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[1]刘蕾,宋佳,王辉.甘蓝硫苷生物合成相关基因FMOGS-OXS的预测与分析[J].江苏农业科学,2017,45(11):22-25.
　Liu Lei,et al.Prediction and analysis of glucosinolate biosynthesis related genes FMOGS-OXS in cabbage (Brassica oleracea L.)[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(11):22-25.
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甘蓝硫苷生物合成相关基因FMOGS-OXS的预测与分析(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第45卷
期数:
2017年11期
页码:
22-25
栏目:
生物技术
出版日期:
2017-06-05

文章信息/Info

Title:
Prediction and analysis of glucosinolate biosynthesis related genes FMOGS-OXS in cabbage (Brassica oleracea L.)
作者:
刘蕾;  宋佳;  王辉
青岛农业大学园艺学院/青岛市遗传改良与育种重点实验室，山东青岛 266109
Author(s):
Liu Lei; et al
关键词:
十字花科; 甘蓝; 硫代葡萄糖苷; FMOGS-OX基因
Keywords:
-
分类号:
S635.03
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
以拟南芥中控制硫苷生物合成相关基因家族FMOGS-OX位点基因全长编码区及蛋白为参考序列，在甘蓝(Brassica oleraceae L.)基因组数据库中进行Blastn和Blastp检索，得到具备Score≥100、E值≤10-10、coverage ≥70%条件的甘蓝注释基因作为候选拟南芥FMOGS-OX的同源基因，并进一步进行同源性比较、基因结构比较及序列聚类分析。结果显示，在甘蓝中发现3个旁系同源基因Bol010993、Bol029100、Bol031350。甘蓝和拟南芥FMOGS-OX同源基因之间在核酸水平上的相似性为69.4%~83.0%；甘蓝3个FMOGS-OX旁系同源基因间的相似性保持在70.0%~840%。甘蓝Bol010993与拟南芥FMOGS-OX1~FMOGS-OX4的结构较为相似，而Bol029100、Bol031350与拟南芥FMOGS-OX5的结构较相似。系统进化分析及共线性分析初步确定，甘蓝中分别存在1个FMOGS-OX2(Bol010993)和2个FMOGS-OX5(Bol029100、Bol031350)基因。
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期：2015-12-11
基金项目：山东省青岛市应用基础研究计划项目(编号：14-2-4-112-jch)。
作者简介：刘蕾(1991—)，女，山东沂水人，硕士研究生，主要从事蔬菜遗传育种及生物技术研究。E-mail：491504222@qq.com。
通信作者：王辉，博士，讲师，主要从事蔬菜遗传育种及生物技术研究。E-mail：fromstick@163.com。
更新日期/Last Update: 2017-06-05