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[1]林丽,陈泽斌,何群香,等.烟草不同部位内生细菌的多样性[J].江苏农业科学,2017,45(22):274-278.
 Lin Li,et al.Endophytic bacteria diversity in different parts of tobacco[J].Jiangsu Agricultural Sciences,2017,45(22):274-278.
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烟草不同部位内生细菌的多样性(PDF)
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《江苏农业科学》[ISSN:1002-1302/CN:32-1214/S]

卷:
第45卷
期数:
2017年22期
页码:
274-278
栏目:
资源与环境
出版日期:
2017-11-20

文章信息/Info

Title:
Endophytic bacteria diversity in different parts of tobacco
作者:
林丽12 陈泽斌12 何群香1 徐松萍1 华金珠12 黄丽12 徐胜光2
1.昆明学院,云南昆明 650214; 2.云南省高校生物炭工程研究中心,云南昆明 650214
Author(s):
Lin Liet al
关键词:
烟草营养器官内生细菌组成多样性分布规律生物信息学宿主优势菌基因工程菌
Keywords:
-
分类号:
S572.01;Q939.92
DOI:
-
文献标志码:
A
摘要:
为了揭示烟草不同器官中内生细菌的分布规律,应用Illumina测序平台的MiSeq高通量测序仪对烟草根、茎、叶中内生细菌的16S rDNA-V4区扩增子进行测序,对测得数据进行生物信息学分析,评价物种α多样性和β多样性。经FLASH软件对序列进行拼接,茎、叶、根样品分别获得36 129、60 312、52 573条原始序列,经Qiime软件过滤,再剔除宿主的叶绿体和线粒体序列,最终分别得到35 190、58 938、51 268条有效序列,在97%的序列相似性水平上,这些有效序列被Upars
Abstract:
-

参考文献/References:

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备注/Memo

备注/Memo:
收稿日期:2017-03-24
基金项目:国家自然科学基金(编号:41361056);云南省教育厅科学研究项目(编号:2016ZDX096、2014Y390);昆明学院“人才引进”项目(编号:YJL14005);云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目(编号:05000511311);云南省特色生物资源开发与利用重点实验室开放基金(编号:GXKJ201621)。
作者简介:林丽(1976—),女,云南水富人,硕士,讲师,主要从事植物保护的教学及科研工作。E-mail:llysj4809@163.com。
通信作者:徐胜光,博士,研究员,主要从事污染生态的生物炭修复技术开发及产业化方向。E-mail:sgxu2011@126.com。
更新日期/Last Update: 2017-11-20