简介：徐君(1982—)，男，江苏苏州人，硕士，助理研究员，研究方向为植物细胞工程。Tel：(0512)65386213；E-mail：flyforever007@163.com。
通信作者：朱勇良，副研究员，研究方向为水稻遗传育种和生态安全标准化栽培。Tel：(0512)65386213；E-mail：thszyl@126.com。

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更新日期/Last Update: 2015-04-25